Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Gm15097-201ENSMUST00000101180 2029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Gm15127-201ENSMUST00000101186 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Gm15091-201ENSMUST00000112740 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Gm15107-201ENSMUST00000112796 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Gm15080-201ENSMUST00000112804 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Gm15109-201ENSMUST00000133085 2026 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Ott-201ENSMUST00000177554 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Ott-202ENSMUST00000177606 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Gm15085-201ENSMUST00000178169 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Ott-203ENSMUST00000179348 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Plch1-202ENSMUST00000059973 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Osbpl6-201ENSMUST00000077972 8037 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Gm37706-201ENSMUST00000195379 2765 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Grik1-209ENSMUST00000227986 2942 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Sec22a-201ENSMUST00000043521 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Mdc1-201ENSMUST00000082337 7335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Gm36927-201ENSMUST00000192504 1841 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Vmn2r-ps119-201ENSMUST00000177481 2406 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Ankef1-210ENSMUST00000180246 2726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 AC154903.1-201ENSMUST00000222121 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Gm10248-201ENSMUST00000090409 2731 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Serpinb8-201ENSMUST00000000514 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Efl1-201ENSMUST00000039881 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Slc6a19-201ENSMUST00000022048 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Gm36380-201ENSMUST00000210339 4379 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Kcnj15-204ENSMUST00000113856 5129 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Psg26-201ENSMUST00000094798 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Mkl2-204ENSMUST00000149359 8295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Oas1e-203ENSMUST00000201172 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 AC120153.1-201ENSMUST00000226502 1311 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Olfr982-201ENSMUST00000054051 5576 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Mlip-215ENSMUST00000185144 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Dctn4-204ENSMUST00000223984 2948 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Rgs4-201ENSMUST00000027991 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Mapk10-202ENSMUST00000112846 2617 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 A730011C13Rik-202ENSMUST00000141787 1877 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Gm37056-201ENSMUST00000192141 1865 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Gm26545-201ENSMUST00000181082 1746 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Ccdc82-206ENSMUST00000217444 4736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Zfp640-202ENSMUST00000224116 1562 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Gm36757-201ENSMUST00000221818 3556 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Nfib-202ENSMUST00000064770 8429 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Tpo-201ENSMUST00000021005 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Gm13712-201ENSMUST00000117484 2295 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Olfr1366-203ENSMUST00000205976 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Trav13n-4-201ENSMUST00000103634 267 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Gm25757-201ENSMUST00000103986 123 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Eri2-203ENSMUST00000106523 973 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Gm13877-201ENSMUST00000120614 417 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Gm12535-201ENSMUST00000121025 484 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Gm13857-202ENSMUST00000141091 617 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Olfr819-201ENSMUST00000167974 963 ntAPPRIS P2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Olfr247-201ENSMUST00000170920 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Ptrhd1-201ENSMUST00000179139 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Prl-201ENSMUST00000018061 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Otx2os1-201ENSMUST00000183522 866 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Gm27317-201ENSMUST00000183533 95 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Gm27185-201ENSMUST00000184296 247 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 1700028D13Rik-202ENSMUST00000187272 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Snhg14-208ENSMUST00000188262 687 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Scgb2b8-ps-201ENSMUST00000188661 327 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 1700034P13Rik-204ENSMUST00000189431 555 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Scgb2b13-ps-201ENSMUST00000190420 328 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 2010103J01Rik-201ENSMUST00000192375 388 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Ighv1-30-201ENSMUST00000194082 349 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Gm38079-201ENSMUST00000195603 154 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 5033403H07Rik-202ENSMUST00000198248 756 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Gm36816-201ENSMUST00000204824 493 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Smarca2-238ENSMUST00000208589 1054 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Gm4972-201ENSMUST00000211108 1254 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Gm8106-201ENSMUST00000213123 523 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Gm32515-201ENSMUST00000219396 350 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 A330049N07Rik-202ENSMUST00000219920 587 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Gm46312-201ENSMUST00000220961 420 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 AC154851.1-201ENSMUST00000221591 655 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Prl2c2-203ENSMUST00000221612 596 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 AC110176.1-201ENSMUST00000226219 504 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Myl12a-201ENSMUST00000024846 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Eri2-202ENSMUST00000063902 1241 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 BC147527-201ENSMUST00000081558 504 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Gm24144-201ENSMUST00000082632 111 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Serpina1e-201ENSMUST00000085054 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Olfr1416-201ENSMUST00000086837 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Gm10310-201ENSMUST00000095239 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Olfr78-202ENSMUST00000168007 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 AC107763.1-202ENSMUST00000225021 2663 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Slc4a4-201ENSMUST00000113216 2518 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Gm3883-201ENSMUST00000098119 3229 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Atp8b5-204ENSMUST00000107942 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Elavl4-207ENSMUST00000106603 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Cstf2t-201ENSMUST00000066039 3750 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Gm9314-201ENSMUST00000199881 1528 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Gm44116-201ENSMUST00000204269 1525 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Clasp1-212ENSMUST00000189262 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Cyp2j11-201ENSMUST00000015368 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 D030068K23Rik-204ENSMUST00000212085 1351 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Brd8-202ENSMUST00000097626 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Peak1-204ENSMUST00000188142 7524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 4921525O09Rik-201ENSMUST00000220691 3270 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 1700080O16Rik-201ENSMUST00000033449 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms