Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Gm43523-201ENSMUST00000197397 2878 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Ttk-201ENSMUST00000070326 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm43490-201ENSMUST00000197593 2652 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Adgrl2-215ENSMUST00000199750 4399 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm9144-201ENSMUST00000101625 1008 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Igkv1-132-201ENSMUST00000103305 362 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm25093-201ENSMUST00000103993 132 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Krtap9-5-201ENSMUST00000105052 1077 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm10241-201ENSMUST00000117664 286 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 3110067C02Rik-201ENSMUST00000120793 2117 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm13147-201ENSMUST00000125785 585 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Crisp2-203ENSMUST00000131699 538 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Smim26-201ENSMUST00000136628 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm15407-201ENSMUST00000136919 634 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm14093-201ENSMUST00000145579 364 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm22339-201ENSMUST00000157718 62 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm24682-201ENSMUST00000158764 137 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm8206-203ENSMUST00000171428 997 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 AA465934-205ENSMUST00000177533 308 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm3500-202ENSMUST00000178058 609 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Esp23-201ENSMUST00000178532 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm6931-201ENSMUST00000183103 371 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm27360-201ENSMUST00000183487 80 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm29663-201ENSMUST00000186962 853 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm18752-202ENSMUST00000193627 587 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm36965-201ENSMUST00000193797 394 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm43390-201ENSMUST00000196614 421 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 4930572K03Rik-201ENSMUST00000196713 931 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm44342-201ENSMUST00000196874 129 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm44383-201ENSMUST00000198940 129 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Lrrc72-201ENSMUST00000020853 660 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm45157-201ENSMUST00000208729 401 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm2975-201ENSMUST00000209710 820 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm45554-202ENSMUST00000210964 1090 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 AC122188.1-201ENSMUST00000217534 312 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 CT030030.1-201ENSMUST00000218809 152 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 AC154552.3-201ENSMUST00000220741 444 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm4057-201ENSMUST00000221407 368 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm4808-201ENSMUST00000222283 1203 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 AC153152.2-201ENSMUST00000223165 959 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 CT009733.1-203ENSMUST00000224033 451 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 AC161275.1-201ENSMUST00000224668 208 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 CT009711.4-201ENSMUST00000225685 198 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 CT030238.4-202ENSMUST00000226143 745 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Olfr1265-201ENSMUST00000080311 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm3512-201ENSMUST00000090663 441 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Olfr338-202ENSMUST00000091006 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Faddos-201ENSMUST00000097928 1053 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Olfr1269-201ENSMUST00000099756 1018 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm42885-201ENSMUST00000200763 4214 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Zfp27-202ENSMUST00000159920 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm44102-201ENSMUST00000204031 1666 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 AC153959.1-201ENSMUST00000213617 1694 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Vmn2r-ps21-201ENSMUST00000177115 2947 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Olfr821-202ENSMUST00000205181 1993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Cd44-207ENSMUST00000111194 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Tspan7-202ENSMUST00000115526 7067 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm38244-201ENSMUST00000191737 2586 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Olfr765-202ENSMUST00000216460 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Creb5-212ENSMUST00000205120 7482 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm10466-201ENSMUST00000101450 2466 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Nlrp10-201ENSMUST00000055745 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 D930016D06Rik-202ENSMUST00000181620 3805 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm30948-201ENSMUST00000195683 4827 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 AC164437.5-201ENSMUST00000227235 4414 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 CT009480.2-201ENSMUST00000225152 3369 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 A330023F24Rik-202ENSMUST00000181273 4217 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Sprr2a3-202ENSMUST00000193337 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm22256-201ENSMUST00000102291 107 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Ighv1-26-201ENSMUST00000103510 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Tpmt-202ENSMUST00000110118 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm12468-201ENSMUST00000116189 404 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 5033423K11Rik-201ENSMUST00000117311 787 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm15310-201ENSMUST00000117891 372 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm6987-201ENSMUST00000119319 428 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm13341-201ENSMUST00000120780 672 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Llph-ps1-201ENSMUST00000121281 390 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm25178-201ENSMUST00000122633 325 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Eif4e1b-203ENSMUST00000126785 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm16284-201ENSMUST00000140995 400 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 0610043K17Rik-202ENSMUST00000142581 372 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm12629-201ENSMUST00000145751 711 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 4930519D14Rik-201ENSMUST00000151471 1137 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm11339-201ENSMUST00000154766 490 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm24773-201ENSMUST00000158513 99 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm6245-201ENSMUST00000164699 768 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm9672-201ENSMUST00000166437 425 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm44-201ENSMUST00000172155 993 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm3715-201ENSMUST00000172308 617 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Hspe1-ps3-201ENSMUST00000172726 277 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm2888-202ENSMUST00000178577 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm26570-201ENSMUST00000180672 342 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm20574-201ENSMUST00000182867 917 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm28973-201ENSMUST00000189310 613 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm18984-201ENSMUST00000193998 1124 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm42610-201ENSMUST00000196557 650 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
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