Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm29450-201ENSMUST00000189657 1497 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm29278-202ENSMUST00000189701 1497 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
VdrP48281 Zkscan16-201ENSMUST00000107554 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
VdrP48281 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
VdrP48281 Mef2c-214ENSMUST00000197722 3517 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
VdrP48281 1810064F22Rik-203ENSMUST00000188595 2307 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm28587-201ENSMUST00000187181 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm11217-201ENSMUST00000141162 1729 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm37043-201ENSMUST00000194609 3105 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm36660-201ENSMUST00000218323 3871 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm10773-201ENSMUST00000218071 3935 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm37786-201ENSMUST00000191714 3225 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
VdrP48281 Amz2-201ENSMUST00000020929 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm10032-201ENSMUST00000071522 1887 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
VdrP48281 AC155234.1-201ENSMUST00000225610 2823 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
VdrP48281 Vmn1r197-202ENSMUST00000226225 5326 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gip-202ENSMUST00000103157 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
VdrP48281 Tardbp-205ENSMUST00000105700 923 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
VdrP48281 Trappc1-204ENSMUST00000108662 635 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
VdrP48281 Atp6ap1l-201ENSMUST00000109541 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm11259-201ENSMUST00000120554 715 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
VdrP48281 Mrpl48-ps-201ENSMUST00000121413 636 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm16458-201ENSMUST00000121428 502 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm13508-201ENSMUST00000121639 775 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm13480-201ENSMUST00000125095 1000 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm12730-201ENSMUST00000125277 291 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
VdrP48281 Apol7d-203ENSMUST00000126516 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm16152-201ENSMUST00000131663 872 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
VdrP48281 Babam2-205ENSMUST00000131995 1220 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm12828-201ENSMUST00000136115 289 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm13189-201ENSMUST00000138462 252 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm25721-201ENSMUST00000157496 171 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm22262-201ENSMUST00000158713 86 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
VdrP48281 Atxn3-204ENSMUST00000160251 998 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm19840-201ENSMUST00000169624 882 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm17210-201ENSMUST00000169975 391 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
VdrP48281 Trav9d-2-201ENSMUST00000178824 337 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
VdrP48281 Trav9n-2-201ENSMUST00000180097 337 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
VdrP48281 2310031A07Rik-201ENSMUST00000181212 990 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm15013-202ENSMUST00000183728 801 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm28821-201ENSMUST00000185637 610 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm28087-201ENSMUST00000189195 767 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
VdrP48281 1700003L19Rik-201ENSMUST00000190074 746 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm37837-201ENSMUST00000191743 604 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm18407-201ENSMUST00000192126 790 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
VdrP48281 Mllt11-202ENSMUST00000196025 624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm22149-202ENSMUST00000196259 137 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm42750-201ENSMUST00000199745 353 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm4259-201ENSMUST00000206489 758 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm6145-205ENSMUST00000211114 1148 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
VdrP48281 AC153537.1-201ENSMUST00000215530 858 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm3776-201ENSMUST00000217203 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
VdrP48281 AC139638.1-201ENSMUST00000218027 364 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm2089-201ENSMUST00000218294 479 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
VdrP48281 AC160114.3-201ENSMUST00000222256 560 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm36262-201ENSMUST00000223274 499 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
VdrP48281 AC131586.4-201ENSMUST00000228424 668 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
VdrP48281 Olfr1449-201ENSMUST00000056005 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
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VdrP48281 Fam47e-201ENSMUST00000082382 750 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm10697-201ENSMUST00000091692 1023 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
VdrP48281 Ifna4-201ENSMUST00000094973 561 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm10356-201ENSMUST00000097152 1258 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
VdrP48281 Tdpoz5-201ENSMUST00000098879 1023 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
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VdrP48281 Fmo9-201ENSMUST00000027843 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm4952-201ENSMUST00000092931 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
VdrP48281 Eci2-203ENSMUST00000110251 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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VdrP48281 Il15ra-210ENSMUST00000128156 1624 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
VdrP48281 Sprr2a3-202ENSMUST00000193337 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
VdrP48281 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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VdrP48281 Gm36823-203ENSMUST00000199408 1792 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
VdrP48281 Glra4-201ENSMUST00000018739 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
VdrP48281 A330076H08Rik-202ENSMUST00000207694 1836 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
VdrP48281 Olfr1305-202ENSMUST00000213405 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
VdrP48281 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
VdrP48281 Serpinb9-201ENSMUST00000006391 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
VdrP48281 Rab1a-206ENSMUST00000163483 2657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
VdrP48281 Abca8b-201ENSMUST00000020948 7423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
VdrP48281 Wdr64-203ENSMUST00000194087 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
VdrP48281 Ncoa2-202ENSMUST00000068304 8006 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm42969-201ENSMUST00000199858 3631 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
VdrP48281 Olfr585-201ENSMUST00000104881 1030 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
VdrP48281 Ncald-202ENSMUST00000116445 858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm14082-201ENSMUST00000118582 801 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm12710-201ENSMUST00000119011 216 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm12599-201ENSMUST00000120534 792 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
VdrP48281 Olfr1376-ps1-201ENSMUST00000121306 955 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm22478-201ENSMUST00000122570 154 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm25845-201ENSMUST00000122588 310 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
VdrP48281 Rps16-ps2-201ENSMUST00000140155 441 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
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