Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Ifi207-201ENSMUST00000042610 3422 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Prkag2os2-201ENSMUST00000123610 1432 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Mat2a-206ENSMUST00000206692 1400 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Zfp317-203ENSMUST00000213725 2354 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Alcam-203ENSMUST00000164728 1885 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gramd2-203ENSMUST00000128944 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm20789-201ENSMUST00000221002 4195 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm10603-202ENSMUST00000184420 4520 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 4930511M06Rik-203ENSMUST00000137603 2651 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Dnah1-201ENSMUST00000048603 12872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Csn2-206ENSMUST00000197422 1329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm22371-201ENSMUST00000104588 130 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm14755-201ENSMUST00000118037 384 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Selenok-ps1-201ENSMUST00000125204 785 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Zfp286os-201ENSMUST00000128292 713 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 1700109G15Rik-201ENSMUST00000150735 384 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 B230118H07Rik-209ENSMUST00000160722 931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Pantr1-203ENSMUST00000176154 514 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Scarletltr-201ENSMUST00000176950 305 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm9274-201ENSMUST00000182505 984 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Mir6367-201ENSMUST00000183385 102 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Ighv5-21-201ENSMUST00000191935 295 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Ighv8-2-201ENSMUST00000195037 359 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Anxa3-202ENSMUST00000196126 453 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm43116-201ENSMUST00000199789 195 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm42581-201ENSMUST00000201774 966 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm44105-201ENSMUST00000204401 308 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 AC166352.1-201ENSMUST00000215483 1105 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Tmem45b-204ENSMUST00000217007 783 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 1700048P04Rik-201ENSMUST00000219825 369 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 AC154250.1-201ENSMUST00000224775 489 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 AC120375.2-202ENSMUST00000228722 397 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Pmis2-201ENSMUST00000051495 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 n-R5-8s1-201ENSMUST00000083988 148 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Oxr1-201ENSMUST00000022918 4232 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm3286-202ENSMUST00000200932 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm14827-201ENSMUST00000146644 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Atp13a5-203ENSMUST00000143373 3789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Agl-201ENSMUST00000040603 9625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm29021-201ENSMUST00000185451 1498 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm29071-201ENSMUST00000185729 1488 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm28799-201ENSMUST00000186506 1498 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm28663-201ENSMUST00000186567 1498 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm28470-201ENSMUST00000186912 1498 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm28971-201ENSMUST00000187506 1498 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm28733-202ENSMUST00000187597 1498 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm28820-201ENSMUST00000188530 1498 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm29606-202ENSMUST00000188564 1498 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm29225-202ENSMUST00000188647 1498 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm28152-201ENSMUST00000188694 1498 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm28771-202ENSMUST00000189399 1499 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm28741-201ENSMUST00000189417 1498 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm28540-202ENSMUST00000189573 1498 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm29122-203ENSMUST00000189609 1498 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm28613-201ENSMUST00000189627 1498 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm28816-202ENSMUST00000189686 1498 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm29584-202ENSMUST00000190181 1498 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm28293-202ENSMUST00000190417 1498 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm28463-203ENSMUST00000191085 1498 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm28124-202ENSMUST00000191099 1498 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm29217-202ENSMUST00000191270 1498 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm28332-203ENSMUST00000191389 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm37346-201ENSMUST00000191665 1498 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm37454-202ENSMUST00000193918 1498 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm38371-202ENSMUST00000193996 1498 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm37434-203ENSMUST00000194239 1498 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm37840-202ENSMUST00000194805 1498 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm37687-203ENSMUST00000195020 1498 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm37071-203ENSMUST00000195814 1498 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm21663-201ENSMUST00000196214 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Prom1-208ENSMUST00000179059 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm32568-201ENSMUST00000212782 1421 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Prrc2c-201ENSMUST00000028016 8815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm10280-201ENSMUST00000212238 2006 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Ktn1-223ENSMUST00000190999 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 AC022775.1-201ENSMUST00000228163 2698 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Olfr691-202ENSMUST00000213290 2327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Cwf19l1-201ENSMUST00000026218 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps54-205ENSMUST00000182110 2587 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm38366-201ENSMUST00000193127 1934 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm10825-201ENSMUST00000180537 4478 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm26581-201ENSMUST00000181953 4479 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm23739-201ENSMUST00000102295 108 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm13469-201ENSMUST00000118231 350 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm12618-201ENSMUST00000121754 483 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm8895-201ENSMUST00000172300 1223 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Lsm5-203ENSMUST00000176595 274 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm9529-201ENSMUST00000177598 579 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm15257-201ENSMUST00000177680 883 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm15252-201ENSMUST00000177750 883 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm15256-201ENSMUST00000177793 883 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm15260-201ENSMUST00000179402 883 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 4933416M07Rik-201ENSMUST00000181424 624 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
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