Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 n-R5s217-201ENSMUST00000083341 116 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Rpl23a-ps1-201ENSMUST00000085632 465 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Nckap5-203ENSMUST00000094610 739 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Kmt2d-202ENSMUST00000178486 19805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Olfr390-202ENSMUST00000120081 3604 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm4070-202ENSMUST00000176467 9007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gvin1-202ENSMUST00000183409 9005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Olfr406-202ENSMUST00000214303 2842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Olfr947-ps1-203ENSMUST00000215471 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm9314-201ENSMUST00000199881 1528 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Olfr266-203ENSMUST00000216610 1520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 C730027H18Rik-202ENSMUST00000219822 3268 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm21846-201ENSMUST00000179257 3073 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 AL591843.1-201ENSMUST00000223686 3082 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm43523-201ENSMUST00000197397 2878 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Rgsl1-203ENSMUST00000141249 1752 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Slfn8-206ENSMUST00000215239 2930 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Utp14b-ps1-201ENSMUST00000197716 2265 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Amz2-201ENSMUST00000020929 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 AC164107.1-202ENSMUST00000228953 1816 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Stk38l-201ENSMUST00000001675 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Kat6b-ps2-201ENSMUST00000188339 1600 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm37456-201ENSMUST00000193176 5837 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 CT009733.2-202ENSMUST00000224171 4748 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm14418-201ENSMUST00000108955 1415 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 AC155929.3-201ENSMUST00000217963 1428 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Olfr739-202ENSMUST00000216949 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 AC152944.1-201ENSMUST00000220160 3101 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Serpinb6e-201ENSMUST00000110275 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 AW554918-201ENSMUST00000036619 5257 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Olfr736-205ENSMUST00000215263 2255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Mctp1-205ENSMUST00000126960 1780 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm2178-201ENSMUST00000104927 357 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Mup3-203ENSMUST00000107488 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Smpx-203ENSMUST00000112521 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm12842-201ENSMUST00000117298 476 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm16044-201ENSMUST00000118475 450 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm12174-201ENSMUST00000119853 813 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Olfr626-ps1-201ENSMUST00000121147 318 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm5578-201ENSMUST00000121490 1236 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm4886-201ENSMUST00000121874 1176 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm12540-201ENSMUST00000121938 319 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Prlr-204ENSMUST00000128450 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm14747-201ENSMUST00000149888 984 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gtsf1-209ENSMUST00000153930 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm26321-201ENSMUST00000157740 242 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm23071-201ENSMUST00000158242 115 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm25487-201ENSMUST00000158725 125 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Six3os1-204ENSMUST00000161688 567 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Fabp7-202ENSMUST00000165013 880 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm17201-201ENSMUST00000167226 390 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm20454-201ENSMUST00000172713 221 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm9529-201ENSMUST00000177598 579 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm6526-202ENSMUST00000179860 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm26587-201ENSMUST00000180795 989 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Trav21-dv12-201ENSMUST00000180938 360 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Cd68-201ENSMUST00000018918 1230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm43383-201ENSMUST00000195981 469 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 4930590L14Rik-201ENSMUST00000196030 836 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm43048-201ENSMUST00000196101 388 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm43743-202ENSMUST00000198353 491 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm42799-201ENSMUST00000201331 328 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm9367-201ENSMUST00000205703 546 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm45181-201ENSMUST00000207878 449 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm18586-201ENSMUST00000217265 518 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm40932-202ENSMUST00000221315 511 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 AC161275.1-201ENSMUST00000224668 208 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 AC170999.2-201ENSMUST00000226223 264 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 CT030238.3-201ENSMUST00000227352 875 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Olfr303-201ENSMUST00000053958 1040 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Ly6c1-201ENSMUST00000065408 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Prl3d3-201ENSMUST00000073601 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Olfr933-201ENSMUST00000075680 1003 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Olfr149-201ENSMUST00000082027 1030 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Mir138-2-201ENSMUST00000083578 71 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Defb46-201ENSMUST00000095436 174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Vmn2r114-201ENSMUST00000168033 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Ceacam12-202ENSMUST00000108483 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Pou1f1-204ENSMUST00000176330 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Csrnp3-204ENSMUST00000122912 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Fchsd2-202ENSMUST00000098250 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Nlgn1-201ENSMUST00000075054 4359 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 AC132852.2-201ENSMUST00000216052 2794 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Matr3-ps2-201ENSMUST00000160839 1996 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Mboat2-204ENSMUST00000221952 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 C330024D21Rik-203ENSMUST00000202828 1714 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Olfr350-202ENSMUST00000214457 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 C230038L03Rik-201ENSMUST00000129409 2632 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Iqca-201ENSMUST00000113094 3210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Olfr994-204ENSMUST00000217218 1460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Angptl1-201ENSMUST00000027885 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Ptprd-204ENSMUST00000102834 8084 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Stx17-202ENSMUST00000107720 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms