Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Zmiz2-203ENSMUST00000109785 3542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Ston2-203ENSMUST00000164713 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Hk1-203ENSMUST00000116238 3851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Zfat-202ENSMUST00000160248 3866 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Dhrs7b-202ENSMUST00000108718 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Hsd17b13-201ENSMUST00000048118 1708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm30292-201ENSMUST00000194198 3000 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Mlst8-201ENSMUST00000070888 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r213-204ENSMUST00000228758 5975 ntAPPRIS P2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Scn2a-205ENSMUST00000200829 6348 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 1700123J17Rik-201ENSMUST00000206035 1805 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3985-201ENSMUST00000132101 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 D3Ertd751e-208ENSMUST00000192193 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem174-201ENSMUST00000050389 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Ces3a-202ENSMUST00000093223 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Dpp6-202ENSMUST00000101471 4491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Kif13b-203ENSMUST00000224503 8865 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1349-205ENSMUST00000213504 4935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Dnajc14-201ENSMUST00000026410 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 A730085K08Rik-201ENSMUST00000177015 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Fmo5-201ENSMUST00000029729 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Snrnp200-201ENSMUST00000103220 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Trim21-202ENSMUST00000106913 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Anapc1-201ENSMUST00000014499 8942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Il6st-203ENSMUST00000183663 8678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 AC155270.1-201ENSMUST00000221626 4028 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp521-201ENSMUST00000025288 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9408-201ENSMUST00000197375 1505 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6614-201ENSMUST00000111832 1953 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr126-202ENSMUST00000213844 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn2r-ps45-201ENSMUST00000174138 2435 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44873-201ENSMUST00000208490 3428 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp454-206ENSMUST00000163301 2090 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Cops2-201ENSMUST00000028635 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Mon2-203ENSMUST00000170935 5302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Sh3pxd2b-201ENSMUST00000038753 7413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 AC061963.2-201ENSMUST00000213541 2739 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24265-201ENSMUST00000101833 141 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Igkv4-58-201ENSMUST00000103355 292 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 1700060C20Rik-201ENSMUST00000109506 605 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24482-201ENSMUST00000117005 93 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7785-201ENSMUST00000117121 892 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13458-201ENSMUST00000118239 367 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm16157-201ENSMUST00000124813 534 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm25643-201ENSMUST00000158874 103 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24369-201ENSMUST00000175387 96 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21788-201ENSMUST00000177878 543 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Gtpbp6Q3U6U5 Trav5n-4-201ENSMUST00000179997 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9364-201ENSMUST00000199220 460 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm19921-201ENSMUST00000210505 703 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45506-201ENSMUST00000211620 280 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 CAAA01216754.6-201ENSMUST00000217183 398 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Gtpbp6Q3U6U5 E230016K23Rik-201ENSMUST00000125626 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Gtpbp6Q3U6U5 Arpp21-221ENSMUST00000162065 2996 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Ugt8a-201ENSMUST00000057944 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Gtpbp6Q3U6U5 Pbdc1-201ENSMUST00000033577 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gabrb3-206ENSMUST00000196198 4348 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Gtpbp6Q3U6U5 Gprc5c-202ENSMUST00000053361 3667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp946-202ENSMUST00000120222 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29472-201ENSMUST00000188599 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21026-201ENSMUST00000218628 1345 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 AC112265.1-201ENSMUST00000213522 1501 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Spef2-205ENSMUST00000162780 1639 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Sec31a-210ENSMUST00000182886 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Sgsh-202ENSMUST00000100172 4223 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Col28a1-201ENSMUST00000115537 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Pdik1l-202ENSMUST00000105876 4509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Aasdh-202ENSMUST00000120963 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Tcf7l2-212ENSMUST00000111659 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Ldb2-201ENSMUST00000070748 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10101-202ENSMUST00000181311 2919 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25761-201ENSMUST00000103983 128 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22268-201ENSMUST00000104009 131 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24605-201ENSMUST00000104772 96 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12079-201ENSMUST00000112483 244 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7129-201ENSMUST00000117402 997 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5060-201ENSMUST00000120072 599 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22025-201ENSMUST00000122734 302 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Fam229b-204ENSMUST00000134279 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Fam229b-207ENSMUST00000137132 663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms