Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Cnga3Q9JJZ8 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Cnga3Q9JJZ8 Vmn2r-ps139-201ENSMUST00000190764 2057 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Cnga3Q9JJZ8 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Cnga3Q9JJZ8 Gm37967-201ENSMUST00000195634 2665 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Cnga3Q9JJZ8 Rc3h2-201ENSMUST00000100143 8799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Cnga3Q9JJZ8 Zfp607b-202ENSMUST00000120004 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Cnga3Q9JJZ8 Gm37951-201ENSMUST00000192963 3032 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
Cnga3Q9JJZ8 Vmn1r8-203ENSMUST00000228690 1699 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Cnga3Q9JJZ8 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Cnga3Q9JJZ8 Vmn1r35-203ENSMUST00000227354 2319 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Cnga3Q9JJZ8 Gm7108-201ENSMUST00000118038 3407 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
Cnga3Q9JJZ8 1700024B05Rik-202ENSMUST00000168972 1573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Rfx4-205ENSMUST00000166696 3332 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Cnot4-201ENSMUST00000044163 3337 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Nsd2-205ENSMUST00000114399 7786 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Gm22374-201ENSMUST00000104583 132 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Gm11011-201ENSMUST00000109160 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Gm15715-201ENSMUST00000118032 283 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Gm11902-201ENSMUST00000118849 270 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Gm6446-201ENSMUST00000120604 818 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Gm14950-201ENSMUST00000149500 1155 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Vmn1r-ps141-201ENSMUST00000176293 753 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Gm27468-201ENSMUST00000183577 106 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 1110008L16Rik-203ENSMUST00000183654 943 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Gm28527-201ENSMUST00000185210 297 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 9430002A10Rik-202ENSMUST00000185395 475 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Gm28237-201ENSMUST00000186563 641 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Gm44837-201ENSMUST00000206863 717 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Gm34263-202ENSMUST00000214353 303 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 4930529N20Rik-201ENSMUST00000220538 639 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 AC166105.1-201ENSMUST00000227512 482 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 AC154806.5-205ENSMUST00000228828 411 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Olfr166-201ENSMUST00000074739 1040 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Mir3068-201ENSMUST00000083004 136 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Gm6990-201ENSMUST00000086830 348 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Olfr1170-202ENSMUST00000214386 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 AC134329.1-201ENSMUST00000217956 1770 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Haus2-202ENSMUST00000110706 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Crtam-203ENSMUST00000180872 4443 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Gm42975-201ENSMUST00000200612 1491 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Olfr720-202ENSMUST00000206298 4437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Ranbp17-201ENSMUST00000037522 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Spata1-206ENSMUST00000197980 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 9830004L10Rik-201ENSMUST00000185548 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Vmn1r71-203ENSMUST00000227003 5048 ntAPPRIS P2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Galnt13-201ENSMUST00000068595 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Gm37033-201ENSMUST00000193199 7350 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Gm44723-201ENSMUST00000207369 4000 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Cdh9-202ENSMUST00000228307 3539 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Alpk2-201ENSMUST00000035548 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 AC141476.1-201ENSMUST00000224988 3387 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Gm12388-201ENSMUST00000119112 1887 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Ankfy1-206ENSMUST00000155998 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Tnip3-201ENSMUST00000114236 3769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Cntn4-202ENSMUST00000089208 5179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Abca6-201ENSMUST00000044003 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 AC124183.1-201ENSMUST00000222367 2135 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Olfr726-207ENSMUST00000217319 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Ogdh-201ENSMUST00000003461 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Gm23311-201ENSMUST00000104152 134 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Gm14510-201ENSMUST00000116165 1092 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Gm13193-201ENSMUST00000117275 225 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Gm14580-201ENSMUST00000119122 718 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Gm12115-201ENSMUST00000119969 447 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Olfr1274-ps-201ENSMUST00000120681 1035 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Gm12396-201ENSMUST00000121600 306 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 4933411O13Rik-203ENSMUST00000146849 607 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Gm26346-201ENSMUST00000157525 329 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Gm24359-201ENSMUST00000158418 221 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Ptpn4-204ENSMUST00000163621 431 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Obox6-ps1-201ENSMUST00000176658 1042 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Gm25065-201ENSMUST00000177914 132 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Gm20778-201ENSMUST00000178524 627 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Gm25891-201ENSMUST00000180050 132 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Gm21542-201ENSMUST00000182307 993 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Scgb1b4-ps-201ENSMUST00000186920 271 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Gm28156-201ENSMUST00000187880 1136 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Gm28501-201ENSMUST00000188729 421 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Gm6074-201ENSMUST00000193340 451 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Gm37463-201ENSMUST00000193819 796 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Gm43132-201ENSMUST00000199106 792 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Gm44809-201ENSMUST00000208305 993 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Gm46332-202ENSMUST00000220320 516 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Gm18405-201ENSMUST00000220743 511 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Elk3-205ENSMUST00000223340 750 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 CT030645.3-201ENSMUST00000225483 1022 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 AC154527.1-201ENSMUST00000225809 242 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Vmn1r22-205ENSMUST00000228322 909 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Gm22684-201ENSMUST00000082849 132 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Gm94-201ENSMUST00000096570 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Gm15169-201ENSMUST00000126095 2753 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Fam227b-202ENSMUST00000110448 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Sorbs2-214ENSMUST00000134675 1692 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Klkb1-201ENSMUST00000026907 5249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Vmn1r208-202ENSMUST00000227136 3156 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Gm15228-201ENSMUST00000142044 3440 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Il5-201ENSMUST00000048605 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Cnga3Q9JJZ8 Ftx-205ENSMUST00000156211 4215 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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