Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm39129-201ENSMUST00000207553 806 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Ppp1r36-204ENSMUST00000220187 504 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Elk3-205ENSMUST00000223340 750 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 AC161252.1-201ENSMUST00000225536 467 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Lcn9-201ENSMUST00000023978 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Olfr124-201ENSMUST00000053599 1122 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm5341-201ENSMUST00000058881 489 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Olfr365-201ENSMUST00000074168 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm10799-201ENSMUST00000099666 312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Atf2-205ENSMUST00000112010 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Atf2-202ENSMUST00000090802 4016 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Olfr947-ps1-203ENSMUST00000215471 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm40649-201ENSMUST00000219795 1457 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 4930480E11Rik-201ENSMUST00000035626 1486 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Mum1l1-202ENSMUST00000113042 4182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Zfp804b-201ENSMUST00000164784 3924 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Birc6-223ENSMUST00000183224 14562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Olfr195-202ENSMUST00000216957 2077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm17094-201ENSMUST00000169881 3334 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gramd1b-204ENSMUST00000121357 7334 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Them5-202ENSMUST00000198083 1378 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm39465-201ENSMUST00000213810 9813 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Rfx4-203ENSMUST00000095388 3274 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Pcdh15-204ENSMUST00000105426 6802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Hus1-201ENSMUST00000020683 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm6526-201ENSMUST00000100643 1723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm21123-201ENSMUST00000210822 1734 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Olfr1380-202ENSMUST00000215360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm43682-201ENSMUST00000202150 2090 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Igkv15-103-201ENSMUST00000103324 375 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Igkv4-68-201ENSMUST00000103350 394 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Igkv4-59-201ENSMUST00000103354 368 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm12790-201ENSMUST00000106916 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm13626-201ENSMUST00000119435 402 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm13207-201ENSMUST00000119862 773 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Fyttd1-202ENSMUST00000120345 648 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm11545-201ENSMUST00000146507 375 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm15401-203ENSMUST00000156497 378 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Rpain-213ENSMUST00000178822 566 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm43157-201ENSMUST00000198223 412 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Rpl7-ps7-201ENSMUST00000200912 799 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm45127-201ENSMUST00000205984 1015 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm44984-201ENSMUST00000207802 394 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 4930435C17Rik-202ENSMUST00000210759 974 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm45334-201ENSMUST00000211118 1227 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm45485-201ENSMUST00000211229 357 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 AC112680.2-201ENSMUST00000213119 595 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm34829-202ENSMUST00000216017 1131 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 AC137871.3-201ENSMUST00000226628 225 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 AC102139.1-201ENSMUST00000227000 251 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gkn3-201ENSMUST00000032127 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Wdr83os-201ENSMUST00000079764 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Olfr1198-201ENSMUST00000099814 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Fam196b-202ENSMUST00000165963 5371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Errfi1-202ENSMUST00000073600 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Tmem167b-202ENSMUST00000106622 2752 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Olfr610-203ENSMUST00000217627 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Pcdh15-205ENSMUST00000105429 6719 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Kdm5d-201ENSMUST00000055032 7974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Cdh17-202ENSMUST00000108303 3287 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Olfr1390-202ENSMUST00000215014 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 AC153971.1-201ENSMUST00000215097 3811 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Sntg1-204ENSMUST00000132064 4165 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Oat-rs1-201ENSMUST00000122186 1311 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Dcun1d4-202ENSMUST00000087181 4117 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Crnn-201ENSMUST00000107300 1628 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm18716-201ENSMUST00000204507 1603 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm25795-201ENSMUST00000104421 132 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm15901-201ENSMUST00000117663 941 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm6884-201ENSMUST00000119318 615 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm12923-201ENSMUST00000127060 667 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Serpina3d-ps-201ENSMUST00000163110 1272 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm17174-201ENSMUST00000178962 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm28616-201ENSMUST00000187344 441 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm29587-201ENSMUST00000189898 332 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Ighv1-10-201ENSMUST00000194372 355 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm8869-201ENSMUST00000195222 947 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 6720469O03Rik-201ENSMUST00000206785 1201 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 CAAA01216754.4-203ENSMUST00000217178 1097 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm4803-201ENSMUST00000218729 1279 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 AC154481.1-201ENSMUST00000223532 331 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 CT030254.1-201ENSMUST00000225450 1078 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm25133-201ENSMUST00000082647 130 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Olfr519-201ENSMUST00000084752 960 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Lgi1-209ENSMUST00000199812 2262 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Mat2a-206ENSMUST00000206692 1400 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm10636-201ENSMUST00000197639 2419 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm21284-201ENSMUST00000205532 3736 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Sptlc3-202ENSMUST00000110083 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Atp2b4-206ENSMUST00000143567 11725 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms