Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm37076-201ENSMUST00000192033 2294 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Trbv23-201ENSMUST00000103279 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Igkv5-37-201ENSMUST00000103372 359 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Myl2-202ENSMUST00000111750 729 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm8250-201ENSMUST00000117398 774 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm14294-201ENSMUST00000119749 751 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm11990-201ENSMUST00000121505 897 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm15840-201ENSMUST00000122099 943 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gtsf1-209ENSMUST00000153930 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm12963-203ENSMUST00000156271 388 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Vmn1r-ps12-201ENSMUST00000176946 502 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 1700010L04Rik-203ENSMUST00000179662 1015 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm5430-201ENSMUST00000182525 915 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Ighv8-3-201ENSMUST00000194985 295 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm43063-201ENSMUST00000198198 1081 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm43743-202ENSMUST00000198353 491 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm18103-201ENSMUST00000216621 779 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Olfr1084-201ENSMUST00000216851 961 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 AC159886.1-201ENSMUST00000217099 1091 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm7712-201ENSMUST00000222214 337 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 CT030195.1-201ENSMUST00000223887 378 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 AC161252.2-201ENSMUST00000224978 374 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 AC122459.3-201ENSMUST00000228508 1042 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Ssxb2-201ENSMUST00000023931 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Mug1-201ENSMUST00000032228 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Olfr933-201ENSMUST00000075680 1003 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm10160-201ENSMUST00000085094 201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Olfr1456-ps1-201ENSMUST00000087769 518 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Defb18-201ENSMUST00000097818 258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Sspn-202ENSMUST00000111701 4512 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Rab3c-201ENSMUST00000167824 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Naip6-201ENSMUST00000042220 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 1700019D03Rik-203ENSMUST00000114493 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Slfn8-206ENSMUST00000215239 2930 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Robo2-203ENSMUST00000117785 8124 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm14976-201ENSMUST00000117055 1394 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Prkg2-204ENSMUST00000162147 1389 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm37775-201ENSMUST00000194120 2313 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 AC132384.12-201ENSMUST00000219608 4227 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Glrx2-204ENSMUST00000129653 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Tnfaip3-202ENSMUST00000105527 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Olfr527-203ENSMUST00000214858 3362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 4930547M16Rik-201ENSMUST00000181590 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Sgms1-209ENSMUST00000142618 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm3510-201ENSMUST00000180447 1455 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm37953-201ENSMUST00000195293 1884 ntBASIC6.02□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Olfr1033-203ENSMUST00000214546 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Ccar1-211ENSMUST00000219527 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 AC160028.2-201ENSMUST00000218937 2519 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 CT025604.1-201ENSMUST00000221111 3436 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
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H2-Eb1P04230 Gm5594-201ENSMUST00000172712 1429 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Gm22267-201ENSMUST00000104008 131 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Insl5-202ENSMUST00000106869 438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
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H2-Eb1P04230 Gm13807-201ENSMUST00000137073 1295 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Lrrc75aos1-201ENSMUST00000142492 779 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
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H2-Eb1P04230 Gm31887-201ENSMUST00000197661 501 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
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H2-Eb1P04230 AC166352.1-201ENSMUST00000215483 1105 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
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H2-Eb1P04230 Ninj2-201ENSMUST00000035244 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Gm5229-201ENSMUST00000039375 354 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Lgals2-201ENSMUST00000044584 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Olfr1079-201ENSMUST00000099882 948 ntAPPRIS P2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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H2-Eb1P04230 Ppip5k2-205ENSMUST00000171129 3425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Map7d3-201ENSMUST00000114766 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 G530011O06Rik-201ENSMUST00000154810 2380 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Zfp27-202ENSMUST00000159920 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Gm45632-201ENSMUST00000211532 1888 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 AC154682.1-201ENSMUST00000225871 3124 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Olfr1036-201ENSMUST00000164985 3203 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Vmn1r45-204ENSMUST00000227426 3205 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 AC155634.1-201ENSMUST00000221687 2706 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Stk4-202ENSMUST00000088291 4098 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Olfr770-204ENSMUST00000204712 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Mfap1a-201ENSMUST00000089926 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Herc1-201ENSMUST00000042824 15153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Gm20644-201ENSMUST00000176721 2063 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Nusap1-201ENSMUST00000028771 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Cd200r3-206ENSMUST00000114622 1339 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Mbtd1-204ENSMUST00000107852 1930 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Gm43638-201ENSMUST00000201519 2297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
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