Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Gtpbp4-204ENSMUST00000222098 8783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Gm42613-201ENSMUST00000199975 1931 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Akr1e1-202ENSMUST00000110691 3288 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Sin3a-201ENSMUST00000049169 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 AC168056.3-201ENSMUST00000225395 2540 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Lctl-202ENSMUST00000118215 1380 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Prkg2-204ENSMUST00000162147 1389 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Gm42852-201ENSMUST00000202649 1379 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Sirpb1c-202ENSMUST00000108349 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Cdk14-202ENSMUST00000115450 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Kif9-203ENSMUST00000197248 3184 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Prom1-208ENSMUST00000179059 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Mug4-ps-201ENSMUST00000203118 3578 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Alpk2-201ENSMUST00000035548 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 A2m-201ENSMUST00000032203 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Mgam-206ENSMUST00000202779 3821 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Gm43363-201ENSMUST00000201590 2647 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 9930111J21Rik2-201ENSMUST00000093152 2403 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Pde1a-203ENSMUST00000102652 1646 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Klhl13-203ENSMUST00000115316 3064 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Tln2-202ENSMUST00000040025 12132 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Gm20655-202ENSMUST00000181428 2946 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Fam227b-202ENSMUST00000110448 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Gm43981-201ENSMUST00000203285 1467 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Brwd3-205ENSMUST00000150434 11619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Gm23748-201ENSMUST00000104227 131 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Gm2178-201ENSMUST00000104927 357 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Krtap9-5-201ENSMUST00000105052 1077 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Gm12135-201ENSMUST00000119170 466 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Gm14353-201ENSMUST00000122200 869 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Gm14613-201ENSMUST00000122239 752 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15991-201ENSMUST00000127631 942 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15534-201ENSMUST00000137642 562 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Gm22339-201ENSMUST00000157718 62 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Gm2966-201ENSMUST00000166052 481 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Gm17204-201ENSMUST00000167936 478 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Tnfsf10-202ENSMUST00000174840 989 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 4831440E17Rik-201ENSMUST00000181942 1028 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Gm37187-201ENSMUST00000193425 341 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 2310046K23Rik-201ENSMUST00000193521 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Gm31925-202ENSMUST00000194266 537 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Pdpk1Q9Z2A0 Clec2j-202ENSMUST00000203658 606 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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Pdpk1Q9Z2A0 Gm18537-201ENSMUST00000205709 989 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr1494-202ENSMUST00000207836 2100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Gm39463-201ENSMUST00000214575 735 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Pdpk1Q9Z2A0 Lalba-201ENSMUST00000023726 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Pdpk1Q9Z2A0 Spink13-201ENSMUST00000097557 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Pdpk1Q9Z2A0 Ptbp2-207ENSMUST00000197464 1742 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 B020004C17Rik-201ENSMUST00000178161 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Pdpk1Q9Z2A0 Gm14827-201ENSMUST00000146644 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Spag17os-201ENSMUST00000137776 2437 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Gm18422-202ENSMUST00000203798 2214 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 AC158938.1-201ENSMUST00000225372 6720 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Arhgap32-203ENSMUST00000174641 13568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Alkbh8-202ENSMUST00000165105 2256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Gm43319-201ENSMUST00000198036 2270 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Vmn2r-ps139-201ENSMUST00000190764 2057 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Trps1-207ENSMUST00000184885 3492 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Spin4-201ENSMUST00000096367 4173 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 4933421A08Rik-201ENSMUST00000135313 1638 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 AC153501.1-201ENSMUST00000218156 1860 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Triml1-201ENSMUST00000059692 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Meg3-209ENSMUST00000146701 14548 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr348-204ENSMUST00000215199 3557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11541-201ENSMUST00000069852 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Hsp90aa1-201ENSMUST00000021698 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 AC159006.2-201ENSMUST00000228734 4144 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Dlg1-206ENSMUST00000115205 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Kcnj16-201ENSMUST00000106635 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5454-201ENSMUST00000052030 1453 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Gm43410-201ENSMUST00000197510 2234 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 C130089K02Rik-201ENSMUST00000194534 6960 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Vmn1r220-202ENSMUST00000226651 6252 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
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