Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm22952-201ENSMUST00000116720 120 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Gm15040-201ENSMUST00000118561 1241 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Gm13998-201ENSMUST00000120952 335 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Fam229b-205ENSMUST00000135785 674 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Gm12414-201ENSMUST00000150794 494 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Gm26653-201ENSMUST00000181537 1214 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Gm29587-201ENSMUST00000189898 332 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Gm43762-201ENSMUST00000201521 295 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 5033423K11Rik-202ENSMUST00000202802 1162 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 1700013A02Rik-201ENSMUST00000202969 645 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Gm44366-201ENSMUST00000204933 674 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 1700093K21Rik-201ENSMUST00000020527 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Gm6702-201ENSMUST00000208496 471 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 AC140930.1-201ENSMUST00000221889 389 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Hspe1-ps1-201ENSMUST00000222955 330 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 AC154795.1-201ENSMUST00000225611 364 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Gm8256-203ENSMUST00000228692 591 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Snrpd1-201ENSMUST00000002551 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Mcts1-201ENSMUST00000000365 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 1810024B03Rik-201ENSMUST00000056146 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Olfr1387-201ENSMUST00000073824 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Vmn1r90-201ENSMUST00000185220 7144 ntAPPRIS P2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Adgrl3-203ENSMUST00000117253 4764 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Gm43750-201ENSMUST00000199027 2493 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 4933406F09Rik-204ENSMUST00000181409 2078 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Gm5415-201ENSMUST00000171322 3609 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 AC151530.1-203ENSMUST00000223343 2591 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Gm12388-201ENSMUST00000119112 1887 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Vmn1r45-204ENSMUST00000227426 3205 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Olfr1278-203ENSMUST00000213727 6744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Homez-201ENSMUST00000081162 5609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Gm42756-201ENSMUST00000196601 2614 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Gm37435-201ENSMUST00000192078 3947 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Car5b-201ENSMUST00000033739 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Pnpla8-202ENSMUST00000122902 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Gm7700-201ENSMUST00000120273 970 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Gm12890-201ENSMUST00000120885 373 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Gm5125-201ENSMUST00000148614 624 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Snora47-201ENSMUST00000157483 138 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Gm16164-201ENSMUST00000160078 468 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Gm17096-201ENSMUST00000172037 733 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Gm26863-201ENSMUST00000181144 624 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Gm5694-201ENSMUST00000195648 641 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Gm32754-201ENSMUST00000199442 257 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Smarca2-231ENSMUST00000208091 1140 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Gm32105-201ENSMUST00000218512 511 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 AC133598.3-204ENSMUST00000224260 767 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 AC122290.1-201ENSMUST00000225631 1078 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 AC113269.1-201ENSMUST00000227185 674 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Gm5229-201ENSMUST00000039375 354 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Olfr1404-201ENSMUST00000056592 1034 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Olfr794-201ENSMUST00000059957 963 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Mir3068-201ENSMUST00000083004 136 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Pkn2-206ENSMUST00000173830 2808 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Rab11fip2-203ENSMUST00000171986 5363 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Lrrtm4-206ENSMUST00000136421 4435 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Vmn1r87-204ENSMUST00000228800 1993 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Gm42781-201ENSMUST00000201317 2719 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Cfap70-201ENSMUST00000022348 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 9430098F02Rik-201ENSMUST00000180832 2986 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 4930480E11Rik-201ENSMUST00000035626 1486 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Sirpb1c-201ENSMUST00000050623 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Hdac9-205ENSMUST00000209902 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Fam60a-211ENSMUST00000204435 2785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Olfr999-ps1-201ENSMUST00000122319 949 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Gm15471-201ENSMUST00000145893 625 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 4930423M02Rik-202ENSMUST00000156903 1205 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Gm22428-201ENSMUST00000158554 132 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Gm15056-202ENSMUST00000167686 314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Gm3242-201ENSMUST00000171273 485 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Gm20643-201ENSMUST00000177284 322 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Gm25065-201ENSMUST00000177914 132 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Gm5624-202ENSMUST00000178184 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Gm10428-201ENSMUST00000178750 399 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Gm25891-201ENSMUST00000180050 132 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Gm28294-201ENSMUST00000191154 386 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 AC099760.1-201ENSMUST00000196300 153 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Gm5050-201ENSMUST00000197164 775 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Gm45156-201ENSMUST00000207255 439 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Gm45326-201ENSMUST00000209234 721 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 AL603745.1-201ENSMUST00000215473 532 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Gm9292-201ENSMUST00000222008 710 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Gm18955-201ENSMUST00000223173 649 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Frmpd4-203ENSMUST00000112147 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Dopey1-218ENSMUST00000190957 9187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Hmgn5-201ENSMUST00000033597 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Slc39a12-201ENSMUST00000082290 2675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Slc17a3-201ENSMUST00000039721 4276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Cd200r3-206ENSMUST00000114622 1339 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Pkp1P97350 Olfr90-205ENSMUST00000216488 3188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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