Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Gimd1-203ENSMUST00000212594 1432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Efcab14-201ENSMUST00000074425 4300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm28173-201ENSMUST00000191190 1496 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Cfhr2-201ENSMUST00000094489 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r77-202ENSMUST00000226525 8252 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Spata1-206ENSMUST00000197980 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 AC098728.1-202ENSMUST00000226656 2198 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm43789-201ENSMUST00000199275 2472 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Fryl-201ENSMUST00000094700 9852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 4933440M02Rik-201ENSMUST00000061823 3801 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm19368-201ENSMUST00000221258 4424 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Rfx4-203ENSMUST00000095388 3274 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm43953-201ENSMUST00000203709 2867 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r11-202ENSMUST00000226968 2522 ntAPPRIS P2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Olfr1015-203ENSMUST00000215945 2479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 4930422C21Rik-201ENSMUST00000212419 2362 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Atp2b4-206ENSMUST00000143567 11725 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Zfp266-201ENSMUST00000068296 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm44255-201ENSMUST00000203456 2053 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm10650-202ENSMUST00000196581 1969 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Fcrl6-201ENSMUST00000094303 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Pln-206ENSMUST00000220197 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 C430019N01Rik-201ENSMUST00000199517 1567 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm44889-203ENSMUST00000208346 1589 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 A930004J17Rik-201ENSMUST00000192689 4610 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Tgif1-211ENSMUST00000186358 1455 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Zfp760-201ENSMUST00000073312 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Igkv2-137-201ENSMUST00000103302 501 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Igkv18-36-201ENSMUST00000103373 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Rps12-ps7-201ENSMUST00000117169 385 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm14554-201ENSMUST00000119548 661 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Defa-ps10-201ENSMUST00000121649 171 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm12094-201ENSMUST00000121781 472 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 n-R5s48-201ENSMUST00000122482 110 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 1700025O08Rik-201ENSMUST00000123729 456 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 A230083N12Rik-201ENSMUST00000126646 572 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Pramef12os-201ENSMUST00000133334 767 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm15932-201ENSMUST00000135068 535 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Crem-222ENSMUST00000144496 978 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm15275-201ENSMUST00000154752 347 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm25180-201ENSMUST00000157746 115 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm25557-201ENSMUST00000158084 315 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm23773-201ENSMUST00000158985 296 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm44-201ENSMUST00000172155 993 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Mir3473c-201ENSMUST00000175262 81 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Dnah7c-201ENSMUST00000178395 612 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm2539-203ENSMUST00000181352 746 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Rian-203ENSMUST00000181527 989 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm27207-201ENSMUST00000184995 878 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm28739-201ENSMUST00000185415 696 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm28219-201ENSMUST00000185452 696 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm28542-201ENSMUST00000185545 696 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm28303-201ENSMUST00000185642 747 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm29244-201ENSMUST00000185825 696 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm29437-201ENSMUST00000185865 696 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm29412-201ENSMUST00000185869 696 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm28910-201ENSMUST00000185921 696 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm28812-201ENSMUST00000185963 696 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm29468-201ENSMUST00000185978 696 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm28854-201ENSMUST00000186218 696 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm28636-201ENSMUST00000186353 696 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm28452-201ENSMUST00000186623 696 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm29298-201ENSMUST00000186704 696 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm28185-201ENSMUST00000186815 694 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm28227-201ENSMUST00000186862 696 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm28796-201ENSMUST00000186905 696 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm29659-201ENSMUST00000187063 696 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm28473-201ENSMUST00000187325 696 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm28682-201ENSMUST00000187430 696 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm28738-201ENSMUST00000187480 696 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm28949-201ENSMUST00000187805 696 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm28773-201ENSMUST00000187925 696 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm29319-201ENSMUST00000188060 696 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm29422-201ENSMUST00000188062 694 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm28787-201ENSMUST00000188357 696 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm29312-201ENSMUST00000188724 696 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm29451-201ENSMUST00000188862 696 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm29637-201ENSMUST00000188877 696 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm29033-201ENSMUST00000189114 696 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Cd68-201ENSMUST00000018918 1230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm29614-201ENSMUST00000189263 694 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm28751-201ENSMUST00000189287 696 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm29559-201ENSMUST00000189412 696 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm28272-201ENSMUST00000189512 696 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm28483-201ENSMUST00000189519 696 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm28123-201ENSMUST00000189725 696 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm28368-201ENSMUST00000189804 696 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 1700074H08Rik-201ENSMUST00000189831 555 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm29119-201ENSMUST00000189973 696 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm28716-201ENSMUST00000190217 696 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm29239-201ENSMUST00000190304 696 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm28837-201ENSMUST00000190397 696 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm28531-201ENSMUST00000190529 696 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm28811-201ENSMUST00000190650 442 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm28165-201ENSMUST00000190669 694 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm29181-201ENSMUST00000191288 696 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Ighv5-21-201ENSMUST00000191935 295 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm37808-201ENSMUST00000192038 442 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms