Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm28108-201ENSMUST00000186747 1497 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm28218-202ENSMUST00000186782 1498 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm29511-201ENSMUST00000187580 1497 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm28475-201ENSMUST00000187645 1497 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm28367-201ENSMUST00000187942 1496 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm29555-201ENSMUST00000188620 1497 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm29549-202ENSMUST00000189569 1497 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm29450-201ENSMUST00000189657 1497 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm29278-202ENSMUST00000189701 1497 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm29381-201ENSMUST00000190168 1497 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm28259-201ENSMUST00000190319 1497 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Map2-202ENSMUST00000077355 5125 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Scml2-205ENSMUST00000101113 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Vwde-201ENSMUST00000054530 3979 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm30292-201ENSMUST00000194198 3000 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm37914-201ENSMUST00000195317 2679 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm45634-201ENSMUST00000209736 1990 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Igkv8-27-201ENSMUST00000103381 300 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm23485-201ENSMUST00000104181 155 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Sult2a5-201ENSMUST00000108525 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Uqcrq-202ENSMUST00000109019 504 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 2010106E10Rik-202ENSMUST00000113412 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Pigp-201ENSMUST00000113905 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Fpr3-202ENSMUST00000115565 1220 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm12643-201ENSMUST00000116078 374 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm15000-201ENSMUST00000118275 1243 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm11833-201ENSMUST00000118393 853 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm12903-201ENSMUST00000121015 544 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm14229-201ENSMUST00000121178 850 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm15488-201ENSMUST00000121682 670 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm7879-201ENSMUST00000122204 774 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm16373-201ENSMUST00000129517 303 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Tsc22d1-205ENSMUST00000133224 786 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Olfr367-ps-202ENSMUST00000143957 942 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Etaa1os-202ENSMUST00000148496 388 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm16015-201ENSMUST00000154897 390 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm10012-202ENSMUST00000170379 372 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r-ps79-201ENSMUST00000173508 963 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r-ps70-201ENSMUST00000173675 963 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm44370-201ENSMUST00000175436 112 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Trav12d-3-201ENSMUST00000177703 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm5283-201ENSMUST00000177874 334 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Zcchc10-201ENSMUST00000018383 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm21181-201ENSMUST00000186249 330 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm18181-201ENSMUST00000190670 736 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm18775-201ENSMUST00000190763 586 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm28927-201ENSMUST00000191528 272 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm38068-201ENSMUST00000192546 540 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm37152-201ENSMUST00000193369 1175 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm37196-201ENSMUST00000194762 906 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Igkv13-73-1-201ENSMUST00000196767 200 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 2010309G21Rik-201ENSMUST00000198927 458 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm31881-202ENSMUST00000199455 559 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm31693-201ENSMUST00000200150 909 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm44050-201ENSMUST00000204263 527 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 2310001K20Rik-201ENSMUST00000206600 951 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 C030038I04Rik-201ENSMUST00000207840 740 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm36843-201ENSMUST00000209303 627 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm36247-201ENSMUST00000211834 285 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm7943-201ENSMUST00000212078 1034 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm45823-201ENSMUST00000212714 515 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Odf3l1-202ENSMUST00000215694 1212 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Rabgef1Q9JM13 AC112274.2-201ENSMUST00000218436 170 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm19181-201ENSMUST00000218891 940 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm4052-201ENSMUST00000220890 451 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 AC158535.1-201ENSMUST00000221487 769 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 AC238940.2-201ENSMUST00000224202 330 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 AC133598.2-201ENSMUST00000224302 624 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
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Rabgef1Q9JM13 1700003E24Rik-201ENSMUST00000088134 577 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Rabgef1Q9JM13 Gm42940-201ENSMUST00000200361 2362 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Adamts12-201ENSMUST00000061318 8579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 G6pc2-202ENSMUST00000112317 1749 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 1700017N19Rik-204ENSMUST00000188736 1709 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm37010-201ENSMUST00000194539 1704 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Slc26a7-201ENSMUST00000042221 5165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 BC003331-201ENSMUST00000006167 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Arhgap1-201ENSMUST00000090614 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Olfr1079-202ENSMUST00000111582 2141 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Zc3h12c-202ENSMUST00000213645 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm43059-201ENSMUST00000202437 1388 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Slc25a53-214ENSMUST00000171738 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 CT030170.4-203ENSMUST00000221062 1403 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm37216-201ENSMUST00000193817 3478 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm44116-201ENSMUST00000204269 1525 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 E430024I08Rik-202ENSMUST00000220632 1513 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Olfr43-202ENSMUST00000205664 2018 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r-ps73-201ENSMUST00000173130 2120 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 5830432E09Rik-201ENSMUST00000180693 3569 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Spag9-203ENSMUST00000075695 6910 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 3830408C21Rik-202ENSMUST00000223895 1689 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Usp17lc-201ENSMUST00000079348 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm9403-201ENSMUST00000196299 2181 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm45201-201ENSMUST00000207187 2679 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Kank4os-201ENSMUST00000133455 2251 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
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