Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm11504-201ENSMUST00000120211 173 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm12026-201ENSMUST00000120961 1024 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 2210409E12Rik-201ENSMUST00000122062 346 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm13214-201ENSMUST00000122137 408 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm3810-201ENSMUST00000122413 476 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm16224-201ENSMUST00000127711 412 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 4930599N23Rik-201ENSMUST00000146981 880 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Serpina3d-ps-201ENSMUST00000163110 1272 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Tph1-205ENSMUST00000168335 578 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 B230104I21Rik-201ENSMUST00000181143 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm26901-201ENSMUST00000181554 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm26974-201ENSMUST00000182054 875 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm27617-201ENSMUST00000184321 168 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm27156-201ENSMUST00000184589 754 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm27238-201ENSMUST00000185180 417 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm19124-201ENSMUST00000191041 832 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm8860-201ENSMUST00000193160 445 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm38084-201ENSMUST00000193488 437 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm37285-201ENSMUST00000194465 1139 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm37865-201ENSMUST00000194996 437 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm37220-201ENSMUST00000195179 415 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm37637-201ENSMUST00000195540 1256 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm33651-201ENSMUST00000200405 456 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 AC113204.1-203ENSMUST00000219475 375 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 C230072F16Rik-203ENSMUST00000220322 1136 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm18628-201ENSMUST00000220584 475 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 AC211878.1-201ENSMUST00000221668 474 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 AC108437.1-201ENSMUST00000222170 776 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Tpbpb-202ENSMUST00000223698 746 ntAPPRIS P2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 AC170086.2-201ENSMUST00000224733 803 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Olfr535-201ENSMUST00000074897 991 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm13304-201ENSMUST00000098123 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Krtap14-201ENSMUST00000099562 216 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm42492-201ENSMUST00000195780 2915 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gabra6-203ENSMUST00000155218 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm37717-201ENSMUST00000192647 3027 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm37311-201ENSMUST00000195541 2024 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Phc3-209ENSMUST00000168645 10976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r200-204ENSMUST00000227326 5449 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r4-202ENSMUST00000175724 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Zfy2-202ENSMUST00000187148 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm10415-201ENSMUST00000204181 2825 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm20826-202ENSMUST00000185348 4605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Kcnma1-202ENSMUST00000074983 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Tet1-201ENSMUST00000050826 13986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1392-203ENSMUST00000214170 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1392-205ENSMUST00000214598 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm18701-201ENSMUST00000188281 1536 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm43128-201ENSMUST00000202212 1621 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 AC154755.2-201ENSMUST00000224384 2857 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 AW554918-208ENSMUST00000165400 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm43496-201ENSMUST00000201682 3001 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Creb5-203ENSMUST00000203528 7917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm25916-201ENSMUST00000104263 131 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Fxyd1-203ENSMUST00000108110 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Cypt3-202ENSMUST00000112573 669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm13732-201ENSMUST00000117753 535 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm13121-201ENSMUST00000120637 632 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Olfr626-ps1-201ENSMUST00000121147 318 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm16260-201ENSMUST00000155141 304 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Nedd8-202ENSMUST00000163750 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm23617-201ENSMUST00000175410 95 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Obox4-ps30-201ENSMUST00000176032 948 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm6489-201ENSMUST00000178167 696 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm27299-201ENSMUST00000184593 103 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Mir6769b-201ENSMUST00000184793 60 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm28289-201ENSMUST00000189331 315 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 1700102P08Rik-202ENSMUST00000192995 658 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Ighv1-10-201ENSMUST00000194372 355 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 C030018K13Rik-201ENSMUST00000196527 866 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm7452-201ENSMUST00000200764 788 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Fxyd4-204ENSMUST00000203433 670 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm45181-201ENSMUST00000207878 449 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Ldhc-204ENSMUST00000210585 1071 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Scp2-ps2-202ENSMUST00000213851 609 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 1700037F03Rik-201ENSMUST00000223032 365 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm9293-201ENSMUST00000223096 306 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 AC165260.1-201ENSMUST00000224127 683 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 CT030705.2-201ENSMUST00000225301 556 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Fxyd4-201ENSMUST00000005114 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Cd48-202ENSMUST00000068584 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm24411-201ENSMUST00000083428 131 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm28673-201ENSMUST00000186562 1498 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm37344-203ENSMUST00000195490 1498 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm43627-201ENSMUST00000197119 2299 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r103-201ENSMUST00000172203 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r107-201ENSMUST00000042090 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r34-204ENSMUST00000226999 3048 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm44068-201ENSMUST00000204049 2128 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Olfr491-203ENSMUST00000214605 2136 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm21093-201ENSMUST00000084677 1710 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Rd3l-203ENSMUST00000189759 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Alkbh8-204ENSMUST00000211933 7674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm45752-201ENSMUST00000212917 3186 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms