Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Smad5-202ENSMUST00000109874 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Slc22a6-201ENSMUST00000010250 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Lncenc1-202ENSMUST00000179324 2764 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Gm26530-201ENSMUST00000180969 3941 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Gm3159-202ENSMUST00000167245 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Ear1-201ENSMUST00000100691 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Gm25917-201ENSMUST00000104267 130 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Tpm3-rs2-201ENSMUST00000116350 323 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Gm14733-201ENSMUST00000117680 133 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Gm13641-201ENSMUST00000117993 473 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Gm13006-201ENSMUST00000118683 214 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Rpl23a-ps2-201ENSMUST00000119375 474 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Gm14554-201ENSMUST00000119548 661 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Gm12768-201ENSMUST00000120055 759 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Sult1b1-203ENSMUST00000120150 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Gm12383-201ENSMUST00000120628 760 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Gm2012-201ENSMUST00000121900 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Gm13237-201ENSMUST00000122151 635 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Olfr1038-ps-201ENSMUST00000149775 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Mir1960-201ENSMUST00000157488 78 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Gm5538-201ENSMUST00000168156 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Mir199b-201ENSMUST00000175066 110 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Gm21858-201ENSMUST00000177834 498 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Gm5624-202ENSMUST00000178184 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Gm4956-202ENSMUST00000178869 672 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Ptrhd1-201ENSMUST00000179139 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Gm21392-201ENSMUST00000182950 972 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 V1rg10-201ENSMUST00000183378 937 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 1700031M16Rik-204ENSMUST00000189724 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 1700025B11Rik-201ENSMUST00000190233 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Gm36935-201ENSMUST00000192526 292 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 4930590H14Rik-201ENSMUST00000193999 551 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Slamf7-205ENSMUST00000194791 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 4930572K03Rik-201ENSMUST00000196713 931 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Gm40155-201ENSMUST00000198291 818 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Gm44833-201ENSMUST00000208368 331 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Olfr752-ps1-201ENSMUST00000208736 1141 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Olfr1134-203ENSMUST00000213939 1015 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 AC153800.1-201ENSMUST00000219212 365 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 AC079681.1-201ENSMUST00000219437 639 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Gm19233-201ENSMUST00000219772 936 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Gm9961-201ENSMUST00000068397 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Snora21-201ENSMUST00000082967 137 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Mir27a-201ENSMUST00000083510 87 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Spink13-201ENSMUST00000097557 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Bbs12-201ENSMUST00000057975 2433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 E230015B07Rik-202ENSMUST00000159884 2822 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Sorbs2-214ENSMUST00000134675 1692 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Ifi202b-201ENSMUST00000000266 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Mov10l1-201ENSMUST00000015509 4052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Gm45786-201ENSMUST00000213021 2278 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Gm20752-201ENSMUST00000197341 2833 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Pcm1-204ENSMUST00000211247 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Slc6a19-201ENSMUST00000022048 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Rdh11-203ENSMUST00000161204 3262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Gm37548-201ENSMUST00000194519 3814 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Etv1-210ENSMUST00000161980 1939 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 4632404H12Rik-202ENSMUST00000195940 4671 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Zfp459-201ENSMUST00000056470 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Gm15169-201ENSMUST00000126095 2753 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Ttll6-202ENSMUST00000167258 3205 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Igkv16-104-201ENSMUST00000103323 378 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Gm25346-201ENSMUST00000104509 128 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Gm12887-201ENSMUST00000106265 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Gm14943-201ENSMUST00000118056 546 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Gm15078-201ENSMUST00000118371 782 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Gm12242-201ENSMUST00000118824 738 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Gm11504-201ENSMUST00000120211 173 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Gm12748-201ENSMUST00000120763 504 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Gm16157-202ENSMUST00000135564 1082 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Gm16226-203ENSMUST00000161197 395 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Gm6904-201ENSMUST00000168702 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Vmn2r-ps37-201ENSMUST00000174682 1044 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Gm23633-201ENSMUST00000175293 119 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Vmn1r-ps141-201ENSMUST00000176293 753 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Gm37203-201ENSMUST00000191618 385 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Anxa3-202ENSMUST00000196126 453 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Gm44395-201ENSMUST00000197056 153 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Gm43104-201ENSMUST00000197234 311 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Gm43794-201ENSMUST00000200971 692 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Stx3-206ENSMUST00000211047 870 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 AC145731.1-201ENSMUST00000214083 344 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Olfr628-202ENSMUST00000218266 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Nqo2-201ENSMUST00000021843 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Trdn-207ENSMUST00000219931 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 AC153646.1-201ENSMUST00000223229 1279 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 AC183092.2-201ENSMUST00000225542 1153 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Ppp1r1c-201ENSMUST00000040863 629 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Gm2840-201ENSMUST00000048361 411 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Dpf3P58269 Mir134-201ENSMUST00000083492 71 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms