Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Olfr726-207ENSMUST00000217319 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Top1mtQ8R4U6 Nuf2-202ENSMUST00000111368 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Top1mtQ8R4U6 Gm15425-201ENSMUST00000119013 2711 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Top1mtQ8R4U6 C530043A13Rik-203ENSMUST00000189247 3364 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Top1mtQ8R4U6 Olfr1340-203ENSMUST00000216242 3341 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Top1mtQ8R4U6 Serpinb5-203ENSMUST00000112730 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
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Top1mtQ8R4U6 Gsdmc-201ENSMUST00000110125 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
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Top1mtQ8R4U6 Gm10165-201ENSMUST00000217666 2380 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Top1mtQ8R4U6 Cntn4-204ENSMUST00000113260 2531 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Top1mtQ8R4U6 Kat7-202ENSMUST00000092766 3414 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Top1mtQ8R4U6 Gm43606-201ENSMUST00000195938 3556 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Top1mtQ8R4U6 Vmn1r77-202ENSMUST00000226525 8252 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
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Top1mtQ8R4U6 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
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Top1mtQ8R4U6 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Top1mtQ8R4U6 Gm43391-203ENSMUST00000198110 1001 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
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Top1mtQ8R4U6 Gm10032-201ENSMUST00000071522 1887 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
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Top1mtQ8R4U6 Ctla4-202ENSMUST00000097720 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
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Top1mtQ8R4U6 Catsperg2-209ENSMUST00000209126 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Top1mtQ8R4U6 C1d-201ENSMUST00000000594 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
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Top1mtQ8R4U6 Olfr453-202ENSMUST00000213997 3082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Top1mtQ8R4U6 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Top1mtQ8R4U6 Dlg2-204ENSMUST00000107196 7490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Top1mtQ8R4U6 Gbp3-203ENSMUST00000106222 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Top1mtQ8R4U6 Tdo2-204ENSMUST00000193879 1616 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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Top1mtQ8R4U6 Pum2-203ENSMUST00000111123 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Top1mtQ8R4U6 Gm44797-201ENSMUST00000208780 1837 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Top1mtQ8R4U6 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Top1mtQ8R4U6 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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Top1mtQ8R4U6 Ssxb2-201ENSMUST00000023931 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Top1mtQ8R4U6 Gkn3-201ENSMUST00000032127 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Top1mtQ8R4U6 Cd160-201ENSMUST00000047702 1121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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Top1mtQ8R4U6 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Top1mtQ8R4U6 AC116950.1-201ENSMUST00000226322 3250 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Top1mtQ8R4U6 Olfr1336-202ENSMUST00000214301 6882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Top1mtQ8R4U6 Tmem74-201ENSMUST00000067469 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Top1mtQ8R4U6 C530043A13Rik-202ENSMUST00000188155 1512 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Top1mtQ8R4U6 Olfr1170-202ENSMUST00000214386 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Top1mtQ8R4U6 Gm17477-201ENSMUST00000165458 2581 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
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