Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 CT009757.5-201ENSMUST00000221858 3425 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Lilra6-201ENSMUST00000038176 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Ankrd55-205ENSMUST00000223871 3209 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Atp2b4-206ENSMUST00000143567 11725 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Akr1e1-202ENSMUST00000110691 3288 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Cyp2j13-201ENSMUST00000030305 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Ifi206-201ENSMUST00000160565 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5512-201ENSMUST00000218013 1353 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc49-201ENSMUST00000053171 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp74-202ENSMUST00000108205 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r181-204ENSMUST00000227637 4587 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r52-206ENSMUST00000228385 2769 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm36640-201ENSMUST00000203686 5934 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Igkv8-18-201ENSMUST00000103390 395 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14510-201ENSMUST00000116165 1092 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14938-201ENSMUST00000119482 943 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 n-R5s19-201ENSMUST00000122793 120 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm28387-201ENSMUST00000189245 854 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37958-201ENSMUST00000193131 430 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm46223-201ENSMUST00000215196 675 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
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Ccdc88cQ6VGS5 Olfr107-201ENSMUST00000077008 1033 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
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Ccdc88cQ6VGS5 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Ranbp17-201ENSMUST00000037522 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
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Ccdc88cQ6VGS5 4930550C14Rik-203ENSMUST00000215668 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2223-201ENSMUST00000112099 1350 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 AC154630.1-201ENSMUST00000215334 2440 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
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Ccdc88cQ6VGS5 Scoc-201ENSMUST00000081506 1791 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
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Ccdc88cQ6VGS5 AL607131.1-201ENSMUST00000222575 1835 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
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Ccdc88cQ6VGS5 2310081O03Rik-201ENSMUST00000128591 759 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
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Ccdc88cQ6VGS5 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Stk4-202ENSMUST00000088291 4098 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
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Ccdc88cQ6VGS5 Cenpc1-201ENSMUST00000031170 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23954-201ENSMUST00000157213 353 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28885-201ENSMUST00000185615 563 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37756-201ENSMUST00000191834 942 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37375-201ENSMUST00000193859 387 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37385-201ENSMUST00000195223 387 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43798-201ENSMUST00000202056 394 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43688-201ENSMUST00000202249 310 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43946-201ENSMUST00000204058 886 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45479-201ENSMUST00000211613 802 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 AC158630.1-201ENSMUST00000214387 993 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 AC172989.1-201ENSMUST00000226387 513 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr734-201ENSMUST00000050928 1033 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Defa31-201ENSMUST00000098896 377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Elmo1-202ENSMUST00000180626 2020 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm32736-201ENSMUST00000200427 2701 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 4932435O22Rik-202ENSMUST00000148405 3406 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44416-201ENSMUST00000204055 2066 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26766-201ENSMUST00000181411 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Rfx4-205ENSMUST00000166696 3332 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Trappc8-201ENSMUST00000025177 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr45-202ENSMUST00000214637 6157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Asap1-208ENSMUST00000176014 3435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
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