Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Cyfip1-203ENSMUST00000163845 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Bicc1-202ENSMUST00000131445 3005 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Ranbp3l-201ENSMUST00000053308 3017 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Fbxo9-201ENSMUST00000001402 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm43775-201ENSMUST00000201019 3395 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm43092-201ENSMUST00000202986 1854 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 CT009480.2-201ENSMUST00000225152 3369 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Zfp85os-201ENSMUST00000049518 2624 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm36993-201ENSMUST00000192983 2980 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Dnaic1-201ENSMUST00000102963 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Rbm6-ps1-201ENSMUST00000186192 2870 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Dnajc8-202ENSMUST00000094657 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm42737-201ENSMUST00000201074 1755 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Ofcc1-201ENSMUST00000054635 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Adgrl3-206ENSMUST00000118034 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Pabpc4l-202ENSMUST00000192793 5252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Vmn1r31-203ENSMUST00000177318 2076 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Ifit3-201ENSMUST00000102825 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Awat1-201ENSMUST00000096361 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Vmn1r26-203ENSMUST00000228070 4419 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm5493-201ENSMUST00000182063 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 St18-201ENSMUST00000043578 5862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm26939-201ENSMUST00000177146 2261 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm44950-201ENSMUST00000206403 2296 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm45790-201ENSMUST00000211986 1629 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Olfr1348-210ENSMUST00000214383 2582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm25761-201ENSMUST00000103983 128 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
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Znf48Q3US17 Vmn1r120-201ENSMUST00000105202 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm13871-201ENSMUST00000107318 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm11757-201ENSMUST00000107320 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm11758-201ENSMUST00000107326 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm6746-201ENSMUST00000108774 483 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Sub1-202ENSMUST00000110504 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Cypt3-202ENSMUST00000112573 669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Atp5j-203ENSMUST00000114193 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm14995-201ENSMUST00000117135 391 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm14279-201ENSMUST00000117142 332 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm14056-201ENSMUST00000117198 642 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm12713-201ENSMUST00000118404 764 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm5601-201ENSMUST00000118909 972 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm15941-204ENSMUST00000135401 726 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 4930583P06Rik-201ENSMUST00000136658 706 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm6706-201ENSMUST00000145087 318 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm15642-201ENSMUST00000148057 311 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm14241-201ENSMUST00000151260 264 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm15892-201ENSMUST00000152627 439 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm24534-201ENSMUST00000157949 291 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm24847-201ENSMUST00000158032 108 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm3091-201ENSMUST00000163408 484 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Stard6-202ENSMUST00000164223 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Trav9d-4-201ENSMUST00000167409 307 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Reg3d-202ENSMUST00000167492 644 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm3208-201ENSMUST00000168281 427 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm4302-201ENSMUST00000168769 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm10074-201ENSMUST00000174543 249 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Vmn1r-ps9-201ENSMUST00000177047 358 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Mir7060-201ENSMUST00000183486 137 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm28595-201ENSMUST00000186223 437 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 1700036G14Rik-201ENSMUST00000189046 542 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 1700027A15Rik-205ENSMUST00000191122 332 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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Znf48Q3US17 Trav3n-2-201ENSMUST00000197693 334 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 4930519H02Rik-202ENSMUST00000198907 968 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Trav3d-2-201ENSMUST00000199874 334 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm43892-201ENSMUST00000204373 265 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 4930587E11Rik-202ENSMUST00000204857 807 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Klrb1b-204ENSMUST00000205130 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Reg3d-203ENSMUST00000205240 544 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
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Znf48Q3US17 A730082K24Rik-202ENSMUST00000205795 658 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
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Znf48Q3US17 Gm18903-201ENSMUST00000215343 480 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm9305-201ENSMUST00000220962 599 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 AC156576.1-201ENSMUST00000222315 500 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm46342-201ENSMUST00000223411 602 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 AC123058.1-201ENSMUST00000223748 437 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 CT030646.1-201ENSMUST00000225049 980 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Olfr967-201ENSMUST00000069561 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Chn1-201ENSMUST00000070579 1023 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Arl9-201ENSMUST00000071199 402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm10197-201ENSMUST00000086887 201 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Reg3d-201ENSMUST00000089667 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Rhox4b-201ENSMUST00000096458 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 AC122426.1-201ENSMUST00000214736 2235 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Zfp37-201ENSMUST00000068822 3494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm21292-201ENSMUST00000171947 1563 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 AC131743.4-201ENSMUST00000221638 1553 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Tnfrsf19-201ENSMUST00000111234 4051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Pfkfb1-202ENSMUST00000112713 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm32305-201ENSMUST00000221742 1899 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Olfr1065-204ENSMUST00000217586 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm340-201ENSMUST00000172371 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Meis2-206ENSMUST00000110908 3697 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm13340-201ENSMUST00000117219 1545 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
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