Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Gm9231-201ENSMUST00000220817 1009 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 AC163660.1-201ENSMUST00000223696 818 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Olfr516-201ENSMUST00000071410 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Nme5-201ENSMUST00000079287 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Olfr467-201ENSMUST00000084756 927 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Lig4-202ENSMUST00000170033 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Gm14326-204ENSMUST00000178829 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Olfr671-202ENSMUST00000210963 3157 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Serpinb6c-202ENSMUST00000172184 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Impact-201ENSMUST00000025290 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Olfr1359-203ENSMUST00000214435 4425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Olfr1385-202ENSMUST00000214948 4412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Ckap5-202ENSMUST00000099716 6574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Gbp7-201ENSMUST00000045097 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Gm3159-202ENSMUST00000167245 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Olfr1386-202ENSMUST00000204518 2553 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Dock2-203ENSMUST00000101365 3785 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Tet2-201ENSMUST00000098603 9179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Crnn-201ENSMUST00000107300 1628 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Olfr1054-202ENSMUST00000213205 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Fat4-201ENSMUST00000061260 16109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Dmtf1-202ENSMUST00000095017 3498 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Rfx4-203ENSMUST00000095388 3274 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Enpp2-201ENSMUST00000041591 3095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Vmn1r203-203ENSMUST00000228889 8213 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Gbp3-202ENSMUST00000106221 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 4921534A09Rik-201ENSMUST00000213976 2495 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Gm25795-201ENSMUST00000104421 132 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Gm14938-201ENSMUST00000119482 943 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Gm15967-201ENSMUST00000120027 1116 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Gm7212-201ENSMUST00000120817 348 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Gm13489-201ENSMUST00000121234 971 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 4930586N03Rik-201ENSMUST00000122940 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Rapgef4os1-201ENSMUST00000126462 638 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Gm13291-201ENSMUST00000143527 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Fam229b-209ENSMUST00000149949 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Gm9064-201ENSMUST00000163579 566 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Gm45844-201ENSMUST00000173842 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Gm23162-201ENSMUST00000175081 121 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Mir3097-201ENSMUST00000175356 67 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Gm21756-201ENSMUST00000178380 930 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Gm21405-201ENSMUST00000179024 930 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Gm29586-201ENSMUST00000185225 1104 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Gm28064-201ENSMUST00000185639 858 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Gm28782-201ENSMUST00000185980 414 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Gm28253-201ENSMUST00000186071 712 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Gm29178-203ENSMUST00000186312 1104 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Gm21191-201ENSMUST00000186484 930 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Ms4a5-202ENSMUST00000186937 816 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Gm28443-201ENSMUST00000189081 698 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Gm29624-202ENSMUST00000190185 1104 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Gm29179-209ENSMUST00000190621 1100 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Gm28490-202ENSMUST00000190946 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Gm29503-201ENSMUST00000191044 930 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Gm2453-201ENSMUST00000193383 357 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 4930512P04Rik-201ENSMUST00000197000 424 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Gm10030-203ENSMUST00000197321 3824 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Gm43725-201ENSMUST00000200122 369 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Olfr1289-202ENSMUST00000207494 1014 ntAPPRIS P2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Gm7706-201ENSMUST00000209946 388 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 C030029H02Rik-202ENSMUST00000210356 2980 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 AC155941.1-201ENSMUST00000220223 529 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 AC158521.1-202ENSMUST00000224352 645 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 AC154755.1-201ENSMUST00000225244 537 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Sprr2j-ps-201ENSMUST00000029533 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Olfr11-201ENSMUST00000043081 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Ms4a5-201ENSMUST00000067673 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Klrc3-201ENSMUST00000071149 715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Olfr726-201ENSMUST00000072370 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 1700034E13Rik-201ENSMUST00000091904 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Zfp850-201ENSMUST00000099111 941 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Gm43029-201ENSMUST00000201829 1535 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Dlg2-204ENSMUST00000107196 7490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Nsun4-202ENSMUST00000030475 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Gm17751-201ENSMUST00000189132 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 C330024D21Rik-202ENSMUST00000202634 2020 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Vmn1r176-207ENSMUST00000228793 2959 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 E330034G19Rik-204ENSMUST00000162224 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Gm12043-201ENSMUST00000131570 2788 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Obox3-202ENSMUST00000095217 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Vmn2r-ps130-201ENSMUST00000175853 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Vmn2r-ps129-201ENSMUST00000177509 2568 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Ttc12-201ENSMUST00000055096 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Gm44675-201ENSMUST00000208188 2927 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Zfp867-201ENSMUST00000057799 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Gm15328-201ENSMUST00000144006 2977 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Ect2-202ENSMUST00000108298 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Irgm2-203ENSMUST00000209079 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Gm8126-201ENSMUST00000169587 1764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Gm6620-201ENSMUST00000120113 715 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Gm14796-201ENSMUST00000121216 959 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Gm12181-201ENSMUST00000121448 531 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Gm13322-201ENSMUST00000152803 246 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim17Q7TPM3 Gm24065-201ENSMUST00000157487 264 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms