Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Gm45326-201ENSMUST00000209234 721 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 AC108846.2-201ENSMUST00000214925 731 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm5055-201ENSMUST00000215697 581 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm33728-201ENSMUST00000217285 546 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 AC153557.1-201ENSMUST00000217697 403 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 AC164295.1-201ENSMUST00000224861 186 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 AC122290.1-201ENSMUST00000225631 1078 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Olfr282-201ENSMUST00000075851 928 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Olfr688-201ENSMUST00000098155 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Tnip3-201ENSMUST00000114236 3769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Olfr308-202ENSMUST00000214977 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm31218-202ENSMUST00000221428 1823 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm1966-201ENSMUST00000184540 7293 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm37086-201ENSMUST00000193082 3452 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Olfr615-203ENSMUST00000215673 3469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Kcnma1-209ENSMUST00000179097 4596 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm15228-201ENSMUST00000142044 3440 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Olfr1170-202ENSMUST00000214386 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Vmn1r52-206ENSMUST00000228385 2769 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm10030-203ENSMUST00000197321 3824 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 B830042I05Rik-201ENSMUST00000208333 1620 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Dlg2-204ENSMUST00000107196 7490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Vmn1r31-203ENSMUST00000177318 2076 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm4073-201ENSMUST00000176792 3500 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Pja2-201ENSMUST00000024888 4531 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Irgm2-202ENSMUST00000108836 3459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Irgm2-201ENSMUST00000058704 3470 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Specc1-217ENSMUST00000202905 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 9430062P05Rik-201ENSMUST00000192703 3345 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Tlr4-201ENSMUST00000048096 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Tfb1m-201ENSMUST00000041003 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm24069-201ENSMUST00000104512 127 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm13870-201ENSMUST00000117214 1023 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm13811-201ENSMUST00000117800 256 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm9506-201ENSMUST00000118516 320 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm13702-201ENSMUST00000118542 825 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm13669-201ENSMUST00000122366 457 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm14349-201ENSMUST00000137155 902 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm13211-201ENSMUST00000141649 697 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm11292-201ENSMUST00000146121 1153 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 4930451E10Rik-202ENSMUST00000152292 557 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Cfhr3-201ENSMUST00000170441 1022 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm10428-201ENSMUST00000178750 399 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Rpl31-ps23-201ENSMUST00000180440 388 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm21877-201ENSMUST00000185640 694 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm36793-201ENSMUST00000199211 922 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm29791-201ENSMUST00000207144 380 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm45044-201ENSMUST00000208078 396 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm45267-201ENSMUST00000211028 522 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Tespa1-202ENSMUST00000217702 1102 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm9237-201ENSMUST00000221499 548 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 AC174082.2-201ENSMUST00000222094 543 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 9130015A21Rik-202ENSMUST00000222153 837 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm42607-201ENSMUST00000200221 3393 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Pdzph1-201ENSMUST00000025064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
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Rnf6Q9DBU5 Nlrp1b-201ENSMUST00000094046 3525 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Asap1-208ENSMUST00000176014 3435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
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Rnf6Q9DBU5 Mbd3l2-201ENSMUST00000051008 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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Rnf6Q9DBU5 Cep57l1-204ENSMUST00000186239 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 AC125328.1-201ENSMUST00000226812 2265 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm24272-201ENSMUST00000102329 98 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
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Rnf6Q9DBU5 Gm14606-201ENSMUST00000117078 1155 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 A730017C20Rik-203ENSMUST00000118510 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm13493-201ENSMUST00000120318 493 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm12026-201ENSMUST00000120961 1024 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
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Rnf6Q9DBU5 1700057H21Rik-201ENSMUST00000152467 383 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm26353-201ENSMUST00000158224 255 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Serpina3e-ps-201ENSMUST00000165968 1228 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Obox6-ps1-201ENSMUST00000176658 1042 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm29586-201ENSMUST00000185225 1104 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
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Rnf6Q9DBU5 Gm29178-203ENSMUST00000186312 1104 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm29385-201ENSMUST00000186831 363 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm28179-202ENSMUST00000189029 327 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm29624-202ENSMUST00000190185 1104 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 4933404I11Rik-201ENSMUST00000190294 1202 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm28532-201ENSMUST00000190408 572 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm29179-209ENSMUST00000190621 1100 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
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