Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gm33586-201ENSMUST00000210768 892 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Gm45307-201ENSMUST00000211122 751 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Gm45435-201ENSMUST00000211147 475 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Olfr852-ps1-201ENSMUST00000212273 226 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Gm31013-201ENSMUST00000213576 715 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Scp2-ps2-202ENSMUST00000213851 609 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 AC116589.2-201ENSMUST00000220469 478 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Gm31218-201ENSMUST00000221181 1498 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 CT485612.3-201ENSMUST00000222179 408 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Gm6575-201ENSMUST00000222946 697 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 AC160962.1-202ENSMUST00000225859 1116 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 AC154841.1-201ENSMUST00000227263 1479 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Olfr273-201ENSMUST00000051520 1059 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Vmn2r13-201ENSMUST00000053253 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Olfr303-201ENSMUST00000053958 1040 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Rpl37a-201ENSMUST00000059980 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Gm10037-201ENSMUST00000060609 315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 1700019A02Rik-201ENSMUST00000072235 646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Scimp-201ENSMUST00000074572 617 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Cryba1-201ENSMUST00000078623 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Tas2r140-201ENSMUST00000095391 1000 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Gm94-201ENSMUST00000096570 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Trmt10a-201ENSMUST00000040321 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Enpp2-204ENSMUST00000173516 2887 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Gm43874-201ENSMUST00000204853 2798 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Ugt2a1-201ENSMUST00000147854 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Gm29091-201ENSMUST00000187289 2159 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Zfp457-201ENSMUST00000049705 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Cavin4-201ENSMUST00000030033 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Tnrc6a-201ENSMUST00000094053 8183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Gsdmc4-201ENSMUST00000063530 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 CT025660.2-201ENSMUST00000217654 3539 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Gm10558-201ENSMUST00000147494 1661 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Gm10767-201ENSMUST00000099412 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Lrrc31-201ENSMUST00000108263 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r196-204ENSMUST00000228382 6525 ntAPPRIS P2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Gm43128-201ENSMUST00000202212 1621 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Gm36799-202ENSMUST00000215783 1634 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 4930568G15Rik-201ENSMUST00000193317 3218 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Gm18491-201ENSMUST00000192492 1594 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Kcnma1-209ENSMUST00000179097 4596 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 1700017N19Rik-206ENSMUST00000190386 1483 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Gm43328-201ENSMUST00000198544 1434 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Naip3-201ENSMUST00000118082 4208 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Prkg2-204ENSMUST00000162147 1389 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Samd8-202ENSMUST00000119430 6801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Igkv18-36-201ENSMUST00000103373 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Gm5725-201ENSMUST00000105195 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Gm11858-201ENSMUST00000117935 838 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Gm12040-201ENSMUST00000118357 537 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Gm12174-201ENSMUST00000119853 813 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Gm12654-201ENSMUST00000120387 587 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Gm11350-201ENSMUST00000121436 870 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Gm16095-201ENSMUST00000128235 253 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Mir1981-201ENSMUST00000157934 82 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Gm8653-201ENSMUST00000163096 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Gm3025-201ENSMUST00000163454 489 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Gm3077-201ENSMUST00000165903 627 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r129-201ENSMUST00000165961 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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Cldn34c3J3QJW5 Zfp169-202ENSMUST00000167682 411 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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Cldn34c3J3QJW5 Obox4-ps30-201ENSMUST00000176032 948 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Mir7685-201ENSMUST00000183555 62 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 2310008N11Rik-201ENSMUST00000189978 568 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Gm37679-201ENSMUST00000192868 1192 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Gm37517-201ENSMUST00000194004 1289 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Gm37705-201ENSMUST00000195111 577 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 4933401H06Rik-201ENSMUST00000199058 827 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 A230098N10Rik-202ENSMUST00000200055 356 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Gm7463-201ENSMUST00000201541 547 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 1810049I09Rik-202ENSMUST00000206760 556 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Gm45070-201ENSMUST00000208100 246 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Spcs2-206ENSMUST00000208465 736 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 2310008N11Rik-203ENSMUST00000210732 601 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Gm34623-201ENSMUST00000210900 977 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Serpina3a-201ENSMUST00000021496 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 AC134606.1-201ENSMUST00000216324 721 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 AC122901.2-201ENSMUST00000216926 285 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Gm19047-201ENSMUST00000220922 1099 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 AC133958.1-201ENSMUST00000227085 961 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 AC116724.1-201ENSMUST00000227900 972 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Dbi-201ENSMUST00000027634 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Ppp1r1c-201ENSMUST00000040863 629 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1361-201ENSMUST00000055615 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Pifo-202ENSMUST00000066319 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Gm6455-201ENSMUST00000095015 1072 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1053-201ENSMUST00000099897 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 1700071M16Rik-203ENSMUST00000169733 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Adam34-202ENSMUST00000212185 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Fat1-203ENSMUST00000189017 14651 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms