Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Vmn2r88-201ENSMUST00000022438 2574 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Prkag2os2-201ENSMUST00000123610 1432 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 AC160029.1-201ENSMUST00000219628 2678 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 5830432E09Rik-201ENSMUST00000180693 3569 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Olfr826-202ENSMUST00000203720 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm26899-201ENSMUST00000181963 3328 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm42885-201ENSMUST00000200763 4214 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Pabpc4l-201ENSMUST00000166505 5218 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Adam3-209ENSMUST00000171438 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm20644-201ENSMUST00000176721 2063 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 G6pc2-202ENSMUST00000112317 1749 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm26563-201ENSMUST00000181003 1704 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Abi1-212ENSMUST00000153931 2729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 CT025619.3-201ENSMUST00000216299 3267 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gmfg-202ENSMUST00000108289 477 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Svs3a-202ENSMUST00000109370 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Pigp-201ENSMUST00000113905 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm11864-201ENSMUST00000116179 1220 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm11987-201ENSMUST00000118524 381 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm7571-201ENSMUST00000120252 927 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm14528-201ENSMUST00000120615 231 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Defa-ps14-201ENSMUST00000121373 418 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Olfr408-ps1-201ENSMUST00000121710 941 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 4930480G23Rik-201ENSMUST00000125909 1013 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm9697-201ENSMUST00000147052 997 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm24444-201ENSMUST00000157244 308 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm17521-201ENSMUST00000165345 468 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Smarca2-204ENSMUST00000175791 946 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm20797-201ENSMUST00000177894 383 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm6556-201ENSMUST00000181118 362 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm8883-202ENSMUST00000188258 545 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm28956-201ENSMUST00000189047 427 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm21292-202ENSMUST00000190329 1225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm18340-201ENSMUST00000196342 609 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm44058-201ENSMUST00000204335 467 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm9240-201ENSMUST00000206527 742 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm45228-201ENSMUST00000206585 352 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm18414-201ENSMUST00000210858 694 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm45703-201ENSMUST00000212293 891 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Olfr1075-ps1-201ENSMUST00000214201 470 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Olfr1500-206ENSMUST00000217079 1025 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 4930521O17Rik-201ENSMUST00000219339 491 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm41002-201ENSMUST00000222479 312 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 AC165287.1-201ENSMUST00000224985 178 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 AC134869.2-201ENSMUST00000225788 421 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 AC129537.1-202ENSMUST00000226619 430 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 CT009550.2-201ENSMUST00000228851 399 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Mgat4d-201ENSMUST00000038692 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Olfr1367-201ENSMUST00000059216 1055 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Defb34-201ENSMUST00000064475 246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm23628-201ENSMUST00000082464 173 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm25404-201ENSMUST00000082970 107 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Ighv1-13-201ENSMUST00000095364 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 CT009480.2-201ENSMUST00000225152 3369 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm6823-201ENSMUST00000120791 1839 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm44289-201ENSMUST00000204144 1390 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 4833407H14Rik-201ENSMUST00000180442 1485 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm45201-201ENSMUST00000207187 2679 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Olfr1361-202ENSMUST00000214321 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Zranb1-205ENSMUST00000215716 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm43953-201ENSMUST00000203709 2867 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm26745-201ENSMUST00000181022 1874 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Ttll4-202ENSMUST00000113678 3762 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Olfr212-202ENSMUST00000218028 2291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Zscan4d-201ENSMUST00000067210 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Pm20d1-202ENSMUST00000112393 6900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 C130075A20Rik-201ENSMUST00000198178 4176 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Fhl4-201ENSMUST00000059383 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gucy1a3-201ENSMUST00000048976 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Zfp128-202ENSMUST00000144578 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm42841-201ENSMUST00000199806 1932 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Ttc41-202ENSMUST00000075632 4366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm38077-201ENSMUST00000193657 3245 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm25546-201ENSMUST00000103977 132 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm13768-201ENSMUST00000116469 929 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm15078-201ENSMUST00000118371 782 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm13858-201ENSMUST00000118862 671 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm13788-201ENSMUST00000120767 601 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm15522-201ENSMUST00000134467 785 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 4930548K13Rik-201ENSMUST00000154459 561 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm3513-201ENSMUST00000161319 637 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Vmn1r174-201ENSMUST00000167551 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Vmn1r1-201ENSMUST00000169123 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm10074-201ENSMUST00000174543 249 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm24824-201ENSMUST00000175097 78 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm15251-201ENSMUST00000177947 883 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 AF067061-201ENSMUST00000179905 1174 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm27522-201ENSMUST00000183949 230 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm28542-201ENSMUST00000185545 696 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm28185-201ENSMUST00000186815 694 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm29659-201ENSMUST00000187063 696 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm28682-201ENSMUST00000187430 696 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm28738-201ENSMUST00000187480 696 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm29319-201ENSMUST00000188060 696 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm29312-201ENSMUST00000188724 696 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm29637-201ENSMUST00000188877 696 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm28981-201ENSMUST00000190863 1288 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 153.4 ms