Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Olfr406-202ENSMUST00000214303 2842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm10650-202ENSMUST00000196581 1969 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Sestd1-202ENSMUST00000102660 8990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Rsrc2-203ENSMUST00000111515 4223 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Rnf219-201ENSMUST00000022716 3420 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm37474-201ENSMUST00000194812 1814 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm44735-201ENSMUST00000206197 1752 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Unc13c-202ENSMUST00000184666 8796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Ank3-240ENSMUST00000183169 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Mfap3-203ENSMUST00000108849 4827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 B3gnt5-203ENSMUST00000121344 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Erc2-208ENSMUST00000210924 4871 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm12057-201ENSMUST00000117244 1427 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r198-204ENSMUST00000227167 5990 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Tulp4-201ENSMUST00000039655 9687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Obox3-201ENSMUST00000086122 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Pcdh11x-203ENSMUST00000113364 4454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Ighv8-12-201ENSMUST00000103540 315 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Traj18-201ENSMUST00000103723 66 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm25795-201ENSMUST00000104421 132 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm8279-201ENSMUST00000112767 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Dynlt1-ps1-201ENSMUST00000117045 342 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm13114-201ENSMUST00000117605 106 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 A730017C20Rik-203ENSMUST00000118510 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm15040-201ENSMUST00000118561 1241 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm11624-201ENSMUST00000118579 1041 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm12307-201ENSMUST00000120581 590 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm6067-201ENSMUST00000121648 491 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Olfr349-ps1-201ENSMUST00000121879 609 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Med9os-202ENSMUST00000139794 446 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Snora47-201ENSMUST00000157483 138 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm3127-201ENSMUST00000167839 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm15257-201ENSMUST00000177680 883 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm15252-201ENSMUST00000177750 883 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm15256-201ENSMUST00000177793 883 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm17048-201ENSMUST00000179266 847 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm15260-201ENSMUST00000179402 883 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm28064-201ENSMUST00000185639 858 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 4933436F18Rik-201ENSMUST00000193468 802 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm37177-201ENSMUST00000193768 417 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm37358-201ENSMUST00000195492 479 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm5886-202ENSMUST00000203957 522 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm5065-202ENSMUST00000207531 807 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm34350-201ENSMUST00000208898 481 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 4930542C16Rik-203ENSMUST00000212108 1207 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm7570-201ENSMUST00000215246 698 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 AC154904.1-201ENSMUST00000219510 312 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Olfr726-201ENSMUST00000072370 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Olfr275-201ENSMUST00000095085 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Cse1l-210ENSMUST00000168599 2748 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Hspa13-202ENSMUST00000114244 2674 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Trhr-201ENSMUST00000038856 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Mug4-ps-201ENSMUST00000203118 3578 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 C630031E19Rik-201ENSMUST00000218114 3059 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Cyld-206ENSMUST00000209559 4476 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Specc1-217ENSMUST00000202905 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gbp2b-201ENSMUST00000029936 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Olfr303-205ENSMUST00000216409 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Ttll6-202ENSMUST00000167258 3205 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm35439-201ENSMUST00000200051 4809 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Olfr1348-209ENSMUST00000213549 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 2500004C02Rik-202ENSMUST00000128026 1898 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Zfp933-201ENSMUST00000105718 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm8126-201ENSMUST00000169587 1764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Itih4-204ENSMUST00000168782 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Mcf2-201ENSMUST00000033478 3659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Cyp4a10-201ENSMUST00000058785 2109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Grik2-207ENSMUST00000218823 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm42873-201ENSMUST00000196110 1726 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm11242-201ENSMUST00000120103 2457 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Dcdc5-202ENSMUST00000122388 4957 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Trbv4-201ENSMUST00000103265 393 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
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Atg4aQ8C9S8 Apoa2-204ENSMUST00000111321 518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm14842-201ENSMUST00000119577 269 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Fam229b-205ENSMUST00000135785 674 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm16102-201ENSMUST00000160955 420 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm18191-201ENSMUST00000174624 824 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Lemd1-209ENSMUST00000191418 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm37463-201ENSMUST00000193819 796 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm43126-201ENSMUST00000201546 429 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm30708-201ENSMUST00000202183 312 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm34263-202ENSMUST00000214353 303 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 CT033781.1-201ENSMUST00000223128 454 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 AC163664.2-201ENSMUST00000228894 459 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Mmp12-202ENSMUST00000065079 1185 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Olfr1387-201ENSMUST00000073824 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Tmprss15-201ENSMUST00000023566 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Mybpc1-202ENSMUST00000121629 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r45-204ENSMUST00000227426 3205 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Cfap70-201ENSMUST00000022348 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r90-203ENSMUST00000226510 6674 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Mapk10-201ENSMUST00000086854 6630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm26608-202ENSMUST00000181503 1362 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Olfr734-203ENSMUST00000217152 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Smarca2-203ENSMUST00000112637 1962 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Ncoa7-208ENSMUST00000215926 2875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
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