Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Vps13b-201ENSMUST00000048646 13757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm2016-201ENSMUST00000110147 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Vps8-207ENSMUST00000122235 2521 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 AC161884.1-201ENSMUST00000225436 2174 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 AC117232.2-201ENSMUST00000219469 2917 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1-201ENSMUST00000120303 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16758-201ENSMUST00000149552 3848 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Trpm3-201ENSMUST00000037901 5082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37959-201ENSMUST00000191700 2897 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Pet2-201ENSMUST00000113959 4183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Pet2-202ENSMUST00000113960 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Ssxb10-201ENSMUST00000103003 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Ghr-202ENSMUST00000110697 1213 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr607-201ENSMUST00000119283 915 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13189-201ENSMUST00000138462 252 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 A630023P12Rik-204ENSMUST00000142879 524 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Ear-ps5-201ENSMUST00000164700 463 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Vmn1r176-201ENSMUST00000171073 915 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28973-201ENSMUST00000189310 613 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38015-201ENSMUST00000193048 188 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 4931440P22Rik-205ENSMUST00000194448 474 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38384-201ENSMUST00000195413 1122 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18325-201ENSMUST00000203228 835 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Ptprd-201ENSMUST00000050757 4698 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 4930578G10Rik-201ENSMUST00000068158 614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Myo16-202ENSMUST00000207204 6719 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38325-201ENSMUST00000194507 1377 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Asap1-215ENSMUST00000177035 3228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr982-201ENSMUST00000054051 5576 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Ltn1-201ENSMUST00000039449 7737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Pi4ka-201ENSMUST00000036161 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Cntn4-204ENSMUST00000113260 2531 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Mttp-202ENSMUST00000098580 3072 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15448-202ENSMUST00000108619 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Specc1-207ENSMUST00000201364 4955 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43745-201ENSMUST00000198085 1883 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5381-201ENSMUST00000117975 1250 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14755-201ENSMUST00000118037 384 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Spint4-201ENSMUST00000017454 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Prp2-202ENSMUST00000178961 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 4930519F24Rik-201ENSMUST00000185764 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29377-201ENSMUST00000185892 1161 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29467-202ENSMUST00000189669 935 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29633-207ENSMUST00000190523 737 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43744-201ENSMUST00000196387 688 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Mgam-206ENSMUST00000202779 3821 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm36423-204ENSMUST00000222446 541 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Kansl1-203ENSMUST00000106971 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Lrrc31-201ENSMUST00000108263 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr12-202ENSMUST00000213247 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1026-203ENSMUST00000219615 1465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Prkg1-201ENSMUST00000065067 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Cntrl-203ENSMUST00000113032 7085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Celf2-226ENSMUST00000183209 3852 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Syn3-202ENSMUST00000121789 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Satb1-214ENSMUST00000176669 4407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14871-201ENSMUST00000119056 194 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4911-201ENSMUST00000119388 945 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm23546-201ENSMUST00000158211 137 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Mir1963-201ENSMUST00000158594 59 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16028-201ENSMUST00000162347 890 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43743-202ENSMUST00000198353 491 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gng12-208ENSMUST00000204511 739 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm34549-202ENSMUST00000207356 970 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl29-ps2-202ENSMUST00000220540 1165 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl29-ps2-203ENSMUST00000222043 1036 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 AC154452.1-201ENSMUST00000225819 241 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm23238-201ENSMUST00000083007 164 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Mir188-201ENSMUST00000083464 68 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Myo1e-201ENSMUST00000034745 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc82-206ENSMUST00000217444 4736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Plxna4-201ENSMUST00000115096 12877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Ap5m1-208ENSMUST00000228238 3514 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Ep400-204ENSMUST00000112436 10685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Csmd2-205ENSMUST00000184063 13555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Smpd4-204ENSMUST00000163476 4532 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Stra6l-203ENSMUST00000107783 3669 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13579-201ENSMUST00000118519 517 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Mup-ps19-201ENSMUST00000120390 519 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Sspnos-201ENSMUST00000139089 826 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Vmn1r-ps11-201ENSMUST00000176097 853 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 1700003H04Rik-206ENSMUST00000180162 1086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp87-202ENSMUST00000181341 480 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26909-201ENSMUST00000181668 627 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Scgb1b34-ps-201ENSMUST00000187959 331 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 1810006J02Rik-202ENSMUST00000191060 523 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43516-201ENSMUST00000196891 322 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6290-201ENSMUST00000207666 1158 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm36908-201ENSMUST00000218080 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3785-201ENSMUST00000221000 202 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6049-201ENSMUST00000222369 458 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Slc38a2-201ENSMUST00000023099 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Tti1-201ENSMUST00000029179 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 1700003H04Rik-201ENSMUST00000047110 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm2531-201ENSMUST00000075609 512 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm35835-201ENSMUST00000214447 4589 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 AC154903.1-201ENSMUST00000222121 2705 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14151-201ENSMUST00000109890 2672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms