Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Gm42531-201ENSMUST00000201648 4048 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm45311-201ENSMUST00000211086 1330 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
VhlP40338 AC120375.1-201ENSMUST00000227034 3612 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm43128-201ENSMUST00000202212 1621 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
VhlP40338 Fancd2-201ENSMUST00000036340 5512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
VhlP40338 Vmn1r12-203ENSMUST00000227581 6490 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
VhlP40338 AC155167.2-201ENSMUST00000226127 1945 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
VhlP40338 AC158779.2-201ENSMUST00000227902 1947 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm45413-201ENSMUST00000210389 3538 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm22256-201ENSMUST00000102291 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
VhlP40338 Spin2-ps2-201ENSMUST00000116186 778 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm12468-201ENSMUST00000116189 404 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm12399-201ENSMUST00000121475 446 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
VhlP40338 4930586N03Rik-201ENSMUST00000122940 881 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm13982-201ENSMUST00000138372 755 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm11368-201ENSMUST00000139576 609 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
VhlP40338 AI662270-203ENSMUST00000145461 592 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm25435-201ENSMUST00000158277 267 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
VhlP40338 Six3os1-204ENSMUST00000161688 567 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm9359-201ENSMUST00000163721 1221 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
VhlP40338 Rsl24d1-204ENSMUST00000169399 841 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
VhlP40338 Vmn1r176-201ENSMUST00000171073 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm24155-201ENSMUST00000175259 110 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm2229-201ENSMUST00000193328 710 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
VhlP40338 2310046K23Rik-201ENSMUST00000193521 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm37637-201ENSMUST00000195540 1256 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm44361-201ENSMUST00000197960 94 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm43743-202ENSMUST00000198353 491 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm44199-201ENSMUST00000205219 739 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm44707-201ENSMUST00000206293 1216 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm45602-202ENSMUST00000211703 1036 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
VhlP40338 Asf1a-204ENSMUST00000219271 725 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
VhlP40338 AC159622.2-201ENSMUST00000221592 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm2754-201ENSMUST00000223383 589 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
VhlP40338 AC154250.1-201ENSMUST00000224775 489 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
VhlP40338 Cd48-202ENSMUST00000068584 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm5160-201ENSMUST00000069552 444 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
VhlP40338 Olfr732-201ENSMUST00000071208 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
VhlP40338 Olfr646-201ENSMUST00000098182 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
VhlP40338 Olfr453-202ENSMUST00000213997 3082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
VhlP40338 Stx17-202ENSMUST00000107720 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
VhlP40338 Usp17lc-202ENSMUST00000106892 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm5946-202ENSMUST00000182652 2724 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm44113-201ENSMUST00000203510 3041 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
VhlP40338 Olfr558-201ENSMUST00000094124 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm3453-201ENSMUST00000170686 1756 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
VhlP40338 C030017G13Rik-201ENSMUST00000202959 2331 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
VhlP40338 Rgs17-204ENSMUST00000131996 8107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
VhlP40338 Zscan4e-201ENSMUST00000166753 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
VhlP40338 Cyp3a16-201ENSMUST00000031633 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm14418-201ENSMUST00000108955 1415 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
VhlP40338 Cab39l-201ENSMUST00000022553 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
VhlP40338 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VhlP40338 Nfib-201ENSMUST00000050872 8770 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
VhlP40338 Cntn1-201ENSMUST00000000109 5646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
VhlP40338 Olfr615-203ENSMUST00000215673 3469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VhlP40338 AC154354.1-201ENSMUST00000224585 2109 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VhlP40338 Ubtfl1-202ENSMUST00000164441 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
VhlP40338 Olfr2-205ENSMUST00000214105 5798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VhlP40338 Olfr651-203ENSMUST00000216904 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VhlP40338 Scd4-201ENSMUST00000058856 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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VhlP40338 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
VhlP40338 1700006E09Rik-201ENSMUST00000010985 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm12174-201ENSMUST00000119853 813 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm15349-201ENSMUST00000121154 204 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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VhlP40338 4930587A21Rik-201ENSMUST00000128588 851 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm11364-201ENSMUST00000137593 297 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VhlP40338 4930517O19Rik-201ENSMUST00000140320 603 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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VhlP40338 Gm16226-201ENSMUST00000159950 760 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm6133-201ENSMUST00000164064 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm5861-201ENSMUST00000168407 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm20475-201ENSMUST00000174884 263 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VhlP40338 1700003H04Rik-203ENSMUST00000178485 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
VhlP40338 D630011A20Rik-201ENSMUST00000180858 500 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
VhlP40338 C78334-201ENSMUST00000186632 600 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm28156-201ENSMUST00000187880 1136 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm43546-201ENSMUST00000196721 943 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm42776-201ENSMUST00000198031 406 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VhlP40338 4930480C01Rik-201ENSMUST00000200913 901 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm42713-201ENSMUST00000202709 945 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm43867-201ENSMUST00000203860 525 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm26911-202ENSMUST00000204244 763 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm19653-201ENSMUST00000204326 1039 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm45136-201ENSMUST00000205793 943 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VhlP40338 E330011O21Rik-208ENSMUST00000211650 1225 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VhlP40338 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm19340-201ENSMUST00000221995 345 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VhlP40338 AC129537.1-201ENSMUST00000226596 1228 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VhlP40338 Vaultrc5-201ENSMUST00000083211 143 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gabrq-201ENSMUST00000033711 2000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
VhlP40338 AC155634.1-201ENSMUST00000221687 2706 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm28475-201ENSMUST00000187645 1497 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm42611-201ENSMUST00000199446 3407 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VhlP40338 Itih4-204ENSMUST00000168782 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
VhlP40338 Usp29-204ENSMUST00000200535 7540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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