Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Gm9652-201ENSMUST00000209345 163 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Gm31036-201ENSMUST00000212925 521 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 AC113204.1-203ENSMUST00000219475 375 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 AC124420.1-201ENSMUST00000219779 791 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Gm18591-201ENSMUST00000220568 763 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 AC099934.5-201ENSMUST00000222699 945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 AC131117.2-202ENSMUST00000224539 547 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 AC154806.1-203ENSMUST00000227370 1032 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Bpifa2-201ENSMUST00000048103 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Nckap5-203ENSMUST00000094610 739 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Olfr199-201ENSMUST00000099657 931 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Slfn8-206ENSMUST00000215239 2930 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Ugt2a2-201ENSMUST00000079811 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Itih4-203ENSMUST00000120269 3531 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Gm20750-201ENSMUST00000194274 3515 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Fancd2-201ENSMUST00000036340 5512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Gm17021-202ENSMUST00000214413 2371 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Nxf7-201ENSMUST00000033784 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Spef2-201ENSMUST00000041840 4247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Med13-201ENSMUST00000043624 10546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Gm34639-201ENSMUST00000222648 2241 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 AC154841.1-201ENSMUST00000227263 1479 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Zfp605-201ENSMUST00000086686 2085 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Mageb18-201ENSMUST00000088137 1571 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 A230103L15Rik-201ENSMUST00000207198 3872 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Papolg-201ENSMUST00000020513 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Tmprss15-201ENSMUST00000023566 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Gm38036-201ENSMUST00000194586 3564 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Vmn2r4-202ENSMUST00000175724 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Vmn2r6-202ENSMUST00000176481 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Gm44043-201ENSMUST00000203426 3253 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Dcun1d1-203ENSMUST00000178098 4434 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Eppin-201ENSMUST00000103100 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Zfp973-201ENSMUST00000108985 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Rpl31-ps10-201ENSMUST00000116034 378 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Gm12468-201ENSMUST00000116189 404 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Gm13141-201ENSMUST00000117417 456 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Gm12937-201ENSMUST00000118333 448 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Rpl31-ps11-201ENSMUST00000119898 377 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Rpl31-ps12-201ENSMUST00000119957 375 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Gm2200-201ENSMUST00000124814 764 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Gm16224-201ENSMUST00000127711 412 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Gm2117-201ENSMUST00000130478 764 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Gm2101-202ENSMUST00000131997 764 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Gm11657-201ENSMUST00000137175 337 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Gm2165-203ENSMUST00000137981 764 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Gm3669-204ENSMUST00000140946 764 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 1700086P04Rik-201ENSMUST00000149472 1009 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Gm22094-201ENSMUST00000158976 117 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 4930405H06Rik-201ENSMUST00000159244 791 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Gm15647-201ENSMUST00000160178 691 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Mpped2-201ENSMUST00000016530 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Zfp169-202ENSMUST00000167682 411 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Gm9529-201ENSMUST00000177598 579 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Rpl31-ps8-201ENSMUST00000181935 378 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Mir6348-201ENSMUST00000183804 120 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Mir7033-201ENSMUST00000184259 81 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Gm27617-201ENSMUST00000184321 168 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Gm29093-201ENSMUST00000187366 409 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Gm28289-201ENSMUST00000189331 315 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Gm37103-201ENSMUST00000191830 115 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 2310046K23Rik-201ENSMUST00000193521 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Rpl31-206ENSMUST00000195123 356 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Gm38328-201ENSMUST00000195582 317 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Gm43383-201ENSMUST00000195981 469 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 4930563F08Rik-201ENSMUST00000198640 515 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Gm9057-201ENSMUST00000198791 296 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Gm4585-201ENSMUST00000207218 452 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Olfr1449-202ENSMUST00000208624 1296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Gm2398-201ENSMUST00000218347 883 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Dpm2-201ENSMUST00000028151 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Arhgdib-201ENSMUST00000032344 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Vmn1r89-201ENSMUST00000053008 951 ntAPPRIS P2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Rpl31-ps4-201ENSMUST00000079114 390 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Defa17-201ENSMUST00000079528 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 n-R5s217-201ENSMUST00000083341 116 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Rpl31-ps9-201ENSMUST00000086596 378 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Gm10705-201ENSMUST00000098980 461 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Iqch-201ENSMUST00000042322 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Herc1-201ENSMUST00000042824 15153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Slc28a2-201ENSMUST00000028652 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Gm43857-201ENSMUST00000200343 3079 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Gm32122-201ENSMUST00000212119 2259 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Mfap3-203ENSMUST00000108849 4827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 C4bp-201ENSMUST00000027657 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Gm16751-201ENSMUST00000142212 1685 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Gm16092-201ENSMUST00000161449 2405 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Txndc9-201ENSMUST00000162031 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Kat6b-ps2-201ENSMUST00000188339 1600 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Ryr3-211ENSMUST00000208290 15468 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Iqca-201ENSMUST00000113094 3210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Gm37262-201ENSMUST00000192816 1818 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Slc5a3-201ENSMUST00000113975 10913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Olfr75-ps1-203ENSMUST00000144832 2655 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Gm37082-201ENSMUST00000192629 1927 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Olfr1062-203ENSMUST00000217481 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Samt1A2BED8 Igkv3-5-201ENSMUST00000103400 382 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms