Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 4930587A21Rik-201ENSMUST00000128588 851 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm14401-204ENSMUST00000134614 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 4933431E20Rik-206ENSMUST00000138472 483 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm2976-201ENSMUST00000160362 513 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm9672-201ENSMUST00000166437 425 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm8220-202ENSMUST00000169601 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm44-201ENSMUST00000172155 993 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm22690-201ENSMUST00000175054 110 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Snhg5-201ENSMUST00000180563 1004 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm26653-201ENSMUST00000181537 1214 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm28739-201ENSMUST00000185415 696 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm28219-201ENSMUST00000185452 696 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm28542-201ENSMUST00000185545 696 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm28303-201ENSMUST00000185642 747 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm29244-201ENSMUST00000185825 696 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm29437-201ENSMUST00000185865 696 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm29412-201ENSMUST00000185869 696 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm28910-201ENSMUST00000185921 696 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm28812-201ENSMUST00000185963 696 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm29468-201ENSMUST00000185978 696 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 1700044C05Rik-201ENSMUST00000186060 898 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm28335-201ENSMUST00000186204 696 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm28854-201ENSMUST00000186218 696 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm28636-201ENSMUST00000186353 696 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm28452-201ENSMUST00000186623 696 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm29298-201ENSMUST00000186704 696 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm28185-201ENSMUST00000186815 694 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm28227-201ENSMUST00000186862 696 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm28796-201ENSMUST00000186905 696 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm29659-201ENSMUST00000187063 696 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm28473-201ENSMUST00000187325 696 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm28558-201ENSMUST00000187373 696 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm28682-201ENSMUST00000187430 696 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm28738-201ENSMUST00000187480 696 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm28949-201ENSMUST00000187805 696 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm28773-201ENSMUST00000187925 696 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm29319-201ENSMUST00000188060 696 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm29422-201ENSMUST00000188062 694 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm28734-201ENSMUST00000188104 696 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm28787-201ENSMUST00000188357 696 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm29312-201ENSMUST00000188724 696 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm29451-201ENSMUST00000188862 696 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm29637-201ENSMUST00000188877 696 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm29033-201ENSMUST00000189114 696 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm29614-201ENSMUST00000189263 694 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm28751-201ENSMUST00000189287 696 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm29559-201ENSMUST00000189412 696 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm28272-201ENSMUST00000189512 696 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm28483-201ENSMUST00000189519 696 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm28123-201ENSMUST00000189725 696 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm28368-201ENSMUST00000189804 696 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm29119-201ENSMUST00000189973 696 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm28716-201ENSMUST00000190217 696 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm29239-201ENSMUST00000190304 696 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm28837-201ENSMUST00000190397 696 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm28968-201ENSMUST00000190413 696 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm28531-201ENSMUST00000190529 696 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm28165-201ENSMUST00000190669 694 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm29181-201ENSMUST00000191288 696 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm38229-201ENSMUST00000191931 696 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm32347-201ENSMUST00000192944 696 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm38121-201ENSMUST00000193213 696 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm38035-201ENSMUST00000194427 696 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm38350-201ENSMUST00000194789 696 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm37990-201ENSMUST00000195821 696 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm43470-201ENSMUST00000196175 454 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm8479-201ENSMUST00000203825 718 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm44386-201ENSMUST00000204288 429 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm44590-201ENSMUST00000206161 391 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Aldoa-ps4-201ENSMUST00000216332 753 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 AC159886.1-201ENSMUST00000217099 1091 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 AC122539.1-201ENSMUST00000219925 329 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm19073-201ENSMUST00000219978 555 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm30239-201ENSMUST00000220776 780 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 AC131117.1-201ENSMUST00000225154 1171 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 AC124489.1-201ENSMUST00000225852 526 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 1700019A02Rik-201ENSMUST00000072235 646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Olfr933-201ENSMUST00000075680 1003 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Olfr1360-201ENSMUST00000079135 980 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm25189-201ENSMUST00000083911 164 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Prl2c3-201ENSMUST00000099805 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Pter-203ENSMUST00000134794 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Zbed6-201ENSMUST00000190574 5007 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Slc10a5-201ENSMUST00000078748 3923 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Rgs17-204ENSMUST00000131996 8107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Cx3cr1-202ENSMUST00000177637 3156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Dtna-203ENSMUST00000220904 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Stx17-202ENSMUST00000107720 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gk-208ENSMUST00000156390 4245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm17017-201ENSMUST00000161540 2405 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Asxl3-202ENSMUST00000120223 11485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Olfr651-203ENSMUST00000216904 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Pramel4-203ENSMUST00000094520 2297 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm37255-201ENSMUST00000193302 3060 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Dlg2-204ENSMUST00000107196 7490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm15182-201ENSMUST00000120832 1676 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Serpinb6c-202ENSMUST00000172184 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm5594-201ENSMUST00000172712 1429 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm26544-201ENSMUST00000181404 2763 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms