Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm15337-201ENSMUST00000135378 3888 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Vmn2r-ps44-201ENSMUST00000174053 2412 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Gm28600-202ENSMUST00000189502 1495 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Usp25-201ENSMUST00000023580 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Abcb7-201ENSMUST00000033695 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Gm15189-201ENSMUST00000121164 1966 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 March1-203ENSMUST00000098708 4000 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Pls3-203ENSMUST00000114058 3032 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Scn7a-201ENSMUST00000042792 7338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 AC164297.2-201ENSMUST00000224388 1508 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Fbxw18-201ENSMUST00000098359 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Gm25311-201ENSMUST00000104136 132 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 H2al2a-201ENSMUST00000105001 542 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Plac1-202ENSMUST00000114843 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Gm6743-201ENSMUST00000117345 1066 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Gm13566-201ENSMUST00000117428 1142 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Gm9506-201ENSMUST00000118516 320 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Gm7058-201ENSMUST00000119209 902 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 4930402H24Rik-203ENSMUST00000119422 3815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Gm15129-201ENSMUST00000119673 279 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Rpl15-ps1-201ENSMUST00000120694 564 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Gm12321-201ENSMUST00000121485 804 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Gm15056-201ENSMUST00000122025 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Dnah2os-201ENSMUST00000124108 859 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Fam229b-202ENSMUST00000124941 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Gm16726-201ENSMUST00000130184 892 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Gm11802-201ENSMUST00000137749 653 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Stau2-209ENSMUST00000145092 564 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Gm25717-201ENSMUST00000158631 353 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Rsph10b-204ENSMUST00000169758 702 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Wdr64-202ENSMUST00000171939 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Gm8895-201ENSMUST00000172300 1223 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Gm6726-201ENSMUST00000172786 681 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Gm3585-201ENSMUST00000173438 875 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Gm20490-201ENSMUST00000173622 198 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Gm23633-201ENSMUST00000175293 119 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Pantr1-203ENSMUST00000176154 514 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 1110032A03Rik-209ENSMUST00000177546 647 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Gm21959-201ENSMUST00000178439 452 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 1700022N22Rik-201ENSMUST00000180932 709 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Gm27507-201ENSMUST00000184199 93 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Gm19585-201ENSMUST00000186007 587 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Gm8883-201ENSMUST00000187594 454 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 B230112G18Rik-201ENSMUST00000192979 851 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Gm18985-201ENSMUST00000196472 1079 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Gm42640-201ENSMUST00000199792 1195 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Gm29759-201ENSMUST00000205860 327 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Gm45196-201ENSMUST00000206751 825 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Gm4290-201ENSMUST00000206897 814 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 4930465I24Rik-201ENSMUST00000209697 426 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Nxpe1-ps-203ENSMUST00000210879 822 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 4933404K13Rik-201ENSMUST00000214651 937 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 AC134606.1-201ENSMUST00000216324 721 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 AC164550.1-201ENSMUST00000217821 1066 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 CT025667.1-201ENSMUST00000225872 382 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Orm1-201ENSMUST00000030044 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Rbp7-201ENSMUST00000030848 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Olfr574-201ENSMUST00000052997 1041 ntAPPRIS P2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Gm5341-201ENSMUST00000058881 489 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Olfr1457-201ENSMUST00000075170 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Vmn1r237-201ENSMUST00000077301 950 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Cd40-203ENSMUST00000081310 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Gm6166-201ENSMUST00000098689 409 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Olfr1085-201ENSMUST00000099879 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Cwf19l1-201ENSMUST00000026218 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Nat8f2-201ENSMUST00000045008 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Ugt2a1-201ENSMUST00000147854 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Vmn2r115-201ENSMUST00000168175 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Gm43426-201ENSMUST00000197287 2597 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Asah2-201ENSMUST00000096119 4682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 BC046251-201ENSMUST00000154632 3653 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 AC131747.2-201ENSMUST00000226121 1895 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 4930402F06Rik-202ENSMUST00000113010 1372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Gm4787-201ENSMUST00000062182 2474 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Zfp35-201ENSMUST00000074941 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Sptlc3-201ENSMUST00000047370 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Klhl24-201ENSMUST00000023509 6683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Gm37864-201ENSMUST00000195308 3075 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Rbmy-201ENSMUST00000100360 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Gm10256-202ENSMUST00000188114 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Gm21708-203ENSMUST00000190283 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Foxr2-201ENSMUST00000096265 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Ptprq-201ENSMUST00000050702 7393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Akap11-201ENSMUST00000022593 5688 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 4930555F03Rik-202ENSMUST00000126285 3604 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Homer1-203ENSMUST00000080127 3052 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Mug-ps1-201ENSMUST00000186891 4386 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Atp6v1g3-201ENSMUST00000027643 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Lpp-203ENSMUST00000115314 14854 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Ighv1-53-201ENSMUST00000103523 351 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Ighv1-69-201ENSMUST00000103539 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Gm13030-201ENSMUST00000105805 655 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms