Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Zfp292-202ENSMUST00000098163 9941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Olfr645-201ENSMUST00000057104 3677 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 D830032E09Rik-202ENSMUST00000189497 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Gm16092-201ENSMUST00000161449 2405 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Tti1-201ENSMUST00000029179 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Eya3-203ENSMUST00000081726 5160 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Mir193b-201ENSMUST00000103784 79 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Gm13770-201ENSMUST00000117149 305 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Gm6305-201ENSMUST00000121027 1012 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 1700003H04Rik-203ENSMUST00000178485 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Trav12n-3-201ENSMUST00000179583 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Vis1-201ENSMUST00000183957 201 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Gm18117-201ENSMUST00000187720 742 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Gm44955-201ENSMUST00000208843 229 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Gm6145-203ENSMUST00000210557 835 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Gm8523-201ENSMUST00000211386 552 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Gm45777-201ENSMUST00000213009 301 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 AC165245.1-201ENSMUST00000214181 636 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 AC123665.4-201ENSMUST00000228790 249 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Gm17728-201ENSMUST00000076982 399 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Rpl38-201ENSMUST00000077915 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Gm17165-201ENSMUST00000096155 493 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Ctnnd1-221ENSMUST00000111695 6344 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Gm21761-202ENSMUST00000187530 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 1810013D15Rik-203ENSMUST00000196971 1450 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Kansl1-203ENSMUST00000106971 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Plec-221ENSMUST00000171562 14944 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Plec-204ENSMUST00000072692 14944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Psd4-210ENSMUST00000166388 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Olfr1389-203ENSMUST00000217595 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Celf2-226ENSMUST00000183209 3852 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Gm23806-201ENSMUST00000175157 109 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Gm38343-201ENSMUST00000195786 1060 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Gm29154-234ENSMUST00000215272 750 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Olfr643-202ENSMUST00000217217 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Fbxw13-201ENSMUST00000061456 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Gm3139-203ENSMUST00000202642 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Aff1-201ENSMUST00000031256 8312 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Olfr610-203ENSMUST00000217627 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Specc1-207ENSMUST00000201364 4955 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Gm6614-203ENSMUST00000181791 2450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Olfr1-201ENSMUST00000120303 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Vwa3a-201ENSMUST00000033180 4575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Gm14755-201ENSMUST00000118037 384 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Gm4911-201ENSMUST00000119388 945 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Gm12808-201ENSMUST00000120597 404 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Atf1-ps-201ENSMUST00000120608 810 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Gm16096-202ENSMUST00000149386 819 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Gm23233-201ENSMUST00000157301 137 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Gm31211-201ENSMUST00000199170 253 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Api5-ps-201ENSMUST00000206607 577 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 AC134537.2-201ENSMUST00000217770 575 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 AC153961.2-201ENSMUST00000218877 164 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Gm3785-201ENSMUST00000221000 202 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Gm2531-201ENSMUST00000075609 512 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Lama1-201ENSMUST00000035471 9518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Sorbs2-201ENSMUST00000067065 6337 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Clec4e-201ENSMUST00000032239 2518 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Slc43a2-211ENSMUST00000169547 7145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Il18r1-205ENSMUST00000193793 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Cfap44-202ENSMUST00000120049 6199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Olfr12-202ENSMUST00000213247 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Prickle2-201ENSMUST00000032093 7754 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 2810021J22Rik-201ENSMUST00000073924 3866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Dmxl2-201ENSMUST00000118163 10614 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Gm15425-201ENSMUST00000119013 2711 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Pet2-201ENSMUST00000113959 4183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Pet2-202ENSMUST00000113960 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Hspa13-201ENSMUST00000046283 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Pramel3-202ENSMUST00000118821 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Gm11972-201ENSMUST00000118514 389 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Gm14175-201ENSMUST00000119835 241 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Gm12685-201ENSMUST00000121702 214 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Gm22235-201ENSMUST00000157085 110 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Gm27855-201ENSMUST00000184122 128 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Gm44316-201ENSMUST00000199274 97 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 1700065J11Rik-201ENSMUST00000201560 424 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Gm5229-201ENSMUST00000039375 354 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Olfr982-201ENSMUST00000054051 5576 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Pi4ka-201ENSMUST00000036161 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 A730017L22Rik-201ENSMUST00000128176 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Ctnnd1-222ENSMUST00000111696 6281 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Cypt1-202ENSMUST00000115422 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 1110059G10Rik-202ENSMUST00000118422 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Olfr363-ps-201ENSMUST00000119049 254 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Gm12488-201ENSMUST00000122449 499 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Gm11184-201ENSMUST00000126437 268 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Zfp169-202ENSMUST00000167682 411 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Gm17102-201ENSMUST00000170929 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Gm28066-201ENSMUST00000188657 472 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Gm6520-201ENSMUST00000200636 410 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Gm6474-201ENSMUST00000223250 699 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Olfr599-201ENSMUST00000098201 1050 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Stra6l-203ENSMUST00000107783 3669 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Gm13769-202ENSMUST00000214797 2340 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms