Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Lgi1-209ENSMUST00000199812 2262 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Olfr119-201ENSMUST00000080483 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 D630023O14Rik-201ENSMUST00000191913 3099 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Ugt2a2-201ENSMUST00000079811 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Zfp607a-202ENSMUST00000205534 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 AC122408.2-201ENSMUST00000217901 1391 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Gm2080-201ENSMUST00000211299 1573 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Hsf3-205ENSMUST00000179832 1972 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Olfr1106-202ENSMUST00000213781 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Olfr1106-203ENSMUST00000217650 2573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 AC163032.1-201ENSMUST00000220671 2970 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Tpx2-207ENSMUST00000178997 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Olfr994-202ENSMUST00000214679 1648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Acpp-201ENSMUST00000062723 4483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Gm17173-201ENSMUST00000168000 2867 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Gm37423-201ENSMUST00000194246 3342 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Gm38082-201ENSMUST00000192800 6882 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 AC131747.2-201ENSMUST00000226121 1895 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Vmn2r4-202ENSMUST00000175724 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Vmn2r6-202ENSMUST00000176481 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Gm45001-201ENSMUST00000208279 2515 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 C87436-201ENSMUST00000050497 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Gje1-201ENSMUST00000020016 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Rabgap1l-202ENSMUST00000028052 6338 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Brwd3-205ENSMUST00000150434 11619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Gm10840-201ENSMUST00000100326 309 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Amelx-202ENSMUST00000112118 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Mup9-202ENSMUST00000118759 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Rps12-ps19-201ENSMUST00000119773 400 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Gm13121-201ENSMUST00000120637 632 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 St8sia3os-203ENSMUST00000127716 667 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Gm15527-201ENSMUST00000138259 858 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Gm13923-201ENSMUST00000153283 288 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Gm4997-201ENSMUST00000154056 360 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Gm25413-201ENSMUST00000158544 312 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Gm8550-201ENSMUST00000161621 653 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Spink14-202ENSMUST00000162265 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Gm6401-202ENSMUST00000164232 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Gm17079-201ENSMUST00000167231 666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 4933416M07Rik-201ENSMUST00000181424 624 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Gtpbp4-ps3-201ENSMUST00000184093 136 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Gm29191-201ENSMUST00000185427 621 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Gm29426-202ENSMUST00000186564 536 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 4930521E06Rik-201ENSMUST00000186732 905 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 1700034K08Rik-202ENSMUST00000188082 619 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Gm28486-201ENSMUST00000188443 621 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Gm28289-201ENSMUST00000189331 315 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Gm28620-201ENSMUST00000190463 439 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Gm37439-201ENSMUST00000193150 856 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Gm34716-201ENSMUST00000194060 621 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Gm7463-201ENSMUST00000201541 547 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Gm19065-202ENSMUST00000203910 1165 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Gm21054-201ENSMUST00000203981 380 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Olfr185-ps1-201ENSMUST00000205894 881 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Gm18559-201ENSMUST00000208249 604 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Gm32983-201ENSMUST00000208500 505 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Gm34623-201ENSMUST00000210900 977 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Gm17997-201ENSMUST00000211801 840 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Olfr852-ps1-201ENSMUST00000212273 226 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Gm40685-201ENSMUST00000217861 580 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 AC153567.1-201ENSMUST00000218424 1263 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Sfrp4-204ENSMUST00000222992 1062 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 AC154245.1-201ENSMUST00000224615 601 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 BC028528-201ENSMUST00000036360 752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Gja10-201ENSMUST00000056517 2117 ntAPPRIS P2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Gm6195-201ENSMUST00000063059 357 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Olfr1145-201ENSMUST00000079711 945 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Obp1b-201ENSMUST00000088198 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Vmn1r220-203ENSMUST00000227679 7868 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Dnajc15-202ENSMUST00000226459 6193 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Gm26806-201ENSMUST00000180403 1519 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 AC122305.1-201ENSMUST00000214803 3921 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 C130075A20Rik-201ENSMUST00000198178 4176 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Gm30931-202ENSMUST00000211698 1320 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Lilrb4a-201ENSMUST00000217706 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Cntrl-204ENSMUST00000113033 1817 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Slamf7-202ENSMUST00000192024 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Dcaf1-203ENSMUST00000161758 5539 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Pramef8-201ENSMUST00000037356 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 B020004C17Rik-201ENSMUST00000178161 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Gm29091-201ENSMUST00000187289 2159 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Phf6-202ENSMUST00000101587 3639 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Soat1-201ENSMUST00000051396 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Thap6-201ENSMUST00000191860 3151 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Slc6a14-201ENSMUST00000033414 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Olfr1085-202ENSMUST00000213279 5191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Gm44275-201ENSMUST00000203442 2519 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Gm37911-201ENSMUST00000193099 1545 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Gm10477-201ENSMUST00000101552 165 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Igkv3-5-201ENSMUST00000103400 382 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Gm25344-201ENSMUST00000104503 132 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Gm14103-201ENSMUST00000119075 366 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Gm15621-201ENSMUST00000119162 364 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Mc1rQ01727 Gm6987-201ENSMUST00000119319 428 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms