Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Nxf7-202ENSMUST00000113163 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Maml2-203ENSMUST00000177755 2264 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Vmn1r90-201ENSMUST00000185220 7144 ntAPPRIS P2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Olfr1339-202ENSMUST00000217522 2559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Vmn2r-ps54-202ENSMUST00000150147 2952 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Pter-203ENSMUST00000134794 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
SrprbP47758 C130089K02Rik-201ENSMUST00000194534 6960 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Nsd2-202ENSMUST00000066854 6919 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Mum1l1-202ENSMUST00000113042 4182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SrprbP47758 9330178D15Rik-201ENSMUST00000196033 3451 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Gm765-201ENSMUST00000164491 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Zfp935-202ENSMUST00000221747 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Zscan4d-201ENSMUST00000067210 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Gm37611-201ENSMUST00000195250 2028 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Gdap10-201ENSMUST00000180613 5003 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Olfr895-202ENSMUST00000212156 1558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Acp2-201ENSMUST00000002172 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Svs2-202ENSMUST00000109374 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SrprbP47758 2900092N22Rik-201ENSMUST00000193601 1409 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Gm14356-201ENSMUST00000118322 869 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Chchd7-204ENSMUST00000119403 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Gm8051-201ENSMUST00000120464 466 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Gm5843-201ENSMUST00000121631 476 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SrprbP47758 n-R5s30-201ENSMUST00000122624 122 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SrprbP47758 4930419G24Rik-201ENSMUST00000125494 1058 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Gm13219-202ENSMUST00000152599 685 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Gm15795-201ENSMUST00000160969 553 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Gm4202-201ENSMUST00000169025 733 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Gm5225-201ENSMUST00000178572 324 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Gm5885-201ENSMUST00000178578 648 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Gm27025-201ENSMUST00000182392 942 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Gm37700-201ENSMUST00000192617 965 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Gm37770-201ENSMUST00000192855 772 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Gm37511-201ENSMUST00000192901 294 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Gm38333-201ENSMUST00000193608 604 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Gtpbp4-ps7-201ENSMUST00000197059 297 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Tshb-205ENSMUST00000197322 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Gm3321-201ENSMUST00000200603 1129 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SrprbP47758 1700028E10Rik-206ENSMUST00000202216 557 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SrprbP47758 4930402F11Rik-201ENSMUST00000207348 1000 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Gm41231-201ENSMUST00000211525 449 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SrprbP47758 AC069561.4-201ENSMUST00000215291 572 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SrprbP47758 4930545H06Rik-201ENSMUST00000218225 763 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SrprbP47758 AC079644.2-201ENSMUST00000220581 322 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Gm9293-201ENSMUST00000223096 306 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SrprbP47758 AC154633.1-201ENSMUST00000223276 449 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SrprbP47758 AC154861.1-201ENSMUST00000223767 800 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Tpbpb-203ENSMUST00000223978 991 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SrprbP47758 AC163667.1-201ENSMUST00000225201 1289 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SrprbP47758 AC101205.1-201ENSMUST00000227916 907 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Cetn1-201ENSMUST00000062769 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Olfr594-201ENSMUST00000098205 1087 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Cox11-202ENSMUST00000099960 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Tex11-201ENSMUST00000009814 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Gm9752-201ENSMUST00000048965 2659 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Crtam-203ENSMUST00000180872 4443 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Ktn1-210ENSMUST00000187839 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Usp29-201ENSMUST00000054055 2610 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Mnd1-ps-202ENSMUST00000224435 2574 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Dnajb4-202ENSMUST00000050073 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Sestd1-202ENSMUST00000102660 8990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Gm44068-201ENSMUST00000204049 2128 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Robo2-202ENSMUST00000117200 5988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Cntrl-204ENSMUST00000113033 1817 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SrprbP47758 4933431G14Rik-201ENSMUST00000205571 1670 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Gm10767-201ENSMUST00000099412 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Mgat4a-206ENSMUST00000154819 2796 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SrprbP47758 4933440M02Rik-201ENSMUST00000061823 3801 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SrprbP47758 A2m-201ENSMUST00000032203 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Mir99ahg-214ENSMUST00000183333 3422 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Slc22a8-202ENSMUST00000170817 3398 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Gm26530-201ENSMUST00000180969 3941 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Nemf-201ENSMUST00000021368 4732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Gm21719-201ENSMUST00000115940 693 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Gm15016-201ENSMUST00000117300 720 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Mup-ps14-201ENSMUST00000118437 532 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Gm8855-201ENSMUST00000118888 878 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Mup-ps10-201ENSMUST00000119626 556 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Gm16095-201ENSMUST00000128235 253 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Gm13166-203ENSMUST00000144166 326 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Gm26486-201ENSMUST00000158021 110 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Obox3-ps1-201ENSMUST00000176885 995 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SrprbP47758 1700109I08Rik-201ENSMUST00000185680 396 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Gm37866-201ENSMUST00000191950 696 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Gm37934-201ENSMUST00000192902 402 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Gm7804-202ENSMUST00000194187 854 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Eif4e-202ENSMUST00000196990 856 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Gm40348-201ENSMUST00000199648 452 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Gm29778-201ENSMUST00000201667 466 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Gm44674-201ENSMUST00000206159 415 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Gm18600-201ENSMUST00000207205 505 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Gm2996-201ENSMUST00000211398 537 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SrprbP47758 AC153955.1-201ENSMUST00000217458 663 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SrprbP47758 AC153516.1-201ENSMUST00000217955 779 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms