Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Clca3b-201ENSMUST00000159989 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Gm16344-201ENSMUST00000150084 1567 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Gm8267-203ENSMUST00000226900 1592 ntAPPRIS ALT2 BASIC6□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Gm17056-201ENSMUST00000164804 2299 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 AC155243.1-201ENSMUST00000220141 2262 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Rnf145-202ENSMUST00000101327 4214 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Olfr1333-202ENSMUST00000214477 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Plekhg1-201ENSMUST00000042438 7190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Olfr703-202ENSMUST00000216254 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Gm34639-201ENSMUST00000222648 2241 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Gm37775-201ENSMUST00000194120 2313 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Ogdh-201ENSMUST00000003461 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Olfr1423-202ENSMUST00000214472 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Kif27-201ENSMUST00000043605 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Serpina7-202ENSMUST00000060824 1895 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Kcnma1-201ENSMUST00000065788 4524 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Polk-201ENSMUST00000022172 4225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Ighv1-16-201ENSMUST00000103501 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Ighv1-24-201ENSMUST00000103509 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Olfr585-201ENSMUST00000104881 1030 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Olfr1196-201ENSMUST00000104892 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Myl2-202ENSMUST00000111750 729 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Gm11462-201ENSMUST00000117749 562 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Rps12-ps19-201ENSMUST00000119773 400 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Gm11761-201ENSMUST00000121392 445 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Gm15502-201ENSMUST00000121449 208 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Gm13480-201ENSMUST00000125095 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Gm14747-201ENSMUST00000149888 984 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Gm22820-201ENSMUST00000157205 329 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Gm26353-201ENSMUST00000158224 255 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 1810041H14Rik-202ENSMUST00000187218 434 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Ly6e-206ENSMUST00000187284 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Gm20561-201ENSMUST00000188131 292 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Gm29072-201ENSMUST00000191149 678 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Gm36994-201ENSMUST00000192941 492 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Gm19739-201ENSMUST00000195941 153 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Igkv4-83-201ENSMUST00000196933 334 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Gm43436-201ENSMUST00000199308 147 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 1700001N15Rik-201ENSMUST00000199380 482 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Mgam-206ENSMUST00000202779 3821 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 4833404L02Rik-201ENSMUST00000206290 908 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Gm45070-201ENSMUST00000208100 246 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Gm45405-201ENSMUST00000211544 609 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Gm18601-201ENSMUST00000220831 634 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 AC124537.2-201ENSMUST00000220872 883 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 AC164295.1-201ENSMUST00000224861 186 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 AC137902.1-201ENSMUST00000228184 102 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Olfr161-201ENSMUST00000061541 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Klra2-202ENSMUST00000088867 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Olfr275-201ENSMUST00000095085 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Prl2c3-201ENSMUST00000099805 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Olfr1197-201ENSMUST00000099815 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Slf1-201ENSMUST00000151524 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 AC153144.1-201ENSMUST00000221759 3139 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Map2-201ENSMUST00000024639 5195 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Cyp2j13-201ENSMUST00000030305 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Gm16794-201ENSMUST00000180727 2100 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Gm45297-201ENSMUST00000209893 3483 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Gm43887-201ENSMUST00000204727 3186 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Cntn3-202ENSMUST00000203619 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Trappc13-203ENSMUST00000141557 3502 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Olfr1392-203ENSMUST00000214170 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Olfr1392-205ENSMUST00000214598 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Il7r-201ENSMUST00000003981 3540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Gm42705-201ENSMUST00000200176 2465 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Zfp867-201ENSMUST00000057799 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Vmn1r181-203ENSMUST00000226978 4371 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Angptl1-202ENSMUST00000111720 1332 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Scaper-204ENSMUST00000216595 2911 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 A930006L05Rik-201ENSMUST00000186821 2814 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Dnah1-201ENSMUST00000048603 12872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Gm44215-201ENSMUST00000204910 2711 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Rapgef6-204ENSMUST00000108894 3475 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 1110059G10Rik-201ENSMUST00000035154 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Tlr5-202ENSMUST00000191820 3818 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 4922502D21Rik-201ENSMUST00000051283 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Unc13c-201ENSMUST00000075245 6633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 9330175M20Rik-201ENSMUST00000189867 2552 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Slamf7-202ENSMUST00000192024 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Them5-202ENSMUST00000198083 1378 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Ogdh-202ENSMUST00000081894 4114 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 4933400A11Rik-203ENSMUST00000112102 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Gm12931-201ENSMUST00000117046 324 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Gm9506-201ENSMUST00000118516 320 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Gm11318-201ENSMUST00000118640 961 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Rpl5-ps2-201ENSMUST00000119057 891 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Gm15621-201ENSMUST00000119162 364 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Mir1900-201ENSMUST00000122714 78 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Gm12506-201ENSMUST00000123620 806 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Gm14092-201ENSMUST00000136794 617 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Gm13211-201ENSMUST00000141649 697 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Gm25904-201ENSMUST00000158491 143 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Gm22428-201ENSMUST00000158554 132 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Gm24735-201ENSMUST00000158859 118 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Gm16231-201ENSMUST00000160432 319 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hpf1Q8CFE2 Igkv4-53-201ENSMUST00000166380 292 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms