Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Gm14613-201ENSMUST00000122239 752 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Mup9-204ENSMUST00000122381 864 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm2966-201ENSMUST00000166052 481 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm17204-201ENSMUST00000167936 478 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm20475-201ENSMUST00000174884 263 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Mir5112-201ENSMUST00000174897 60 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Vmn1r-ps23-201ENSMUST00000175708 295 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm26570-201ENSMUST00000180672 342 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 D630011A20Rik-201ENSMUST00000180858 500 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Rpl31-ps16-201ENSMUST00000181130 376 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm29353-201ENSMUST00000185801 620 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm28619-201ENSMUST00000185889 622 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm28426-201ENSMUST00000187385 620 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Frmd8os-202ENSMUST00000187697 516 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm28583-201ENSMUST00000188903 2141 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm4035-201ENSMUST00000189445 399 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm38326-201ENSMUST00000194030 686 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm43765-201ENSMUST00000196303 893 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Rrh-205ENSMUST00000196902 1250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm35570-201ENSMUST00000198730 681 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm42857-201ENSMUST00000200823 339 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 U90926-202ENSMUST00000201332 524 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm36840-201ENSMUST00000202688 250 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 E330037G11Rik-201ENSMUST00000204295 1086 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 1700093K21Rik-201ENSMUST00000020527 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 AC166352.1-201ENSMUST00000215483 1105 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 AC165437.1-201ENSMUST00000228640 536 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 1700007K09Rik-201ENSMUST00000033146 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Ang5-201ENSMUST00000066719 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Olfr357-201ENSMUST00000069578 1092 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm15500-201ENSMUST00000071523 894 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Mup20-201ENSMUST00000074018 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 1700034E13Rik-201ENSMUST00000091904 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Mup18-201ENSMUST00000098040 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Mup11-202ENSMUST00000098046 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Mup10-201ENSMUST00000098047 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Olfr1160-201ENSMUST00000099839 960 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 AC158388.2-201ENSMUST00000223665 1314 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Uba1y-202ENSMUST00000190013 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Nr2c1-203ENSMUST00000105290 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Cytip-201ENSMUST00000028175 6110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Ubxn7-201ENSMUST00000115151 10318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm2223-201ENSMUST00000112099 1350 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Irgm2-203ENSMUST00000209079 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Klb-201ENSMUST00000031096 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 3110043O21Rik-202ENSMUST00000108126 2644 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm29824-201ENSMUST00000213183 3285 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Apobec3-203ENSMUST00000165537 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm28928-201ENSMUST00000187286 1443 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm6011-201ENSMUST00000211736 1796 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm43880-201ENSMUST00000203635 2162 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm42577-201ENSMUST00000201367 3211 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm6101-201ENSMUST00000195384 1867 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm38394-201ENSMUST00000179598 10156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Slco1a4-201ENSMUST00000032364 2252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 AC162181.1-201ENSMUST00000221643 3728 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Esf1-201ENSMUST00000046030 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gbp3-202ENSMUST00000106221 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Olfr303-205ENSMUST00000216409 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Ugt2b34-201ENSMUST00000031181 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Abca8b-201ENSMUST00000020948 7423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Ear1-201ENSMUST00000100691 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm13731-201ENSMUST00000117332 196 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm7700-201ENSMUST00000120273 970 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm15959-201ENSMUST00000121724 368 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 4930440I19Rik-201ENSMUST00000144728 992 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm4997-201ENSMUST00000154056 360 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Csnk2b-207ENSMUST00000174024 883 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Vmn1r-ps141-201ENSMUST00000176293 753 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 B230110C06Rik-202ENSMUST00000181936 938 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Mir6348-201ENSMUST00000183804 120 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm28503-201ENSMUST00000185966 147 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm8506-201ENSMUST00000186661 829 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Hmgn3-205ENSMUST00000187193 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm43732-201ENSMUST00000200260 511 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 BC049739-201ENSMUST00000202626 660 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Mageb16-ps2-201ENSMUST00000204513 1093 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm45715-201ENSMUST00000206991 434 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 AC140409.4-201ENSMUST00000215757 538 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm18103-201ENSMUST00000216621 779 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm4510-201ENSMUST00000218265 427 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 1700024I08Rik-202ENSMUST00000222074 407 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm9315-201ENSMUST00000222696 908 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 AC156574.2-201ENSMUST00000228023 282 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 CT009600.1-201ENSMUST00000228771 337 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Clec2d-201ENSMUST00000032260 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Skint2-201ENSMUST00000058791 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm26163-201ENSMUST00000083792 178 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Vmn1r204-201ENSMUST00000091728 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm44121-201ENSMUST00000205169 2006 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm4806-201ENSMUST00000222704 1690 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 AC154552.6-201ENSMUST00000221365 1342 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm29670-201ENSMUST00000190228 2491 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Tgfbr1-203ENSMUST00000107725 1713 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Syn3-202ENSMUST00000121789 4006 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Pgbd1-202ENSMUST00000122872 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Adgrl3-207ENSMUST00000118078 4871 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Evi5-201ENSMUST00000112642 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 9230113P08Rik-201ENSMUST00000176049 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Phc1-208ENSMUST00000160696 4213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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