Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 1700016G22Rik-202ENSMUST00000186843 594 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Gm29534-201ENSMUST00000187328 382 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Mrgprb9-ps-201ENSMUST00000188739 892 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Gm29605-201ENSMUST00000190800 292 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Gm35108-201ENSMUST00000194321 699 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Gm33191-201ENSMUST00000195604 699 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Gm43007-201ENSMUST00000197618 291 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Gm25617-202ENSMUST00000198387 132 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Gm36328-201ENSMUST00000204237 432 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Gm26911-202ENSMUST00000204244 763 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 AC122273.1-202ENSMUST00000213884 695 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 AC151843.1-201ENSMUST00000215960 691 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 CT030124.1-201ENSMUST00000217130 235 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Olfr1543-ps1-201ENSMUST00000217448 908 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Gm18940-201ENSMUST00000222518 871 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 AC055772.1-201ENSMUST00000222646 395 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Gm36607-201ENSMUST00000222750 1087 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 AC122309.1-201ENSMUST00000226945 421 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 CT025630.2-201ENSMUST00000228293 487 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Samt4-201ENSMUST00000026029 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 4930522N08Rik-201ENSMUST00000031274 916 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Olfr794-201ENSMUST00000059957 963 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Mbd3l1-201ENSMUST00000069218 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Olfr399-202ENSMUST00000215915 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Cd38-201ENSMUST00000030964 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Slc37a3-201ENSMUST00000090243 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Vmn1r-ps73-201ENSMUST00000173130 2120 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Cphx1-204ENSMUST00000184016 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Cep70-201ENSMUST00000093795 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Mrpl35-201ENSMUST00000065103 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 AC159886.2-201ENSMUST00000214737 2740 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Fras1-201ENSMUST00000036019 15848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Pcm1-204ENSMUST00000211247 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 4931406B18Rik-203ENSMUST00000163619 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Slc41a2-201ENSMUST00000039956 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Eml1-201ENSMUST00000054955 3879 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Exoc4-201ENSMUST00000052266 4824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Eif4e2-202ENSMUST00000076362 3394 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Cyhr1-202ENSMUST00000081291 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Blm-201ENSMUST00000081314 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 D330045A20Rik-201ENSMUST00000046763 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 AC154323.3-201ENSMUST00000226927 1660 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Usp40-201ENSMUST00000040783 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Trim16-201ENSMUST00000055006 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Nt5dc1-203ENSMUST00000105512 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Gm36380-201ENSMUST00000210339 4379 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Olfr622-204ENSMUST00000216570 2149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Trim40-201ENSMUST00000087158 2117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Stk26-202ENSMUST00000114887 3173 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Gm43613-201ENSMUST00000199409 1613 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Igkv11-125-201ENSMUST00000103311 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Ighv11-2-201ENSMUST00000103468 461 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Gm25379-201ENSMUST00000104338 114 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Olfr828-201ENSMUST00000104914 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Rps15a-201ENSMUST00000106588 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Gm9439-201ENSMUST00000119554 973 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Gm3835-201ENSMUST00000120752 403 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Olfr1027-ps1-201ENSMUST00000122338 875 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 1700025O08Rik-201ENSMUST00000123729 456 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Gm15787-206ENSMUST00000141008 585 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 1700021L23Rik-201ENSMUST00000153719 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Gm26183-201ENSMUST00000157685 139 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Gm16113-201ENSMUST00000159629 372 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Fam47e-207ENSMUST00000176621 746 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Gm16531-201ENSMUST00000180658 967 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Gm1972-201ENSMUST00000181606 964 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Mir378d-201ENSMUST00000184232 110 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Gm7804-202ENSMUST00000194187 854 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Gm43546-201ENSMUST00000196721 943 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Gm7285-201ENSMUST00000198801 580 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Trav15n-2-201ENSMUST00000199112 398 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Trav15d-2-dv6d-2-201ENSMUST00000199800 398 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Gm43228-201ENSMUST00000200735 264 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Gm42713-201ENSMUST00000202709 945 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Gm18995-201ENSMUST00000202981 520 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Gm45136-201ENSMUST00000205793 943 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Gm44839-201ENSMUST00000206590 241 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Gm44856-201ENSMUST00000206639 304 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 AC111044.1-201ENSMUST00000220206 555 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Gm2099-201ENSMUST00000220979 412 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Spata31-202ENSMUST00000221202 814 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 AC155270.1-202ENSMUST00000221503 352 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Gm7240-202ENSMUST00000221961 353 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 AC161275.1-201ENSMUST00000224668 208 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 AC122034.1-201ENSMUST00000227641 595 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 AC154618.2-201ENSMUST00000228299 452 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Apcs-201ENSMUST00000027824 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Ear6-201ENSMUST00000074477 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Ube2c-202ENSMUST00000088248 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Krtap31-1-201ENSMUST00000093935 973 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Gtsf1l-201ENSMUST00000094653 822 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Gm37570-201ENSMUST00000195411 3106 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Gm10637-202ENSMUST00000184702 3233 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Gm31805-201ENSMUST00000211921 4031 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Gm19031-201ENSMUST00000176280 1365 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 BC028471-203ENSMUST00000202022 4113 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Gm30340-201ENSMUST00000191898 2198 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Prdm10-205ENSMUST00000215847 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 St6galnac3-204ENSMUST00000200397 8169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Slc12a1-202ENSMUST00000110494 4740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms