Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Dnase1l1-202ENSMUST00000075821 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Zfp27-204ENSMUST00000161904 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Crem-230ENSMUST00000151311 2485 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Pias1-202ENSMUST00000214830 2492 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Sh2d1b1-201ENSMUST00000179976 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Adam6b-201ENSMUST00000063317 2547 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm26538-201ENSMUST00000180512 3498 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Asap1-210ENSMUST00000176384 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Mir711-201ENSMUST00000102188 82 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm12468-201ENSMUST00000116189 404 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm13877-201ENSMUST00000120614 417 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm12535-201ENSMUST00000121025 484 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm12804-201ENSMUST00000121030 999 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm13593-201ENSMUST00000121329 692 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 4930517O19Rik-201ENSMUST00000140320 603 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm14764-201ENSMUST00000147130 313 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm23762-201ENSMUST00000158348 106 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm15740-201ENSMUST00000159703 1292 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm3140-201ENSMUST00000163523 481 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Igkv4-53-201ENSMUST00000166380 292 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm3594-201ENSMUST00000169152 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Speer1-201ENSMUST00000172106 1123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 1110038B12Rik-201ENSMUST00000172501 579 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Pfdn6-206ENSMUST00000179418 514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm26910-201ENSMUST00000180450 698 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 6530403H02Rik-203ENSMUST00000183168 843 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Mir6987-201ENSMUST00000184789 73 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Stpg4-203ENSMUST00000187078 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm37270-201ENSMUST00000194277 330 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm34144-201ENSMUST00000197039 259 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm42776-201ENSMUST00000198031 406 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm43906-201ENSMUST00000203194 906 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm44253-201ENSMUST00000203387 628 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm31036-201ENSMUST00000212925 521 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm18863-201ENSMUST00000217004 1299 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 AC105950.1-201ENSMUST00000222637 408 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm34552-201ENSMUST00000223381 636 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 AC154573.2-201ENSMUST00000224174 378 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 AC135292.2-201ENSMUST00000227559 367 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Rbp7-201ENSMUST00000030848 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Rps27rt-201ENSMUST00000053150 374 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Rpl37a-201ENSMUST00000059980 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Vaultrc5-201ENSMUST00000083211 143 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Olfr1308-201ENSMUST00000099605 963 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm36799-202ENSMUST00000215783 1634 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Smad2-203ENSMUST00000113930 1305 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Ugt1a7c-202ENSMUST00000113135 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm16751-201ENSMUST00000142212 1685 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Serpinb3b-201ENSMUST00000086694 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Rad21l-201ENSMUST00000096439 1650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Olfr916-202ENSMUST00000213714 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Maoa-201ENSMUST00000026013 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Ift80-201ENSMUST00000029347 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Trim30b-201ENSMUST00000106831 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Kif20b-203ENSMUST00000223907 5423 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Naip2-201ENSMUST00000067975 4709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm37833-201ENSMUST00000194342 3256 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm35256-201ENSMUST00000212780 3269 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Zfp455-201ENSMUST00000117110 2556 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm5454-201ENSMUST00000052030 1453 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Wrn-202ENSMUST00000033991 6262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm4924-203ENSMUST00000210381 3330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 9530026P05Rik-202ENSMUST00000181145 2968 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm37911-201ENSMUST00000193099 1545 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 C030017G13Rik-201ENSMUST00000202959 2331 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Olfr1087-202ENSMUST00000214141 3861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm38403-201ENSMUST00000219032 2357 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 4933421A08Rik-201ENSMUST00000135313 1638 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Macf1-204ENSMUST00000106213 18957 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm16170-201ENSMUST00000156882 3754 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm25415-201ENSMUST00000104220 132 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Spin2-ps2-201ENSMUST00000116186 778 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm11517-201ENSMUST00000119491 387 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm14741-201ENSMUST00000120777 1009 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm12778-201ENSMUST00000122341 333 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 1700028P15Rik-202ENSMUST00000139894 856 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm12160-201ENSMUST00000146372 342 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm25395-201ENSMUST00000157343 272 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm23674-201ENSMUST00000157473 131 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm6133-201ENSMUST00000164064 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm6401-202ENSMUST00000164232 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm17140-201ENSMUST00000169163 627 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Scgb2b19-201ENSMUST00000179688 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Rpl31-ps25-201ENSMUST00000181557 379 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm27295-201ENSMUST00000184264 153 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Nabp1-206ENSMUST00000188051 680 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm28340-201ENSMUST00000189218 202 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm28985-201ENSMUST00000189261 356 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm37376-201ENSMUST00000192176 453 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm37770-201ENSMUST00000192855 772 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm42543-201ENSMUST00000198756 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm43459-201ENSMUST00000202093 331 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Fxyd4-204ENSMUST00000203433 670 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm44582-201ENSMUST00000209125 445 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm34368-201ENSMUST00000209512 1111 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Tmem45b-204ENSMUST00000217007 783 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm4556-201ENSMUST00000217808 355 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms