Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm44837-201ENSMUST00000206863 717 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm45343-201ENSMUST00000210452 828 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm45473-201ENSMUST00000211452 616 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm45448-201ENSMUST00000211739 209 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm19116-201ENSMUST00000218592 642 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Aph1c-201ENSMUST00000057261 715 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Olfr1342-201ENSMUST00000060562 1002 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 A530021J07Rik-201ENSMUST00000066005 414 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Dock2-203ENSMUST00000101365 3785 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 9330178D15Rik-201ENSMUST00000196033 3451 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Atp8a2-201ENSMUST00000080368 12886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Olfr508-201ENSMUST00000072914 1635 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 4933430H16Rik-201ENSMUST00000209078 1319 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Trpm3-204ENSMUST00000099564 3653 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Vmn1r39-201ENSMUST00000226217 2258 ntAPPRIS P2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Vmn1r39-204ENSMUST00000227555 2297 ntAPPRIS P2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Vmn1r35-204ENSMUST00000227749 2254 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Vmn1r39-205ENSMUST00000228008 2283 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Golph3l-201ENSMUST00000060323 2652 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm26146-201ENSMUST00000104478 185 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm15765-201ENSMUST00000118407 910 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Olfr1004-ps1-201ENSMUST00000120361 580 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm12107-201ENSMUST00000132857 889 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm16062-201ENSMUST00000151825 771 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm3159-201ENSMUST00000164038 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm3127-201ENSMUST00000167839 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Mir5107-201ENSMUST00000175586 88 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Ccl27b-201ENSMUST00000177785 425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Raet1e-202ENSMUST00000178026 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm43390-201ENSMUST00000196614 421 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm43157-201ENSMUST00000198223 412 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm19653-201ENSMUST00000204326 1039 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Amd-ps6-201ENSMUST00000214455 1003 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm18863-201ENSMUST00000217004 1299 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Klrb1a-201ENSMUST00000032512 1274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Olfr267-201ENSMUST00000059608 944 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Raet1d-201ENSMUST00000095795 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Ap5m1-208ENSMUST00000228238 3514 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Rabgap1-203ENSMUST00000112920 4847 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm12703-201ENSMUST00000145411 2039 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Taf7-201ENSMUST00000066272 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 AC155243.1-201ENSMUST00000220141 2262 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 AC167013.5-201ENSMUST00000227597 2947 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm33326-201ENSMUST00000209741 3815 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Zbbx-204ENSMUST00000107778 2467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Olfr1179-202ENSMUST00000213157 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Dnajc13-203ENSMUST00000186788 6747 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Specc1-217ENSMUST00000202905 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 S100pbp-202ENSMUST00000072431 4059 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Qser1-201ENSMUST00000117237 8973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Hrh2-202ENSMUST00000209846 4074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm15366-201ENSMUST00000118433 1019 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Dnajc5b-203ENSMUST00000118968 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm15967-201ENSMUST00000120027 1116 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm15181-201ENSMUST00000120142 177 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm8722-201ENSMUST00000121466 769 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm15473-201ENSMUST00000140746 1179 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm8550-201ENSMUST00000161621 653 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Rasgrp3-202ENSMUST00000164192 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Tshb-203ENSMUST00000172026 604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm17096-201ENSMUST00000172037 733 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm24155-201ENSMUST00000175259 110 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm21560-202ENSMUST00000177670 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm3642-202ENSMUST00000179296 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Spata17-208ENSMUST00000184543 667 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm3544-201ENSMUST00000196129 305 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm43744-201ENSMUST00000196387 688 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm43434-201ENSMUST00000196615 676 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Olfr396-ps1-202ENSMUST00000205791 633 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Pttg1-202ENSMUST00000020687 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm45554-203ENSMUST00000211410 2137 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm20163-201ENSMUST00000212232 494 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm30933-201ENSMUST00000217174 381 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm7413-201ENSMUST00000219498 462 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Olfr779-202ENSMUST00000222301 929 ntAPPRIS P5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 AC133598.3-204ENSMUST00000224260 767 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Olfr1491-201ENSMUST00000052737 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm26442-201ENSMUST00000082588 153 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Rasgrp3-201ENSMUST00000095204 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm21985-201ENSMUST00000141047 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Il21-201ENSMUST00000029273 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Olfr619-202ENSMUST00000215732 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Eif2s3x-201ENSMUST00000050328 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Scn2a-202ENSMUST00000100067 8690 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm37721-202ENSMUST00000194673 1498 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm34121-201ENSMUST00000206188 1490 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm19093-201ENSMUST00000210671 1454 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Olfr286-201ENSMUST00000073612 3821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm20707-201ENSMUST00000176201 2516 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Osbpl9-213ENSMUST00000160271 2604 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Arhgap15-201ENSMUST00000055776 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Ddx58-201ENSMUST00000037907 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Prr14l-201ENSMUST00000120129 9959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm20356-201ENSMUST00000193390 2477 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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