Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Fam227b-202ENSMUST00000110448 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Pcsk9Q80W65 Hyal4-201ENSMUST00000031691 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Pcsk9Q80W65 Ccp110-201ENSMUST00000038650 4716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Pcsk9Q80W65 Vmn2r3-202ENSMUST00000176328 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Pcsk9Q80W65 Gm44215-201ENSMUST00000204910 2711 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Pcsk9Q80W65 1810064F22Rik-203ENSMUST00000188595 2307 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Pcsk9Q80W65 Gm14827-201ENSMUST00000146644 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
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Pcsk9Q80W65 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
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Pcsk9Q80W65 Gm43483-201ENSMUST00000196724 2860 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
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Pcsk9Q80W65 Tmprss15-201ENSMUST00000023566 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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Pcsk9Q80W65 Tmprss15-202ENSMUST00000060402 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
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Pcsk9Q80W65 Trmt10a-206ENSMUST00000162864 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Azin1-201ENSMUST00000065308 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Add3-201ENSMUST00000025999 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Gm11397-201ENSMUST00000050276 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Oxr1-201ENSMUST00000022918 4232 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
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Pcsk9Q80W65 Slfn4-203ENSMUST00000215472 1830 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
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Pcsk9Q80W65 Yae1d1-201ENSMUST00000099735 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 St18-208ENSMUST00000140079 5892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 9230009I02Rik-201ENSMUST00000101255 1148 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Igkv4-79-201ENSMUST00000103342 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Igkv4-68-201ENSMUST00000103350 394 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Igkv4-59-201ENSMUST00000103354 368 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Klra7-204ENSMUST00000112013 1104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Foxp2-202ENSMUST00000115469 1293 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Gm12677-201ENSMUST00000118668 426 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Gm24383-201ENSMUST00000122691 333 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Gm4660-201ENSMUST00000131499 403 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Gm13291-201ENSMUST00000143527 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Gm15956-201ENSMUST00000153352 502 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Gm26211-201ENSMUST00000158578 129 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Gm8159-201ENSMUST00000163738 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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