Protein–RNA interactions for Protein: B1AUS7

Ssxa1, Protein SSXA1, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxa1B1AUS7 Gm44697-201ENSMUST00000207756 1679 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Gm21051-201ENSMUST00000221757 1688 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Gm34121-201ENSMUST00000206188 1490 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Wnk1-218ENSMUST00000161512 1426 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Tmem45a2-203ENSMUST00000227043 1447 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Ckap5-203ENSMUST00000111337 6384 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Gm13870-201ENSMUST00000117214 1023 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Gm14375-201ENSMUST00000119490 855 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Gm14272-201ENSMUST00000133525 484 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Gm15471-201ENSMUST00000145893 625 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Gm23954-201ENSMUST00000157213 353 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Gm23553-201ENSMUST00000157817 295 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Gm7008-203ENSMUST00000171356 476 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Gm5624-202ENSMUST00000178184 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Gm6526-202ENSMUST00000179860 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Anapc13-202ENSMUST00000186693 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Gm43233-201ENSMUST00000200491 616 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Gm4548-201ENSMUST00000208487 509 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Gm45326-201ENSMUST00000209234 721 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Gm45479-201ENSMUST00000211613 802 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Gm8863-201ENSMUST00000216630 926 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Gm2614-201ENSMUST00000223227 403 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 AC154461.5-201ENSMUST00000225429 774 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Gm22581-201ENSMUST00000083735 136 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Vmn1r6-202ENSMUST00000226689 8453 ntAPPRIS P2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Mef2c-214ENSMUST00000197722 3517 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Olfr1175-ps-201ENSMUST00000214207 5552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Gm43842-201ENSMUST00000202890 2982 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Samd8-202ENSMUST00000119430 6801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Slc17a3-201ENSMUST00000039721 4276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Gm44229-201ENSMUST00000203211 2487 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Olfr20-202ENSMUST00000120137 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Acaca-202ENSMUST00000103201 9513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Trim16-203ENSMUST00000108703 3574 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Gm45061-201ENSMUST00000204395 2095 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Slmap-201ENSMUST00000038522 4501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Gm2309-201ENSMUST00000149994 1941 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Gramd1c-203ENSMUST00000179565 3159 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 9530026P05Rik-202ENSMUST00000181145 2968 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Epgn-201ENSMUST00000041516 1760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Gm8878-201ENSMUST00000173552 1725 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Olfr1513-202ENSMUST00000215147 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Ssxa1B1AUS7 Fam227b-202ENSMUST00000110448 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Ssxa1B1AUS7 Gm26994-201ENSMUST00000182027 1571 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Ssxa1B1AUS7 Olfr559-202ENSMUST00000215657 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Abi3bp-201ENSMUST00000048471 4687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Gm31520-202ENSMUST00000203574 1524 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Oxr1-207ENSMUST00000179393 4498 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Ssxa1B1AUS7 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Ssxa1B1AUS7 Obox7-201ENSMUST00000069740 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Ift80-201ENSMUST00000029347 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Ssxa1B1AUS7 Gm16079-201ENSMUST00000149065 578 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Ssxa1B1AUS7 1700108F19Rik-203ENSMUST00000188798 619 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Ssxa1B1AUS7 4930542C16Rik-203ENSMUST00000212108 1207 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 AC153821.1-201ENSMUST00000217893 581 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 AC140930.1-201ENSMUST00000221889 389 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Gm9292-201ENSMUST00000222008 710 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Gm18618-201ENSMUST00000222211 473 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Gm10095-201ENSMUST00000222765 483 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Smim15-202ENSMUST00000223808 808 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Ssxa1B1AUS7 Pcdh15-203ENSMUST00000105424 6932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Vmn1r15-201ENSMUST00000228297 2021 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Gm44215-201ENSMUST00000204910 2711 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Cep70-201ENSMUST00000093795 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Kcnma1-209ENSMUST00000179097 4596 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Cyp2c68-201ENSMUST00000099472 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Gm16170-201ENSMUST00000156882 3754 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Lrrc49-201ENSMUST00000053171 3086 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Smgc-202ENSMUST00000100293 2878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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