Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
P20040 Lax1-202ENSMUST00000189524 628 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
P20040 Gm37511-201ENSMUST00000192901 294 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
P20040 Gm9517-201ENSMUST00000195021 874 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
P20040 Gm5853-201ENSMUST00000197183 632 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
P20040 Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 311 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
P20040 Gm39078-201ENSMUST00000207973 704 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
P20040 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
P20040 Gm45343-201ENSMUST00000210452 828 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
P20040 Gm45246-201ENSMUST00000210820 367 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
P20040 Gm32005-201ENSMUST00000212446 959 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
P20040 AC133207.2-201ENSMUST00000218430 237 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
P20040 4933433N18Rik-201ENSMUST00000222134 1220 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
P20040 AC154861.1-201ENSMUST00000223767 800 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
P20040 Olfr11-201ENSMUST00000043081 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
P20040 Gm10037-201ENSMUST00000060609 315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
P20040 Cryba1-201ENSMUST00000078623 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
P20040 Vmn1r83-201ENSMUST00000086229 996 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
P20040 Mgst1-201ENSMUST00000008684 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
P20040 Olfr678-201ENSMUST00000098160 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
P20040 Rpl29-202ENSMUST00000098994 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
P20040 4930563J15Rik-201ENSMUST00000218306 3468 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
P20040 Akap11-202ENSMUST00000123853 9364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
P20040 Inpp5f-208ENSMUST00000151237 2609 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
P20040 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
P20040 Olfr90-205ENSMUST00000216488 3188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
P20040 D030045P18Rik-202ENSMUST00000213571 2370 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
P20040 B3gnt5-203ENSMUST00000121344 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
P20040 Gabra6-203ENSMUST00000155218 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
P20040 AC137871.4-201ENSMUST00000226323 3901 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
P20040 Vmn2r104-201ENSMUST00000168050 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
P20040 Gm7155-201ENSMUST00000121143 1671 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
P20040 Olfr539-202ENSMUST00000218865 11486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
P20040 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
P20040 Tti1-202ENSMUST00000109522 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
P20040 Zbed4-ps2-201ENSMUST00000187003 3448 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
P20040 Gm16092-201ENSMUST00000161449 2405 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
P20040 Gm37255-201ENSMUST00000193302 3060 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
P20040 Rfx3-202ENSMUST00000165566 9146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
P20040 CT009757.5-201ENSMUST00000221858 3425 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
P20040 Hmgn5-201ENSMUST00000033597 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
P20040 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
P20040 Gm10825-201ENSMUST00000180537 4478 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
P20040 Eppin-201ENSMUST00000103100 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
P20040 Ighv1-64-201ENSMUST00000103535 405 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
P20040 Gm24173-201ENSMUST00000104130 128 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
P20040 Spaca7-201ENSMUST00000010579 762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
P20040 Gm12040-201ENSMUST00000118357 537 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
P20040 Rpl5-ps2-201ENSMUST00000119057 891 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
P20040 Gm8089-201ENSMUST00000122463 968 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
P20040 Gm10658-201ENSMUST00000128125 1241 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
P20040 Gm14747-201ENSMUST00000149888 984 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
P20040 Gm26167-201ENSMUST00000158423 253 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
P20040 Gm17140-201ENSMUST00000169163 627 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
P20040 Gypc-201ENSMUST00000172434 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
P20040 Gm20475-201ENSMUST00000174884 263 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
P20040 Gm4904-201ENSMUST00000178243 1195 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
P20040 Gm29663-201ENSMUST00000186962 853 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
P20040 Gm43098-201ENSMUST00000199989 1297 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
P20040 Gm7554-201ENSMUST00000202282 574 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
P20040 Spaca7-202ENSMUST00000209428 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
P20040 Gm32105-201ENSMUST00000218512 511 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
P20040 Gm40653-202ENSMUST00000222122 1155 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
P20040 CT030184.2-201ENSMUST00000223064 263 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
P20040 Gm18955-201ENSMUST00000223173 649 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
P20040 Vwc2l-201ENSMUST00000053922 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
P20040 Mir194-1-201ENSMUST00000083647 67 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
P20040 Gm10220-201ENSMUST00000088236 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
P20040 Mup8-201ENSMUST00000095058 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
P20040 Olfr1039-201ENSMUST00000099910 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
P20040 Bex6-201ENSMUST00000099990 764 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
P20040 Ahnak-202ENSMUST00000092956 18099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
P20040 Cdh17-202ENSMUST00000108303 3287 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
P20040 AC155634.1-201ENSMUST00000221687 2706 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
P20040 Gm3629-201ENSMUST00000171706 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
P20040 Gm37951-201ENSMUST00000192963 3032 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
P20040 Prom1-216ENSMUST00000197750 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
P20040 Gm5415-201ENSMUST00000171322 3609 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
P20040 Mtus1-203ENSMUST00000093534 4148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
P20040 Vmn2r22-201ENSMUST00000170808 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
P20040 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
P20040 Xpo7-202ENSMUST00000167242 15121 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
P20040 Smgc-202ENSMUST00000100293 2878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
P20040 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
P20040 Ifi205-201ENSMUST00000059226 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
P20040 AC154368.2-201ENSMUST00000222334 1724 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
P20040 AC155167.2-201ENSMUST00000226127 1945 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
P20040 C230099D08Rik-201ENSMUST00000215772 2727 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
P20040 Olfr292-201ENSMUST00000080165 3211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
P20040 Ncoa4-201ENSMUST00000111994 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
P20040 Zfp27-205ENSMUST00000162592 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
P20040 Pdzph1-201ENSMUST00000025064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
P20040 Gm26538-201ENSMUST00000180512 3498 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
P20040 Ccdc66-201ENSMUST00000050480 2457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
P20040 Gm44416-201ENSMUST00000204055 2066 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
P20040 Gm44735-201ENSMUST00000206197 1752 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
P20040 Lrrtm4-206ENSMUST00000136421 4435 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
P20040 AC154841.1-201ENSMUST00000227263 1479 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
P20040 Olfr585-201ENSMUST00000104881 1030 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
P20040 Insl5-202ENSMUST00000106869 438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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