Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Mospd2-202ENSMUST00000112247 2479 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 AC120375.1-201ENSMUST00000227034 3612 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Fat1-201ENSMUST00000098796 14627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Cftr-204ENSMUST00000129452 2835 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm12185-201ENSMUST00000059930 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 AC162908.1-201ENSMUST00000219164 4563 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Zfp369-202ENSMUST00000126879 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Cxcr1-202ENSMUST00000190313 1451 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Nfat5-202ENSMUST00000077440 12773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Fat2-201ENSMUST00000068853 14528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm25724-201ENSMUST00000104531 117 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Foxp2-202ENSMUST00000115469 1293 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Rpl31-ps10-201ENSMUST00000116034 378 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm11903-201ENSMUST00000118958 727 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Chchd7-204ENSMUST00000119403 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Rpl31-ps11-201ENSMUST00000119898 377 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Rpl31-ps12-201ENSMUST00000119957 375 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm13735-201ENSMUST00000120217 670 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm13754-201ENSMUST00000120486 998 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Nlk-ps1-201ENSMUST00000120843 1230 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm22276-201ENSMUST00000122469 129 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm14503-201ENSMUST00000130337 1164 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Fam229b-209ENSMUST00000149949 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm12031-201ENSMUST00000156150 627 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Serpina3d-ps-201ENSMUST00000163110 1272 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Mir3060-201ENSMUST00000175339 83 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm22701-201ENSMUST00000175371 291 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Rpl31-ps8-201ENSMUST00000181935 378 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm29385-201ENSMUST00000186831 363 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm37190-201ENSMUST00000193580 688 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Ighv1-21-201ENSMUST00000194856 351 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Rpl31-206ENSMUST00000195123 356 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 1700094M23Rik-202ENSMUST00000198047 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Pde6h-203ENSMUST00000204382 211 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 2200002A13Rik-201ENSMUST00000206633 709 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm4032-201ENSMUST00000210886 487 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm18940-201ENSMUST00000222518 871 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Dbi-201ENSMUST00000027634 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Olfr1378-201ENSMUST00000052285 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Ppih-201ENSMUST00000056458 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Rpl31-ps4-201ENSMUST00000079114 390 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 n-R5s169-201ENSMUST00000083110 120 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Mir194-1-201ENSMUST00000083647 67 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Rpl31-ps9-201ENSMUST00000086596 378 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Bex6-201ENSMUST00000099990 764 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Nfia-201ENSMUST00000052018 9249 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Iqca-207ENSMUST00000212394 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Nsun6-201ENSMUST00000028034 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Oat-rs1-201ENSMUST00000122186 1311 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Pdzd9-202ENSMUST00000127845 1327 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Dhrs9-201ENSMUST00000063690 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Dnah8-201ENSMUST00000170651 14583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm21846-201ENSMUST00000179257 3073 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm6866-202ENSMUST00000206653 3081 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Ostn-201ENSMUST00000066852 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Klhl24-201ENSMUST00000023509 6683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm6882-202ENSMUST00000207192 2365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Rapgef4-203ENSMUST00000102698 2982 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Lpp-203ENSMUST00000115314 14854 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Cnot1-202ENSMUST00000098473 8390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm15457-201ENSMUST00000129513 3990 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm44518-201ENSMUST00000208080 4370 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm25396-201ENSMUST00000103981 133 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm11011-201ENSMUST00000109160 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Fam107b-204ENSMUST00000115054 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Dnajc5b-202ENSMUST00000118735 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm14466-201ENSMUST00000119028 451 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm15493-201ENSMUST00000119461 528 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm13357-201ENSMUST00000120528 537 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm14515-201ENSMUST00000121327 216 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm13462-201ENSMUST00000121472 961 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm12860-201ENSMUST00000148457 957 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm23762-201ENSMUST00000158348 106 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm22523-201ENSMUST00000158696 100 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Mpped2-201ENSMUST00000016530 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm15056-202ENSMUST00000167686 314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Sh3bgr-207ENSMUST00000171181 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm25574-201ENSMUST00000175245 249 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm5283-201ENSMUST00000177874 334 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm27204-201ENSMUST00000184673 527 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Mir6987-201ENSMUST00000184789 73 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm42428-201ENSMUST00000198677 302 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Fabp7-201ENSMUST00000020024 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 4930513N20Rik-201ENSMUST00000207466 1265 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm18255-201ENSMUST00000211316 765 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm1715-201ENSMUST00000213681 1018 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 AC153954.2-201ENSMUST00000213811 287 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 AC113204.1-203ENSMUST00000219475 375 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 AC154248.1-201ENSMUST00000222072 495 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm41002-201ENSMUST00000222479 312 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 AC122937.2-201ENSMUST00000228258 1051 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 AC154738.4-201ENSMUST00000228310 414 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Hmgn5-201ENSMUST00000033597 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Gm43426-201ENSMUST00000197287 2597 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 AC163354.1-201ENSMUST00000220620 1630 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 1700019D03Rik-203ENSMUST00000114493 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Gm45426-201ENSMUST00000209393 3672 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
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