Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 AL669819.1-201ENSMUST00000225143 330 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm25515-201ENSMUST00000083858 157 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Scaper-202ENSMUST00000214747 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Cfap70-201ENSMUST00000022348 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Hlcs-209ENSMUST00000228910 4150 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm5832-201ENSMUST00000121704 1582 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Magea5-202ENSMUST00000169540 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Hspa13-202ENSMUST00000114244 2674 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r198-204ENSMUST00000227167 5990 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm26606-201ENSMUST00000181292 2439 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm38062-201ENSMUST00000192541 1856 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Cd200r3-206ENSMUST00000114622 1339 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Senp7-203ENSMUST00000089362 4825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Gabra6-203ENSMUST00000155218 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Olfr736-204ENSMUST00000215227 2485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Brs3-201ENSMUST00000033464 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm37435-201ENSMUST00000192078 3947 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Olfr571-202ENSMUST00000214160 4999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Cntn4-202ENSMUST00000089208 5179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Tmprss15-201ENSMUST00000023566 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 AC155634.1-201ENSMUST00000221687 2706 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Dynlt1-ps1-201ENSMUST00000117045 342 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm6744-201ENSMUST00000119303 543 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm11734-201ENSMUST00000132261 728 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm14950-201ENSMUST00000149500 1155 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm12414-201ENSMUST00000150794 494 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm22428-201ENSMUST00000158554 132 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm5218-201ENSMUST00000172270 465 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm20778-201ENSMUST00000178524 627 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm27193-201ENSMUST00000184217 586 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Anapc13-202ENSMUST00000186693 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 4933436F18Rik-201ENSMUST00000193468 802 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 AC099760.1-201ENSMUST00000196300 153 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 4833403J16Rik-201ENSMUST00000204490 1031 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm45156-201ENSMUST00000207255 439 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Smarca2-231ENSMUST00000208091 1140 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm10688-201ENSMUST00000214985 520 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 AC165292.1-201ENSMUST00000215218 620 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm40787-201ENSMUST00000218056 317 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm18955-201ENSMUST00000223173 649 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r220-204ENSMUST00000227950 6238 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Gstk1-201ENSMUST00000031897 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Morn2-201ENSMUST00000061703 644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Mup14-202ENSMUST00000075206 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Prl3d1-201ENSMUST00000082079 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Fam183b-202ENSMUST00000094156 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Cdc42bpa-202ENSMUST00000097450 5160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1278-203ENSMUST00000213727 6744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Fam196b-202ENSMUST00000165963 5371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Slco6b1-202ENSMUST00000178359 1778 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Crnn-201ENSMUST00000107300 1628 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Cd36-202ENSMUST00000165232 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 P2ry12-201ENSMUST00000050360 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Zfp426-203ENSMUST00000163348 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Smarca2-203ENSMUST00000112637 1962 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm13101-201ENSMUST00000105763 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r4-204ENSMUST00000227073 1695 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Enox2-209ENSMUST00000167659 3632 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Olfr150-202ENSMUST00000217257 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm10743-201ENSMUST00000219611 2358 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Trappc8-206ENSMUST00000225661 5191 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 4930550C14Rik-203ENSMUST00000215668 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Zfp760-201ENSMUST00000073312 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Cd274-201ENSMUST00000016640 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm15354-201ENSMUST00000132019 1772 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ctdnep1Q3TP92 Ighv1-18-201ENSMUST00000103504 306 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ctdnep1Q3TP92 Ighv1-26-201ENSMUST00000103510 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ctdnep1Q3TP92 Tfpi-207ENSMUST00000111722 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm14842-201ENSMUST00000119577 269 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm7931-201ENSMUST00000121537 271 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm11609-201ENSMUST00000121926 793 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm15634-201ENSMUST00000147206 492 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ctdnep1Q3TP92 4930423M02Rik-202ENSMUST00000156903 1205 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm16164-201ENSMUST00000160078 468 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm15056-202ENSMUST00000167686 314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ctdnep1Q3TP92 Olfr92-201ENSMUST00000168659 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm18006-201ENSMUST00000177411 662 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm25065-201ENSMUST00000177914 132 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Ctdnep1Q3TP92 1700010L04Rik-203ENSMUST00000179662 1015 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm25891-201ENSMUST00000180050 132 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Ctdnep1Q3TP92 1810012K16Rik-201ENSMUST00000190830 547 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm28086-201ENSMUST00000191586 317 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ctdnep1Q3TP92 Ighv5-3-201ENSMUST00000195336 322 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm5050-201ENSMUST00000197164 775 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm43269-201ENSMUST00000202075 518 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm44707-201ENSMUST00000206293 1216 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ctdnep1Q3TP92 AC104906.1-201ENSMUST00000218122 913 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Ctdnep1Q3TP92 Clca3b-201ENSMUST00000159989 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ctdnep1Q3TP92 Glb1l3-203ENSMUST00000210274 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ctdnep1Q3TP92 AC154755.2-201ENSMUST00000224384 2857 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Ctdnep1Q3TP92 Ehf-202ENSMUST00000111174 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm18757-201ENSMUST00000207938 3141 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm45562-201ENSMUST00000210015 1537 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Ctdnep1Q3TP92 Dcdc5-202ENSMUST00000122388 4957 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm42873-201ENSMUST00000196110 1726 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms