Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Mmp12-202ENSMUST00000065079 1185 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Desi2-202ENSMUST00000069568 1193 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Olfr846-201ENSMUST00000078774 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm11242-201ENSMUST00000120103 2457 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Ndst3-201ENSMUST00000029602 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Unc80-206ENSMUST00000212557 9777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Trmt2b-203ENSMUST00000113252 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 1700093K21Rik-204ENSMUST00000169264 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm42685-201ENSMUST00000200378 2390 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Olfr727-202ENSMUST00000215317 2616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Serpina12-201ENSMUST00000043915 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Olfr615-203ENSMUST00000215673 3469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Olfr1392-207ENSMUST00000217275 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Pikfyve-201ENSMUST00000081154 11237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Srsy-201ENSMUST00000179900 1618 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Olfr131-203ENSMUST00000215940 1614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Olfr1555-ps1-202ENSMUST00000219261 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Dnajc18-201ENSMUST00000025208 5169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Lhx9-203ENSMUST00000093486 4551 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Bbx-205ENSMUST00000114488 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Focad-201ENSMUST00000097992 5791 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Arhgap6-203ENSMUST00000112127 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gal3st2c-201ENSMUST00000097632 9667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Mrps25-203ENSMUST00000140438 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm24142-201ENSMUST00000101960 107 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm12169-201ENSMUST00000109228 1065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Olfr1078-ps1-201ENSMUST00000117978 632 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm14295-201ENSMUST00000118012 1213 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm11433-201ENSMUST00000118318 228 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm14103-201ENSMUST00000119075 366 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm15967-201ENSMUST00000120027 1116 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm14805-201ENSMUST00000120172 340 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm15006-201ENSMUST00000121419 1122 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Fam229b-209ENSMUST00000149949 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm25722-201ENSMUST00000157498 279 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm2539-203ENSMUST00000181352 746 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm8604-201ENSMUST00000183150 965 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm27152-201ENSMUST00000183828 99 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Mir6361-201ENSMUST00000185079 101 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 4930532M18Rik-201ENSMUST00000187189 481 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm28356-202ENSMUST00000187566 858 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 1700072G22Rik-201ENSMUST00000189460 548 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm18849-201ENSMUST00000189861 560 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm29072-201ENSMUST00000191149 678 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm4602-201ENSMUST00000203198 308 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm44239-201ENSMUST00000204228 271 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm18645-202ENSMUST00000212222 760 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm18914-201ENSMUST00000214625 616 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Mobp-206ENSMUST00000214943 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Olfr108-202ENSMUST00000218675 1038 ntAPPRIS P2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm32283-201ENSMUST00000218861 549 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm46191-201ENSMUST00000218899 433 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 AC144733.1-201ENSMUST00000222893 1289 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 AC154861.1-201ENSMUST00000223767 800 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm5087-204ENSMUST00000225820 645 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 AC139197.1-201ENSMUST00000228332 813 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm10037-201ENSMUST00000060609 315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Tas2r144-201ENSMUST00000063489 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm6812-201ENSMUST00000074894 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 1700020N15Rik-201ENSMUST00000075654 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Tas2r106-201ENSMUST00000076756 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Olfr108-201ENSMUST00000078207 1038 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Snora44-201ENSMUST00000082670 129 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Prl2c3-201ENSMUST00000099805 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Tdrkh-207ENSMUST00000197901 2652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Slc38a6-202ENSMUST00000101313 1546 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Cyp2c29-202ENSMUST00000176624 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm340-201ENSMUST00000172371 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Olfr675-204ENSMUST00000215899 3737 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 2900018N21Rik-201ENSMUST00000195805 1580 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm37940-201ENSMUST00000194243 3251 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gjc1-203ENSMUST00000107075 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm17529-201ENSMUST00000180738 3093 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Tmem229b-202ENSMUST00000070174 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm18594-201ENSMUST00000175733 1403 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Kirrel3os-201ENSMUST00000066604 3799 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Agbl1-203ENSMUST00000156166 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Vmn2r16-201ENSMUST00000165180 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Abraxas2-201ENSMUST00000084497 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 9330199G10Rik-201ENSMUST00000221601 2072 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm43769-201ENSMUST00000201871 4323 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Kcnab1-201ENSMUST00000049230 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Rasgrf1-202ENSMUST00000034912 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm13090-201ENSMUST00000105667 746 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Ccdc7b-203ENSMUST00000108745 1047 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gin1-202ENSMUST00000112842 1037 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Foxp2-202ENSMUST00000115469 1293 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm8424-201ENSMUST00000117716 988 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Zcchc9-ps-201ENSMUST00000117884 786 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm15421-202ENSMUST00000118224 399 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm14836-201ENSMUST00000118567 471 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Mup9-202ENSMUST00000118759 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Rpl5-ps2-201ENSMUST00000119057 891 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm12447-201ENSMUST00000119110 470 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm13502-201ENSMUST00000121574 684 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.1 ms