Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Gm37958-201ENSMUST00000193131 430 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Gm43712-201ENSMUST00000198020 291 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Gm6520-201ENSMUST00000200636 410 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Olfr643-202ENSMUST00000217217 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Scgb2b27-201ENSMUST00000085620 512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Pcdh15-216ENSMUST00000131724 6322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Gm37233-201ENSMUST00000192173 6263 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Lifr-207ENSMUST00000227727 2489 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Gm42866-201ENSMUST00000195919 3304 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Gm18852-201ENSMUST00000184149 3593 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Gm37738-201ENSMUST00000192396 4716 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Exoc5-207ENSMUST00000162175 12699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 9330178D15Rik-201ENSMUST00000196033 3451 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Zfp74-202ENSMUST00000108205 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Slco1a6-201ENSMUST00000111827 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Vmn1r87-204ENSMUST00000228800 1993 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Slc17a8-201ENSMUST00000020102 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Gm37082-201ENSMUST00000192629 1927 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Gm3286-203ENSMUST00000201629 1945 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 AC133076.2-201ENSMUST00000227678 3532 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Gm10220-201ENSMUST00000088236 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Gm11734-201ENSMUST00000132261 728 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Gm11376-201ENSMUST00000144541 231 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Gm13062-201ENSMUST00000151337 562 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Gm18800-202ENSMUST00000188688 1105 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Gm38343-201ENSMUST00000195786 1060 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Gm4763-202ENSMUST00000205376 807 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 AC127337.1-201ENSMUST00000220423 625 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 AC156016.5-201ENSMUST00000228742 355 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 AC123665.4-201ENSMUST00000228790 249 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Fbxw13-201ENSMUST00000061456 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Prelp-201ENSMUST00000048432 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Sp110-201ENSMUST00000093508 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Ate1-208ENSMUST00000216011 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Ggta1-202ENSMUST00000079424 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Olfr731-203ENSMUST00000214152 5572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Ubtfl1-201ENSMUST00000098973 1649 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Psd4-210ENSMUST00000166388 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Setd5-202ENSMUST00000113155 6362 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Tbc1d24-206ENSMUST00000168410 7683 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Tg-201ENSMUST00000065916 8454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Tmprss11b-201ENSMUST00000038448 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 AC140299.2-201ENSMUST00000219546 1969 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Hecw2-201ENSMUST00000087659 11171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Vmn2r11-201ENSMUST00000164875 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Mir678-201ENSMUST00000102114 84 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Fpr3-202ENSMUST00000115565 1220 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Gm13738-201ENSMUST00000122437 469 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 4933401B06Rik-201ENSMUST00000139758 1155 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Gm10603-203ENSMUST00000184875 508 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Smarca2Q6DIC0 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 1700013M08Rik-201ENSMUST00000197709 683 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Fpr3-201ENSMUST00000054871 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Olfr19-201ENSMUST00000057886 1142 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Smarca2Q6DIC0 Olfr599-201ENSMUST00000098201 1050 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Mfap3-201ENSMUST00000020830 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 C130075A20Rik-201ENSMUST00000198178 4176 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Tsc1-202ENSMUST00000113867 7682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Ctsl-205ENSMUST00000222517 6168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Smarca2Q6DIC0 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 AC110043.1-201ENSMUST00000220278 1627 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Mbd4-202ENSMUST00000122816 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Bdnf-209ENSMUST00000111050 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Gm37894-201ENSMUST00000195416 2599 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Myt1-203ENSMUST00000108757 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Smarca2Q6DIC0 Xiap-204ENSMUST00000115095 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Smarca2Q6DIC0 Ppp2r3c-201ENSMUST00000021410 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Smarca2Q6DIC0 Ktn1-213ENSMUST00000188330 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Amy2a5-201ENSMUST00000098673 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Gm13770-201ENSMUST00000117149 305 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Dnajc19-ps-201ENSMUST00000120890 351 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Gm15335-201ENSMUST00000122442 411 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 1700003H04Rik-203ENSMUST00000178485 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Prp2-202ENSMUST00000178961 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 1700120G07Rik-202ENSMUST00000190881 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 A230098N10Rik-202ENSMUST00000200055 356 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Gm32158-201ENSMUST00000200135 404 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Gm17766-201ENSMUST00000209223 442 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Gm31432-201ENSMUST00000214727 538 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 AC142227.2-201ENSMUST00000220675 400 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 D030034A15Rik-201ENSMUST00000215835 3953 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Gm37717-201ENSMUST00000192647 3027 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Mcoln3-201ENSMUST00000039450 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Abcc12-203ENSMUST00000131423 4893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Tti1-201ENSMUST00000029179 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Gm15448-202ENSMUST00000108619 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Rbmy-201ENSMUST00000100360 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Gm10256-202ENSMUST00000188114 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Gm21708-203ENSMUST00000190283 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Mre11a-202ENSMUST00000115632 5660 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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