Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 P2ry12-201ENSMUST00000050360 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Gm17477-201ENSMUST00000165458 2581 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Vmn2r-ps54-205ENSMUST00000182110 2587 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Gm10220-201ENSMUST00000088236 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Krit1-202ENSMUST00000171023 5582 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Rps12-ps16-201ENSMUST00000118529 399 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Gm7927-201ENSMUST00000118818 880 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Gm13493-201ENSMUST00000120318 493 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Gm12140-201ENSMUST00000121214 544 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Gm14664-201ENSMUST00000142919 437 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Gm11292-201ENSMUST00000146121 1153 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Gm20620-201ENSMUST00000177528 168 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Rps12-ps13-201ENSMUST00000178365 399 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Rps12-ps11-201ENSMUST00000178427 399 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Rps12-ps12-201ENSMUST00000179020 399 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Rps12-ps17-201ENSMUST00000179067 399 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Rps12-ps6-201ENSMUST00000179239 399 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Rps12-ps14-201ENSMUST00000179356 399 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Rps12-ps18-201ENSMUST00000179420 399 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Rps12-ps15-201ENSMUST00000179567 399 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Rps12l1-201ENSMUST00000183090 399 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Gm28973-201ENSMUST00000189310 613 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Fabp9-202ENSMUST00000191678 647 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 AC241534.1-201ENSMUST00000218537 399 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 AC159208.1-201ENSMUST00000221403 649 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Gm7240-202ENSMUST00000221961 353 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Gm34557-201ENSMUST00000223115 375 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Sbpl-201ENSMUST00000024939 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Ube2dnl2-201ENSMUST00000062695 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Olfr532-201ENSMUST00000073226 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Hrh2-202ENSMUST00000209846 4074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Obox4-ps28-201ENSMUST00000175654 1362 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Gbp9-201ENSMUST00000031238 4381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Olfr559-202ENSMUST00000215657 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 D830032E09Rik-202ENSMUST00000189497 1632 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Lifr-207ENSMUST00000227727 2489 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Olfr1106-202ENSMUST00000213781 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Olfr1106-203ENSMUST00000217650 2573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Olfr888-202ENSMUST00000211851 2930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm8700-201ENSMUST00000222187 3054 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Trappc8-206ENSMUST00000225661 5191 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Specc1-201ENSMUST00000049836 6091 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Hdac9-205ENSMUST00000209902 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Etl4-202ENSMUST00000066509 7197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm39139-202ENSMUST00000212621 5878 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Cd274-201ENSMUST00000016640 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Atg4aQ8C9S8 Gm26603-201ENSMUST00000181380 2861 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Olfr190-203ENSMUST00000216495 8240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Atg4aQ8C9S8 Ptbp3-212ENSMUST00000174586 6640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Cep57l1-202ENSMUST00000105505 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 4933406F09Rik-204ENSMUST00000181409 2078 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Slco6b1-202ENSMUST00000178359 1778 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gen1-201ENSMUST00000166117 5268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Atg4aQ8C9S8 Srsx-201ENSMUST00000171714 1083 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 7530428D23Rik-201ENSMUST00000191725 765 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Atg4aQ8C9S8 Gm18407-201ENSMUST00000192126 790 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 D3Ertd751e-212ENSMUST00000194346 744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Atg4aQ8C9S8 Cfap54-211ENSMUST00000212902 9516 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Stk4-202ENSMUST00000088291 4098 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Ect2-202ENSMUST00000108298 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Atg4aQ8C9S8 Zfp74-202ENSMUST00000108205 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Ktn1-210ENSMUST00000187839 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r87-204ENSMUST00000228800 1993 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Bnip3l-202ENSMUST00000111115 3259 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm18796-201ENSMUST00000190440 1767 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Cd36-202ENSMUST00000165232 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
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Atg4aQ8C9S8 Dnah17-203ENSMUST00000106308 14973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm17093-201ENSMUST00000170427 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm37289-201ENSMUST00000195409 1402 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Traj46-201ENSMUST00000103696 63 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm15634-201ENSMUST00000147206 492 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 4930423M02Rik-202ENSMUST00000156903 1205 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm24179-201ENSMUST00000158925 127 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm16132-201ENSMUST00000159296 598 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Pkib-211ENSMUST00000177473 525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm21542-201ENSMUST00000182307 993 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm29663-201ENSMUST00000186962 853 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm35013-201ENSMUST00000197218 832 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm45724-201ENSMUST00000213031 420 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm10095-201ENSMUST00000222765 483 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 CT009556.1-201ENSMUST00000227282 449 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Vmn2r-ps139-201ENSMUST00000190764 2057 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.9 ms