Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Mir6973b-201ENSMUST00000184185 80 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm27970-201ENSMUST00000184854 407 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm20926-201ENSMUST00000194457 696 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm37676-201ENSMUST00000195496 507 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 1700093K21Rik-201ENSMUST00000020527 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm35453-201ENSMUST00000210304 331 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm36756-201ENSMUST00000222011 1214 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 AV026068-216ENSMUST00000223874 328 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 AV026068-218ENSMUST00000223980 575 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 AC117769.2-201ENSMUST00000224612 469 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm8256-203ENSMUST00000228692 591 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Olfr1441-201ENSMUST00000059033 1088 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Mmp12-202ENSMUST00000065079 1185 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Olfr726-201ENSMUST00000072370 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Vmn2r14-201ENSMUST00000170341 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm37725-201ENSMUST00000193965 2125 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Olfr1336-202ENSMUST00000214301 6882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Trim16-203ENSMUST00000108703 3574 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Rnd3-203ENSMUST00000154545 2967 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm9603-201ENSMUST00000165814 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm3542-201ENSMUST00000169362 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Rbmy-201ENSMUST00000100360 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Zscan4e-201ENSMUST00000166753 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm10256-202ENSMUST00000188114 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm21708-203ENSMUST00000190283 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 AC164567.3-201ENSMUST00000217743 2869 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Ctage5-202ENSMUST00000069430 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 9930038B18Rik-201ENSMUST00000151816 3966 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm45457-201ENSMUST00000209931 3089 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Zfp81-201ENSMUST00000054072 6639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Crnn-201ENSMUST00000107300 1628 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Agtpbp1-202ENSMUST00000109830 2879 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 D630023O14Rik-201ENSMUST00000191913 3099 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Igkv18-36-201ENSMUST00000103373 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Foxp2-202ENSMUST00000115469 1293 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm22103-201ENSMUST00000116733 121 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm26475-201ENSMUST00000116769 121 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm23620-201ENSMUST00000116812 121 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm25042-201ENSMUST00000116856 121 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm25540-201ENSMUST00000116880 121 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm15473-201ENSMUST00000140746 1179 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm15527-202ENSMUST00000144094 770 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm14950-201ENSMUST00000149500 1155 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm23894-201ENSMUST00000158107 313 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Glipr1-204ENSMUST00000162508 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 1700091H14Rik-201ENSMUST00000167772 590 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Zfp106-211ENSMUST00000171215 6391 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Mir3471-2-201ENSMUST00000174896 102 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 1110032A03Rik-209ENSMUST00000177546 647 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm23550-201ENSMUST00000179003 121 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm25123-201ENSMUST00000179154 121 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm25353-201ENSMUST00000179366 121 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm22992-201ENSMUST00000179496 121 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm25892-201ENSMUST00000179867 121 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm24092-201ENSMUST00000180257 121 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm6055-201ENSMUST00000180532 378 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm27209-201ENSMUST00000183834 898 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm38097-201ENSMUST00000192936 439 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm7343-201ENSMUST00000194510 1061 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm4332-201ENSMUST00000196114 346 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm44206-201ENSMUST00000203044 592 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm18839-201ENSMUST00000204292 670 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm44296-201ENSMUST00000204689 681 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm45196-201ENSMUST00000206751 825 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm10610-203ENSMUST00000208877 1206 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 AC131117.1-201ENSMUST00000225154 1171 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 AC159979.1-201ENSMUST00000227927 342 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm5341-201ENSMUST00000058881 489 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Olfr429-201ENSMUST00000060693 943 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm22126-201ENSMUST00000083244 142 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm37106-201ENSMUST00000193760 1532 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Lgi1-209ENSMUST00000199812 2262 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Ugt2a2-201ENSMUST00000079811 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Vmn1r6-206ENSMUST00000227847 8073 ntAPPRIS P2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Olfr600-202ENSMUST00000215042 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Synj2bp-203ENSMUST00000163402 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm28475-201ENSMUST00000187645 1497 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 B020004J07Rik-201ENSMUST00000084386 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Errfi1-202ENSMUST00000073600 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Ubr4-212ENSMUST00000165860 15798 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 March1-208ENSMUST00000110259 3181 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Olfr1364-202ENSMUST00000206526 2938 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 AC141476.1-201ENSMUST00000224988 3387 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm38335-201ENSMUST00000195727 1789 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm43113-201ENSMUST00000199713 1754 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Olfr976-201ENSMUST00000169307 2813 ntAPPRIS P2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm12442-201ENSMUST00000118372 338 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm14300-201ENSMUST00000120800 946 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Fam229b-209ENSMUST00000149949 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Bloc1s6os-201ENSMUST00000150154 696 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm24179-201ENSMUST00000158925 127 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Serpina3d-ps-201ENSMUST00000163110 1272 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm18833-201ENSMUST00000173218 862 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm20778-201ENSMUST00000178524 627 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm27460-201ENSMUST00000184213 100 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm28228-201ENSMUST00000186880 632 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
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