Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm4556-201ENSMUST00000217808 355 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm40685-201ENSMUST00000217861 580 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
RxraP28700 4933433N18Rik-201ENSMUST00000222134 1220 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
RxraP28700 AC107663.1-201ENSMUST00000224257 468 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
RxraP28700 AC133283.1-201ENSMUST00000228443 859 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
RxraP28700 A530021J07Rik-201ENSMUST00000066005 414 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
RxraP28700 Olfr282-201ENSMUST00000075851 928 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm6436-201ENSMUST00000077163 451 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
RxraP28700 n-R5s41-201ENSMUST00000083025 119 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm38264-201ENSMUST00000194850 2032 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
RxraP28700 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
RxraP28700 Igsf10-203ENSMUST00000194546 8393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
RxraP28700 AC121094.1-201ENSMUST00000224766 1345 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
RxraP28700 Atp8b4-202ENSMUST00000040149 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
RxraP28700 Kmt2c-201ENSMUST00000045291 14967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
RxraP28700 Them5-202ENSMUST00000198083 1378 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm20275-201ENSMUST00000215963 1387 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
RxraP28700 AC159006.2-201ENSMUST00000228734 4144 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm4994-201ENSMUST00000118379 2187 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm30382-203ENSMUST00000199503 1858 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
RxraP28700 Olfr228-202ENSMUST00000217292 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
RxraP28700 Sytl5-201ENSMUST00000067529 2301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
RxraP28700 2900079G21Rik-204ENSMUST00000163302 2764 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm26563-202ENSMUST00000181152 1931 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RxraP28700 Tlr11-202ENSMUST00000185091 3207 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm45424-201ENSMUST00000210575 3300 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gk-208ENSMUST00000156390 4245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
RxraP28700 Olfr1420-203ENSMUST00000217281 2998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RxraP28700 Olfr358-201ENSMUST00000100146 1059 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RxraP28700 Spaca7-201ENSMUST00000010579 762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gstm7-202ENSMUST00000106687 743 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm7571-201ENSMUST00000120252 927 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm23426-201ENSMUST00000122483 318 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RxraP28700 1700054M17Rik-201ENSMUST00000125654 445 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
RxraP28700 4930556G01Rik-201ENSMUST00000128925 891 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm12827-201ENSMUST00000132690 660 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm15564-201ENSMUST00000144134 545 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RxraP28700 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
RxraP28700 1700021L23Rik-201ENSMUST00000153719 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm22235-201ENSMUST00000157085 110 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm25281-201ENSMUST00000157270 104 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm17201-201ENSMUST00000167226 390 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm23968-201ENSMUST00000175047 125 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RxraP28700 Vmn2r-ps3-201ENSMUST00000176077 1101 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RxraP28700 Scgb2a2-201ENSMUST00000179814 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RxraP28700 2310043O21Rik-201ENSMUST00000185323 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
RxraP28700 Scgb1b5-ps-201ENSMUST00000189491 280 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RxraP28700 5430434I15Rik-201ENSMUST00000197658 1257 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm7452-201ENSMUST00000200764 788 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RxraP28700 Spaca7-202ENSMUST00000209428 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
RxraP28700 Olfr291-201ENSMUST00000211582 1159 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RxraP28700 AC153528.1-201ENSMUST00000217696 434 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm46364-201ENSMUST00000218548 319 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RxraP28700 Ear14-202ENSMUST00000228064 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RxraP28700 Olfr11-201ENSMUST00000043081 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RxraP28700 Nqo2-202ENSMUST00000058978 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
RxraP28700 Zfp982-201ENSMUST00000063704 1244 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RxraP28700 F730035P03Rik-201ENSMUST00000065741 917 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
RxraP28700 Olfr193-203ENSMUST00000208455 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RxraP28700 Tlr4-202ENSMUST00000107365 1866 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
RxraP28700 4833421K07Rik-201ENSMUST00000206146 1391 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
RxraP28700 Olfr1564-202ENSMUST00000208645 5213 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
RxraP28700 Olfr348-204ENSMUST00000215199 3557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.39
RxraP28700 Olfr127-202ENSMUST00000217223 3733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm42756-201ENSMUST00000196601 2614 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
RxraP28700 BC080695-202ENSMUST00000105774 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
RxraP28700 3110067C02Rik-201ENSMUST00000120793 2117 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm43588-201ENSMUST00000201862 2298 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RxraP28700 Zfp473-203ENSMUST00000120074 3624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm37951-201ENSMUST00000192963 3032 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RxraP28700 Sytl2-202ENSMUST00000107210 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RxraP28700 Tenm4-203ENSMUST00000107166 13172 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RxraP28700 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RxraP28700 Emcn-202ENSMUST00000122064 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RxraP28700 Olfr419-202ENSMUST00000214725 2685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm24142-201ENSMUST00000101960 107 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RxraP28700 Zfp973-201ENSMUST00000108985 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm14755-201ENSMUST00000118037 384 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm11920-201ENSMUST00000118491 563 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm11963-201ENSMUST00000149826 500 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm23259-201ENSMUST00000158318 303 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm8582-201ENSMUST00000164061 789 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RxraP28700 1110038B12Rik-201ENSMUST00000172501 579 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RxraP28700 Vmn2r-ps64-201ENSMUST00000173690 523 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RxraP28700 1110032A03Rik-209ENSMUST00000177546 647 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm6803-201ENSMUST00000178301 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RxraP28700 Scgb2b19-201ENSMUST00000179688 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm2075-201ENSMUST00000180285 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RxraP28700 Mir3473e-201ENSMUST00000183932 110 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm38068-201ENSMUST00000192546 540 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RxraP28700 Ighv1-30-201ENSMUST00000194082 349 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RxraP28700 Trav15n-2-201ENSMUST00000199112 398 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RxraP28700 1700001N15Rik-201ENSMUST00000199380 482 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RxraP28700 Trav15d-2-dv6d-2-201ENSMUST00000199800 398 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm45607-201ENSMUST00000211143 678 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm45789-201ENSMUST00000213038 364 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RxraP28700 E130101E03Rik-201ENSMUST00000214469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm2022-201ENSMUST00000220585 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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