Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Sfrp4-204ENSMUST00000222992 1062 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P58686 AC108947.1-201ENSMUST00000224274 1000 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P58686 Zfp389-202ENSMUST00000224437 1234 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P58686 AC138329.1-201ENSMUST00000225040 471 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P58686 AC140208.1-201ENSMUST00000226609 285 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P58686 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
P58686 Olfr1255-201ENSMUST00000057369 933 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P58686 Gm4792-201ENSMUST00000065826 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P58686 Gm4825-201ENSMUST00000079690 408 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P58686 Zbed4-ps1-201ENSMUST00000186734 3466 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P58686 Gm7298-201ENSMUST00000204124 4657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P58686 Olfr250-202ENSMUST00000216168 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P58686 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
P58686 Zkscan8-204ENSMUST00000224362 6954 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P58686 Gm4070-202ENSMUST00000176467 9007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
P58686 Cnot1-202ENSMUST00000098473 8390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P58686 Gm12185-202ENSMUST00000094476 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P58686 Dock7-202ENSMUST00000075836 6704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P58686 Ptprd-201ENSMUST00000050757 4698 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P58686 Dach2-204ENSMUST00000113380 2894 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
P58686 AC154368.2-201ENSMUST00000222334 1724 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P58686 Zfp945-201ENSMUST00000088696 4285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
P58686 Gria2-201ENSMUST00000075316 10371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 Ceacam2-202ENSMUST00000064862 3087 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 Dcun1d1-203ENSMUST00000178098 4434 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 Rlf-203ENSMUST00000168615 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 Gm5373-202ENSMUST00000212931 2964 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 Gm43900-201ENSMUST00000204868 2669 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 Gm11758-202ENSMUST00000107327 1325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 Vmn2r107-201ENSMUST00000042090 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 Ighv14-3-201ENSMUST00000103469 399 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 Taf7l-202ENSMUST00000113223 1155 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 Gm16394-201ENSMUST00000117289 675 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 Gm11558-201ENSMUST00000118454 459 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 Gm15311-201ENSMUST00000119682 282 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 Gm15305-201ENSMUST00000120354 288 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 Gm12399-201ENSMUST00000121475 446 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 Gm12451-201ENSMUST00000121636 633 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 Gm12107-201ENSMUST00000132857 889 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 Gm15902-201ENSMUST00000146949 469 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 Gm15831-201ENSMUST00000156195 516 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 Gm25281-201ENSMUST00000157270 104 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 Gm26037-201ENSMUST00000158150 311 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 Vmn1r-ps60-201ENSMUST00000173467 852 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 Mirt2-201ENSMUST00000175179 285 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 Gm3047-202ENSMUST00000177998 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 Gm8297-203ENSMUST00000178389 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 Gm8159-203ENSMUST00000179231 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 BC025446-202ENSMUST00000185307 758 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 Gm8367-201ENSMUST00000186145 887 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 Ighv3-2-201ENSMUST00000191842 349 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 Gm37678-201ENSMUST00000192908 1146 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 Gm37958-201ENSMUST00000193131 430 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 Gm38326-201ENSMUST00000194030 686 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 Gm37758-201ENSMUST00000194275 629 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 Gm43906-201ENSMUST00000203194 906 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 Gm19653-201ENSMUST00000204326 1039 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 Gm45198-201ENSMUST00000206796 591 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 Gm18060-201ENSMUST00000207407 564 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 Gm39119-201ENSMUST00000208466 951 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 Gm6702-201ENSMUST00000208496 471 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 4930465I24Rik-201ENSMUST00000209697 426 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 Gm45602-202ENSMUST00000211703 1036 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 Gm31036-201ENSMUST00000212925 521 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 Gm31013-201ENSMUST00000213576 715 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 Noxred1-201ENSMUST00000021423 1101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 AC159622.2-201ENSMUST00000221592 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 Olfr799-201ENSMUST00000071126 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 Arl9-201ENSMUST00000071199 402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 Olfr862-201ENSMUST00000073765 1035 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 Prl2c3-201ENSMUST00000099805 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 Gm40770-201ENSMUST00000220040 1502 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 Olfr1173-201ENSMUST00000099830 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 Cnot7-203ENSMUST00000132032 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 Olfr1097-202ENSMUST00000217403 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 Trim5-202ENSMUST00000098179 3655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 Gm30211-201ENSMUST00000197227 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 Olfr906-202ENSMUST00000214344 3775 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 Myct1-201ENSMUST00000051809 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 Gm42819-201ENSMUST00000199630 5121 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P58686 Zscan4-ps2-201ENSMUST00000091440 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
P58686 Far2-202ENSMUST00000111607 3395 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
P58686 Tyr-201ENSMUST00000004770 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
P58686 Slc5a3-201ENSMUST00000113975 10913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
P58686 Olfr221-205ENSMUST00000216907 2859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
P58686 Mdm4-210ENSMUST00000188090 7105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
P58686 Gm24888-201ENSMUST00000104387 130 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
P58686 Arhgdib-202ENSMUST00000111891 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
P58686 Gm22103-201ENSMUST00000116733 121 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
P58686 Gm26475-201ENSMUST00000116769 121 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
P58686 Gm23620-201ENSMUST00000116812 121 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 259.5 ms