Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Igkv9-120-201ENSMUST00000103316 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 Snord65-201ENSMUST00000104269 72 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm12874-201ENSMUST00000117190 913 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm15078-201ENSMUST00000118371 782 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm14631-201ENSMUST00000119067 594 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm11976-201ENSMUST00000119236 295 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm5387-201ENSMUST00000119776 857 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 Nlk-ps1-201ENSMUST00000120843 1230 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm14847-201ENSMUST00000121978 519 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm11787-201ENSMUST00000121996 1050 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm10130-201ENSMUST00000133235 303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 Sox5os2-201ENSMUST00000156443 627 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm7437-201ENSMUST00000156744 661 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm24735-201ENSMUST00000158859 118 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm3140-201ENSMUST00000163523 481 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 Vmn1r29-201ENSMUST00000168416 1023 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm25244-201ENSMUST00000178089 132 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm26901-201ENSMUST00000181554 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm27186-201ENSMUST00000184223 307 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm37103-201ENSMUST00000191830 115 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 Txndc9-203ENSMUST00000192960 472 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm37560-201ENSMUST00000194289 1000 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 9430087B13Rik-201ENSMUST00000196548 1085 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm6366-201ENSMUST00000198766 826 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm42646-201ENSMUST00000202233 914 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm20177-201ENSMUST00000203705 334 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 Olfr1509-203ENSMUST00000206100 1161 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 4933404K13Rik-201ENSMUST00000214651 937 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 Olfr44-203ENSMUST00000216316 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 AC154904.1-201ENSMUST00000219510 312 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm9788-201ENSMUST00000057038 906 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 Fpr2-201ENSMUST00000064068 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 Olfr44-201ENSMUST00000077757 1071 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 Krtap14-201ENSMUST00000099562 216 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm10799-201ENSMUST00000099666 312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm37255-201ENSMUST00000193302 3060 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 Mttp-202ENSMUST00000098580 3072 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm34481-201ENSMUST00000214968 3374 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm43062-201ENSMUST00000196302 1319 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 Psd3-214ENSMUST00000212960 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 Cpa6-201ENSMUST00000035577 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm10295-201ENSMUST00000094315 2525 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 Il18r1-201ENSMUST00000087983 2826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 Cx3cr1-202ENSMUST00000177637 3156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm10558-201ENSMUST00000147494 1661 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 Amd1-201ENSMUST00000099945 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 Ube4a-201ENSMUST00000117506 6039 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 Rnd3-203ENSMUST00000154545 2967 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 Olfr904-202ENSMUST00000216724 5197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 Dcp2-201ENSMUST00000025350 8616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 Lrrtm4-208ENSMUST00000147663 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 Slf1-201ENSMUST00000151524 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm42503-201ENSMUST00000199080 3706 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
RxraP28700 Abcc2-201ENSMUST00000026208 8027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
RxraP28700 AY512915-201ENSMUST00000089303 1823 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
RxraP28700 Cntn5-202ENSMUST00000160216 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
RxraP28700 Reep3-202ENSMUST00000217841 2925 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
RxraP28700 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm42613-201ENSMUST00000199975 1931 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
RxraP28700 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
RxraP28700 Tor1aip1-210ENSMUST00000169241 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
RxraP28700 Skint5-204ENSMUST00000171627 1611 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm5431-203ENSMUST00000109212 3063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm42455-201ENSMUST00000199761 2736 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
RxraP28700 S100a1-202ENSMUST00000107340 577 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
RxraP28700 Spin2-ps2-201ENSMUST00000116186 778 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
RxraP28700 Rps12-ps7-201ENSMUST00000117169 385 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm12937-201ENSMUST00000118333 448 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm7746-201ENSMUST00000120966 503 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm12205-201ENSMUST00000133940 575 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm15932-201ENSMUST00000135068 535 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
RxraP28700 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm6133-201ENSMUST00000164064 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
RxraP28700 4430402I18Rik-206ENSMUST00000164777 1066 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm17096-201ENSMUST00000172037 733 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm20454-201ENSMUST00000172713 221 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm25675-201ENSMUST00000174979 118 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm23632-201ENSMUST00000175289 125 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
RxraP28700 Mir5617-201ENSMUST00000176786 57 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
RxraP28700 Pfdn6-206ENSMUST00000179418 514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm26537-201ENSMUST00000181474 652 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
RxraP28700 Rpl9-ps1-202ENSMUST00000182502 576 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm10136-201ENSMUST00000183196 435 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
RxraP28700 Mir6367-201ENSMUST00000183385 102 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm27167-201ENSMUST00000183752 511 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
RxraP28700 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm28985-201ENSMUST00000189261 356 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm5853-201ENSMUST00000197183 632 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm43576-201ENSMUST00000197937 871 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm43906-201ENSMUST00000203194 906 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm2225-201ENSMUST00000209570 377 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm45626-201ENSMUST00000210093 361 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm19201-201ENSMUST00000210127 778 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
RxraP28700 AC069561.1-201ENSMUST00000213750 424 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
RxraP28700 Olfr976-203ENSMUST00000217360 1164 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
RxraP28700 AC153955.1-201ENSMUST00000217458 663 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
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