Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Lipn-201ENSMUST00000025682 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gga3Q8BMI3 Gm44045-201ENSMUST00000204906 2520 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Gga3Q8BMI3 Dcx-201ENSMUST00000033642 9074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gga3Q8BMI3 Kif2a-204ENSMUST00000122233 3533 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gga3Q8BMI3 Ranbp17-201ENSMUST00000037522 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gga3Q8BMI3 4732465J04Rik-202ENSMUST00000187483 2744 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gga3Q8BMI3 Celf1-207ENSMUST00000111452 7800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gga3Q8BMI3 AC124414.1-201ENSMUST00000218033 2946 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Gga3Q8BMI3 Gm10767-201ENSMUST00000099412 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gga3Q8BMI3 Olfr54-202ENSMUST00000215409 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gga3Q8BMI3 Adgrg6-203ENSMUST00000208429 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Gm12324-201ENSMUST00000130837 3753 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Gm17491-201ENSMUST00000180411 2311 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Gm13102-201ENSMUST00000097799 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Rpgr-201ENSMUST00000044598 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Olfr1513-202ENSMUST00000215147 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Cmah-208ENSMUST00000224819 9482 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Olfr1389-203ENSMUST00000217595 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Dcdc5-202ENSMUST00000122388 4957 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Lrrc51-205ENSMUST00000106965 743 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Gm14294-201ENSMUST00000119749 751 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Gm15959-201ENSMUST00000121724 368 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 AA645442-201ENSMUST00000156020 285 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Clec4a2-204ENSMUST00000161365 918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Gm3428-202ENSMUST00000184555 416 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Gm45127-201ENSMUST00000205984 1015 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 1810014B01Rik-204ENSMUST00000218536 204 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Gm8256-203ENSMUST00000228692 591 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Olfr730-201ENSMUST00000051453 957 ntAPPRIS P2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Gml-201ENSMUST00000096400 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Gm12018-201ENSMUST00000150694 3375 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Ank3-215ENSMUST00000182269 4411 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 A230108P19Rik-201ENSMUST00000151782 2500 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Wnk1-218ENSMUST00000161512 1426 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Gm37735-201ENSMUST00000193995 1406 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Zfp2-202ENSMUST00000109129 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Gm45843-201ENSMUST00000212317 4597 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Kat7-201ENSMUST00000072621 3324 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Prom1-205ENSMUST00000165909 4089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Rfx4-203ENSMUST00000095388 3274 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 4933402E13Rik-202ENSMUST00000178085 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Gm38085-201ENSMUST00000195785 3062 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Trp63-208ENSMUST00000115310 5366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Gm37278-201ENSMUST00000191619 2872 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 9930111J21Rik2-202ENSMUST00000101295 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Cul5-202ENSMUST00000120122 5945 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Ttc41-202ENSMUST00000075632 4366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Gm6461-201ENSMUST00000120015 633 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Gm14805-201ENSMUST00000120172 340 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 4933406K04Rik-202ENSMUST00000124363 1064 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Gm22235-201ENSMUST00000157085 110 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Gm4332-201ENSMUST00000196114 346 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Anxa3-202ENSMUST00000196126 453 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Gm44442-201ENSMUST00000204298 422 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Gm45026-201ENSMUST00000205292 833 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 2200002A13Rik-201ENSMUST00000206633 709 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Gm7570-201ENSMUST00000215246 698 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 CAAA01125382.4-201ENSMUST00000217222 774 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 AC127242.4-201ENSMUST00000221242 470 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 AC156576.3-201ENSMUST00000221940 452 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 AC154838.2-201ENSMUST00000226602 747 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 AC122251.2-201ENSMUST00000227341 603 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 AC159979.1-201ENSMUST00000227927 342 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Olfr947-ps1-202ENSMUST00000214936 2168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Nxpe4-203ENSMUST00000216998 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Olfr1238-202ENSMUST00000217226 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Adam34-202ENSMUST00000212185 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Hmgn5-201ENSMUST00000033597 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Vmn1r31-203ENSMUST00000177318 2076 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Saa4-201ENSMUST00000006952 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Olfr93-203ENSMUST00000219235 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Pik3c2a-204ENSMUST00000206219 5670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Eya4-202ENSMUST00000092665 5304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Gm44215-201ENSMUST00000204910 2711 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Gm36011-201ENSMUST00000208671 2719 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Zfp317-203ENSMUST00000213725 2354 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Sis-201ENSMUST00000094190 5887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Olfr1346-203ENSMUST00000215302 4525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Morc2b-202ENSMUST00000131954 3857 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 AC144772.2-201ENSMUST00000228830 2859 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Gm23440-201ENSMUST00000104299 130 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Ccdc7b-203ENSMUST00000108745 1047 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Klrd1-202ENSMUST00000112063 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gga3Q8BMI3 Mup-ps28-201ENSMUST00000120686 289 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms