Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Olfr1155-202ENSMUST00000214641 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Vmn2r28-201ENSMUST00000086297 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm45424-201ENSMUST00000210575 3300 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Olfr1353-201ENSMUST00000039718 1992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 AC158982.1-205ENSMUST00000227339 1876 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Ap5m1-208ENSMUST00000228238 3514 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm31121-201ENSMUST00000197948 1413 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm43719-201ENSMUST00000200088 2199 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Scd4-201ENSMUST00000058856 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Zfp442-201ENSMUST00000109916 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm10295-201ENSMUST00000094315 2525 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 BC046251-201ENSMUST00000154632 3653 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm44043-201ENSMUST00000203426 3253 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Il18r1-206ENSMUST00000195684 2850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm9575-201ENSMUST00000122140 1339 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Cfap70-201ENSMUST00000022348 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Atad2-208ENSMUST00000228783 3472 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Olfr1004-ps1-201ENSMUST00000120361 580 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm15750-201ENSMUST00000120970 616 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 4930480G23Rik-201ENSMUST00000125909 1013 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm23894-201ENSMUST00000158107 313 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm45844-201ENSMUST00000173842 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Vmn1r-ps141-201ENSMUST00000176293 753 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm20617-202ENSMUST00000177332 758 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 1600029O15Rik-201ENSMUST00000178259 517 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm6526-202ENSMUST00000179860 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm26509-201ENSMUST00000180947 948 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Trav6d-4-202ENSMUST00000183820 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Mir6972-201ENSMUST00000184774 64 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm29082-201ENSMUST00000185207 448 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm29060-201ENSMUST00000185339 457 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm28119-201ENSMUST00000185538 298 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm28887-201ENSMUST00000186065 294 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm28664-201ENSMUST00000186118 457 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm28237-201ENSMUST00000186563 641 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm28817-201ENSMUST00000187598 830 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm29209-201ENSMUST00000188176 457 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm29090-201ENSMUST00000188526 457 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 A330069K06Rik-201ENSMUST00000194077 917 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm43243-201ENSMUST00000199964 278 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm39078-201ENSMUST00000207973 704 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm32005-201ENSMUST00000212446 959 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm9535-201ENSMUST00000218499 768 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm3785-201ENSMUST00000221000 202 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 AC091783.2-201ENSMUST00000224626 740 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 AC158750.1-201ENSMUST00000226163 634 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 CT009515.1-201ENSMUST00000228127 586 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm5160-201ENSMUST00000069552 444 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Vmn1r36-204ENSMUST00000226829 1923 ntAPPRIS P2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 9530036O11Rik-202ENSMUST00000181202 2926 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Vmn2r-ps130-201ENSMUST00000175853 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Vmn2r-ps129-201ENSMUST00000177509 2568 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm42520-201ENSMUST00000199642 1502 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Dnase1l1-202ENSMUST00000075821 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Bche-201ENSMUST00000029367 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Fancd2-201ENSMUST00000036340 5512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm5128-202ENSMUST00000180198 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Nlrp1b-204ENSMUST00000108516 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Il22ra2-201ENSMUST00000036564 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Dnajc13-203ENSMUST00000186788 6747 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Zfp937-201ENSMUST00000073782 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Aak1-202ENSMUST00000089519 19341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Naip2-203ENSMUST00000167986 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm20826-202ENSMUST00000185348 4605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm45201-201ENSMUST00000207187 2679 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Ndst3-203ENSMUST00000132112 4460 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Olfr292-201ENSMUST00000080165 3211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Olfr25-202ENSMUST00000212354 1362 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Mme-205ENSMUST00000194134 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Hrh2-202ENSMUST00000209846 4074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 AC153144.1-201ENSMUST00000221759 3139 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Mospd2-202ENSMUST00000112247 2479 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Usp29-203ENSMUST00000198068 4420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 C730027H18Rik-202ENSMUST00000219822 3268 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm4789-201ENSMUST00000121708 1216 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Pcnp-204ENSMUST00000122253 792 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm7613-201ENSMUST00000139070 487 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 4930517O19Rik-201ENSMUST00000140320 603 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm23968-201ENSMUST00000175047 125 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm27005-201ENSMUST00000182783 921 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm27601-201ENSMUST00000184794 127 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm28528-201ENSMUST00000188560 857 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm29605-201ENSMUST00000190800 292 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm43470-201ENSMUST00000196175 454 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm29784-201ENSMUST00000196217 406 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 1110003F10Rik-201ENSMUST00000199441 767 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm3321-201ENSMUST00000200603 1129 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Nkain2-204ENSMUST00000218645 703 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 AC154646.1-201ENSMUST00000225011 1092 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 AC163631.1-201ENSMUST00000225041 598 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 AC105407.1-201ENSMUST00000225684 614 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 AC157572.1-201ENSMUST00000227187 825 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Ly6g-201ENSMUST00000023246 336 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Dbi-201ENSMUST00000027634 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Cxcl15-201ENSMUST00000031322 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Mcoln3-201ENSMUST00000039450 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms